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甜菜抗线虫基因Hs1-2鉴定及禾谷孢囊线虫RNAi致死基因功能分析

摘要第6-7页
abstract第7页
英文缩略表第12-13页
第一章 引言第13-29页
    1.1 甜菜基本特征与分布范围第13页
    1.2 甜菜染色体与基因组研究第13-17页
        1.2.1 甜菜遗传图谱分析第14-15页
        1.2.2 甜菜孢囊线虫抗病易位系第15-16页
        1.2.3 甜菜基因组及转录组研究第16-17页
    1.3 甜菜孢囊线虫第17-20页
        1.3.1 甜菜孢囊线虫的致病型与寄主范围第18页
        1.3.2 甜菜孢囊线虫形态特征及生活史第18-20页
        1.3.3 甜菜孢囊线虫的危害与防控第20页
    1.4 植物与线虫互作研究进展第20-27页
        1.4.1 植物对线虫的免疫反应第21-22页
        1.4.2 线虫抗病基因第22-24页
        1.4.3 植物激素在植物线虫互作中的作用第24-25页
        1.4.4 线虫调控及抑制植物免疫反应第25-26页
        1.4.5 非编码small RNA在线虫与宿主互作中的作用第26-27页
    1.5 植物发根体系在抗病基因功能验证中的应用第27-28页
    1.6 本研究的目的和意义第28-29页
        1.6.1 本研究的目的第28页
        1.6.2 本研究的意义第28-29页
第二章 甜菜孢囊线虫抗病基因Hs1-2 位点的定位分析与基因预测第29-45页
    2.1 材料与方法第29-36页
        2.1.1 供试植物材料第29-30页
        2.1.2 供试线虫材料第30页
        2.1.3 主要试剂仪器和耗材第30页
        2.1.4 DNA提取方法第30-31页
        2.1.5 易位系的分子标记分析第31页
        2.1.6 全基因组测序第31-32页
        2.1.7 RNA提取及测序第32-33页
        2.1.8 测序数据纯化与处理第33-35页
        2.1.9 Hs1-2 位点基因的预测与功能注释第35页
        2.1.10 Hs1-2 位点基因ORF全长克隆及基因结构分析第35-36页
    2.2 结果与分析第36-42页
        2.2.1 易位系分子标记分析第36-37页
        2.2.2 测序结果分析第37-38页
        2.2.3 Hs1-2 位点物理图谱分析第38-39页
        2.2.4 易位片段的结构分析第39-40页
        2.2.5 Hs1-2 位点BCN抗病候选基因筛选第40-42页
        2.2.6 Hs1-2 位点基因ORF全长克隆及基因结构分析第42页
    2.3 小结与讨论第42-45页
第三章 Hs1-2 位点基因的表达分析第45-54页
    3.1 材料与方法第45-49页
        3.1.1 供试植物材料第45页
        3.1.2 供试线虫材料第45页
        3.1.3 主要试剂与耗材第45-46页
        3.1.4 主要仪器第46页
        3.1.5 RNA提取及cDNA合成第46页
        3.1.6 应用RT-PCR在抗感株系中对预测基因进行表达分析第46-47页
        3.1.7 应用RT-qPCR进行线虫接种前后基因表达差异分析第47-49页
    3.2 结果与分析第49-52页
        3.2.1 应用RT-PCR在抗感株系中对预测基因进行表达分析第49-50页
        3.2.2 应用RT-qPCR进行线虫接种前后基因表达差异分析第50-52页
    3.3 小结与讨论第52-54页
第四章 利用甜菜发根体系通过RNAi验证Hs1-2 候选基因功能第54-69页
    4.1 试验材料和方法第54-61页
        4.1.1 供试植物材料第54页
        4.1.2 供试线虫材料第54页
        4.1.3 主要试剂和耗材第54-56页
        4.1.4 主要仪器第56页
        4.1.5 DNA提取方法易位系的分子标记分析第56页
        4.1.6 RNA的提取及cDNA的合成第56页
        4.1.7 载体构建第56-58页
        4.1.8 将双元载体转入发根农杆菌中第58-59页
        4.1.9 发根转化与阳性克隆的筛选第59-60页
        4.1.10 线虫抗性鉴定第60-61页
    4.2 结果与分析第61-67页
        4.2.1 RNAi载体的构建第61页
        4.2.2 发根转化第61-62页
        4.2.3 卡那霉素抗性筛选第62-64页
        4.2.4 DsRed荧光筛选分析第64页
        4.2.5 发根的PCR检测结果第64-65页
        4.2.6 转基因的发根中靶基因的表达分析第65-66页
        4.2.7 线虫接种实验第66-67页
    4.3 小结与讨论第67-69页
第五章 禾谷孢囊线虫FAR基因及致死候选基因功能验证第69-82页
    5.1 试验材料和方法第69-76页
        5.1.1 供试植物材料第69-70页
        5.1.2 供试线虫材料第70页
        5.1.3 主要试剂和耗材第70页
        5.1.4 主要仪器第70页
        5.1.5 总RNA的提取和cDNA第一链的合成第70-71页
        5.1.6 DsRNA干扰片段的合成第71-73页
        5.1.7 DsRNA浸泡小麦禾谷孢囊线虫二龄幼虫第73页
        5.1.8 定量RT-qPCR检测Ha-far-1,Ha-far-2 的发育表达及dsRNA处理后基因的转录丰度第73-75页
        5.1.9 接种实验第75页
        5.1.10 小麦根组织内线虫染色第75-76页
        5.1.11 Ha-far-1,Ha-far-2 的进化树分析第76页
    5.2 结果与分析第76-80页
        5.2.1 DsRNA的合成效果第76页
        5.2.2 二龄幼虫吞咽效果第76-77页
        5.2.3 DsRNA处理后Ha-far-1,Ha-far-2 及致死候选基因的转录丰度检测第77页
        5.2.4 禾谷孢囊线虫Ha-far-1,Ha-far-2 基因的发育表达结果第77-78页
        5.2.5 活体外介导的RNAi处理对线虫侵染能力的影响第78-79页
        5.2.6 活体外介导的RNAi对线虫发育的影响第79页
        5.2.7 线虫FAR蛋白的进化树分析第79-80页
    5.3 小结与讨论第80-82页
第六章 全文总结第82-83页
参考文献第83-101页
附录第101-102页
致谢第102-103页
作者简介第103页

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