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Ⅱ型NADH脱氢酶NDH2的结构与功能研究

摘要第3-4页
Abstract第4页
主要符号对照表第9-11页
第1章 引言第11-34页
    1.1 电子传递链第11-13页
        1.1.1 真核生物的电子传递链第11-12页
        1.1.2 原核生物的电子传递链第12-13页
    1.2 N ADH脱氢酶及其分类第13-15页
        1.2.1 复合物I第13-14页
        1.2.2 N qr第14页
        1.2.3 N DH2第14-15页
    1.3 N DH2的研究现状第15-18页
        1.3.1 N DH2的分类第15-16页
        1.3.2 N DH2的生理意义第16-17页
        1.3.3 N DH2蛋白结构的研究第17-18页
    1.4 酵母的N DH2蛋白——N di1第18-22页
        1.4.1 N di1作为基因治疗手段第18-20页
        1.4.2 N di1的酶反应机制第20-22页
    1.5 病原微生物与N DH2第22-24页
    1.6 肺结核及结核分枝杆菌第24-29页
        1.6.1 肺结核现状第24-27页
        1.6.2 结核分枝杆菌第27页
        1.6.3 抗结核药物及其靶点第27-29页
    1.7 结核分枝杆菌呼吸链及其N DH2第29-33页
        1.7.1 结核分枝杆菌的呼吸链第29-30页
        1.7.2 Mtb N DH2是无氧条件下起始呼吸链的关键蛋白第30-31页
        1.7.3 Mtb N DH2与异烟肼和乙醇胺耐受有关第31-32页
        1.7.4 Mtb N DH2抑制剂有抗TB作用第32-33页
    1.8 潜在药物靶点—— N DH2第33-34页
第2章 实验材料与方法第34-58页
    2.1 实验仪器第34-36页
    2.2 实验试剂第36-43页
        2.2.1 实验用菌株第36-37页
        2.2.2 基因及菌株获取途径第37页
        2.2.3 表达载体的选择第37-38页
        2.2.4 实验常用培基第38-41页
        2.2.5 常用储液及缓冲液第41-43页
        2.2.6 常用试剂盒第43页
    2.3 实验方法第43-58页
        2.3.1 分子克隆第43-46页
        2.3.2 蛋白表达第46-47页
        2.3.3 蛋白纯化第47-50页
        2.3.4 蛋白结晶及优化第50-52页
        2.3.5 蛋白与底物复合物的结晶第52页
        2.3.6 数据收集及相位问题第52-54页
        2.3.7 酶活测定第54-55页
        2.3.8 酵母实验第55-56页
        2.3.9 电子顺磁共振实验第56-57页
        2.3.10结核分枝杆菌生长抑制实验第57-58页
第3章 酵母Ndi1蛋白的纯化及结晶第58-76页
    3.1 本章引论第58页
    3.2 蛋白的基本信息分析第58-60页
    3.3 蛋白的表达纯化第60-65页
        3.3.1 克隆构建第60页
        3.3.2 蛋白的表达第60-61页
        3.3.3 蛋白的纯化第61-63页
        3.3.4 突变体蛋白的纯化第63-65页
    3.4 N di1蛋白晶体的筛选及优化第65-73页
        3.4.1 晶体的初筛选尝试第66-67页
        3.4.2 基于TritonX- 100分子的晶体筛选第67-69页
        3.4.3 N di1蛋白晶体的优化第69-72页
        3.4.4 N di1硒代蛋白晶体第72页
        3.4.5 N di1蛋白与底物的复合物晶体第72-73页
    3.5 衍射数据的收集和处理第73-75页
    3.6 小结第75-76页
第4章 酵母Ndi1蛋白的结构与生化研究第76-99页
    4.1 本章引论第76页
    4.2 N di1蛋白的晶体结构第76-92页
        4.2.1 N di1蛋白的整体结构第76-78页
        4.2.2 TritonX- 100在蛋白中的结合位置第78页
        4.2.3 高度保守的C端结构域第78-79页
        4.2.4 C端结构域介导N di1蛋白的二聚化第79-83页
        4.2.5 C端结构域介导N di1蛋白的膜锚定第83-86页
        4.2.6 N di1蛋白及其底物第86-92页
    4.3 N di1蛋白的电子传递机制第92-98页
        4.3.1 N di1-N ADH-Q的复合物结构第93-94页
        4.3.2 与Pdr- Pdx复合物的结构比对第94-95页
        4.3.3 N di1蛋白中可能的电子传递路径第95页
        4.3.4 电子顺磁共振实验检测半醌自由基第95-96页
        4.3.5 功率饱和实验检测存在两种半醌自由基第96-98页
    4.4 本章小结第98-99页
第5章 结核分枝杆菌及其他病原微生物NDH2的研究第99-127页
    5.1 本章引论第99页
    5.2 结核分枝杆菌N DH2的表达纯化第99-108页
        5.2.1 二级结构预测及克隆构建第99-100页
        5.2.2 蛋白表达第100-102页
        5.2.3 蛋白纯化第102-107页
        5.2.4 晶体的筛选第107-108页
    5.3 体外药物筛选第108-113页
        5.3.1 体外检测蛋白活性第108-109页
        5.3.2 抑制剂筛选第109-111页
        5.3.3 IC50检测第111页
        5.3.4 结核分枝杆菌生长抑制实验第111-113页
    5.4 其他物种N DH2的研究第113-125页
        5.4.1 耻垢分枝杆菌N DH2第114-116页
        5.4.2 无乳链球菌N DH2第116-119页
        5.4.3 恶性疟原虫N DH2第119-122页
        5.4.4 其他物种N DH2第122-125页
    5.5 小结第125-127页
第6章 讨论与展望第127-137页
    6.1 本章引论第127页
    6.2 酵母N di1蛋白第127-131页
        6.2.1 C端结构域第127-129页
        6.2.2 N di1蛋白的电子传递第129-131页
    6.3 Mtb等病原微生物N DH2蛋白的研究第131-132页
        6.3.1 M.sm eg与Mtb N DH2蛋白第131-132页
        6.3.2 其他病原微生物的N DH2蛋白第132页
    6.4 展望第132-137页
        6.4.1 N di1蛋白存在的问题第133-134页
        6.4.2 病原微生物N DH2蛋白的结构第134-135页
        6.4.3 病原微生物N DH2蛋白抑制剂的筛选与优化第135-136页
        6.4.4 抑制剂的体内实验第136-137页
参考文献第137-148页
致谢第148-151页
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果第151页

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