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基于转录组测序的平欧杂种榛S位点相关基因的克隆与表达分析

摘要第7-9页
Abstract第9-11页
第一章 文献综述第12-20页
    1.1 榛属植物概述第12页
    1.2 植物自交不亲和性研究进展第12-16页
        1.2.1 配子体型自交不亲和第12-13页
        1.2.2 孢子体型自交不亲和第13-15页
        1.2.3 榛属植物的亲和性研究进展第15-16页
    1.3 转录组测序技术第16-17页
    1.4 实时荧光定量PCR技术与内参基因的筛选第17-18页
        1.4.1 实时荧光定量PCR技术第17-18页
        1.4.2 内参基因的筛选第18页
    1.5 SMARTer? RACE技术第18-20页
第二章 引言第20-22页
    2.1 研究目的和意义第20-21页
    2.2 技术路线第21-22页
第三章 平欧杂种榛不同亲和性组合授粉前后雌蕊的转录组学分析第22-40页
    3.1 材料第22-23页
    3.2 方法第23-24页
        3.2.1 转录组测序第23页
        3.2.2 转录组数据统计分析第23-24页
        3.2.3 平欧杂种榛中自交不亲和相关基因的分析和筛选第24页
    3.3 结果与分析第24-37页
        3.3.1 产量统计与序列组装第24-26页
        3.3.2 Unigene功能注释第26-29页
        3.3.3 Unigene表达差异分析第29-33页
        3.3.4 平欧杂种榛自交不亲和相关基因的鉴定第33-37页
    3.4 讨论第37-40页
第四章 平欧杂种榛RT-qPCR内参基因的筛选与鉴定第40-56页
    4.1 材料第40-41页
    4.2 方法第41-44页
        4.2.1 候选内参基因的选取和引物设计第41-43页
        4.2.2 RNA提取和cDNA合成第43页
        4.2.3 反转录PCR和荧光定量PCR第43-44页
        4.2.4 引物评价第44页
        4.2.5 稳定内参基因的验证第44页
        4.2.6 数据处理与分析第44页
    4.3 结果与分析第44-54页
        4.3.1 候选内参基因的确定与引物特异性和扩增效率分析第44-46页
        4.3.2 候选内参基因表达谱分析第46-48页
        4.3.3 候选内参基因的稳定性分析第48-53页
        4.3.4 稳定内参基因的验证分析第53-54页
    4.4 讨论第54-56页
第五章 平欧杂种榛S位点相关基因的克隆与分析第56-84页
    5.1 材料第56页
    5.2 方法第56-61页
        5.2.1 RNA提取与cDNA合成第56页
        5.2.2 RACE扩增与测序第56-58页
        5.2.3 ORF扩增与测序第58-59页
        5.2.4 生物信息学分析第59-60页
        5.2.5 反转录PCR和荧光定量PCR第60-61页
    5.3 结果与分析第61-82页
        5.3.1 ChaTHL1/ChaTHL2基因的克隆与序列特征第61-65页
        5.3.2 ChaMLPK基因的克隆与序列特征第65-67页
        5.3.3 ChaARC1基因的克隆与序列特征第67-70页
        5.3.4 ChaExo70A1基因的克隆与序列特征第70-72页
        5.3.5 ChaMOD1/ChaMOD2基因的克隆与序列特征第72-76页
        5.3.6 ChaKAPP基因的克隆与序列特征第76-79页
        5.3.7 平欧杂种榛S位点相关基因的表达分析第79-82页
    5.4 讨论第82-84页
第六章 结论与展望第84-86页
    6.1 平欧杂种榛转录组测序第84页
    6.2 平欧杂种榛RT-qPCR内参基因的筛选与鉴定第84页
    6.3 平欧杂种榛S位点相关基因的克隆与分析第84-85页
    6.4 展望第85-86页
参考文献第86-96页
致谢第96-98页
在读期间(拟)发表的学术论文与参与的科研项目第98页

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