摘要 | 第6-7页 |
abstract | 第7页 |
英文缩略表 | 第12-13页 |
第一章 引言 | 第13-29页 |
1.1 甜菜基本特征与分布范围 | 第13页 |
1.2 甜菜染色体与基因组研究 | 第13-17页 |
1.2.1 甜菜遗传图谱分析 | 第14-15页 |
1.2.2 甜菜孢囊线虫抗病易位系 | 第15-16页 |
1.2.3 甜菜基因组及转录组研究 | 第16-17页 |
1.3 甜菜孢囊线虫 | 第17-20页 |
1.3.1 甜菜孢囊线虫的致病型与寄主范围 | 第18页 |
1.3.2 甜菜孢囊线虫形态特征及生活史 | 第18-20页 |
1.3.3 甜菜孢囊线虫的危害与防控 | 第20页 |
1.4 植物与线虫互作研究进展 | 第20-27页 |
1.4.1 植物对线虫的免疫反应 | 第21-22页 |
1.4.2 线虫抗病基因 | 第22-24页 |
1.4.3 植物激素在植物线虫互作中的作用 | 第24-25页 |
1.4.4 线虫调控及抑制植物免疫反应 | 第25-26页 |
1.4.5 非编码small RNA在线虫与宿主互作中的作用 | 第26-27页 |
1.5 植物发根体系在抗病基因功能验证中的应用 | 第27-28页 |
1.6 本研究的目的和意义 | 第28-29页 |
1.6.1 本研究的目的 | 第28页 |
1.6.2 本研究的意义 | 第28-29页 |
第二章 甜菜孢囊线虫抗病基因Hs1-2 位点的定位分析与基因预测 | 第29-45页 |
2.1 材料与方法 | 第29-36页 |
2.1.1 供试植物材料 | 第29-30页 |
2.1.2 供试线虫材料 | 第30页 |
2.1.3 主要试剂仪器和耗材 | 第30页 |
2.1.4 DNA提取方法 | 第30-31页 |
2.1.5 易位系的分子标记分析 | 第31页 |
2.1.6 全基因组测序 | 第31-32页 |
2.1.7 RNA提取及测序 | 第32-33页 |
2.1.8 测序数据纯化与处理 | 第33-35页 |
2.1.9 Hs1-2 位点基因的预测与功能注释 | 第35页 |
2.1.10 Hs1-2 位点基因ORF全长克隆及基因结构分析 | 第35-36页 |
2.2 结果与分析 | 第36-42页 |
2.2.1 易位系分子标记分析 | 第36-37页 |
2.2.2 测序结果分析 | 第37-38页 |
2.2.3 Hs1-2 位点物理图谱分析 | 第38-39页 |
2.2.4 易位片段的结构分析 | 第39-40页 |
2.2.5 Hs1-2 位点BCN抗病候选基因筛选 | 第40-42页 |
2.2.6 Hs1-2 位点基因ORF全长克隆及基因结构分析 | 第42页 |
2.3 小结与讨论 | 第42-45页 |
第三章 Hs1-2 位点基因的表达分析 | 第45-54页 |
3.1 材料与方法 | 第45-49页 |
3.1.1 供试植物材料 | 第45页 |
3.1.2 供试线虫材料 | 第45页 |
3.1.3 主要试剂与耗材 | 第45-46页 |
3.1.4 主要仪器 | 第46页 |
3.1.5 RNA提取及cDNA合成 | 第46页 |
3.1.6 应用RT-PCR在抗感株系中对预测基因进行表达分析 | 第46-47页 |
3.1.7 应用RT-qPCR进行线虫接种前后基因表达差异分析 | 第47-49页 |
3.2 结果与分析 | 第49-52页 |
3.2.1 应用RT-PCR在抗感株系中对预测基因进行表达分析 | 第49-50页 |
3.2.2 应用RT-qPCR进行线虫接种前后基因表达差异分析 | 第50-52页 |
3.3 小结与讨论 | 第52-54页 |
第四章 利用甜菜发根体系通过RNAi验证Hs1-2 候选基因功能 | 第54-69页 |
4.1 试验材料和方法 | 第54-61页 |
4.1.1 供试植物材料 | 第54页 |
4.1.2 供试线虫材料 | 第54页 |
4.1.3 主要试剂和耗材 | 第54-56页 |
4.1.4 主要仪器 | 第56页 |
4.1.5 DNA提取方法易位系的分子标记分析 | 第56页 |
4.1.6 RNA的提取及cDNA的合成 | 第56页 |
4.1.7 载体构建 | 第56-58页 |
4.1.8 将双元载体转入发根农杆菌中 | 第58-59页 |
4.1.9 发根转化与阳性克隆的筛选 | 第59-60页 |
4.1.10 线虫抗性鉴定 | 第60-61页 |
4.2 结果与分析 | 第61-67页 |
4.2.1 RNAi载体的构建 | 第61页 |
4.2.2 发根转化 | 第61-62页 |
4.2.3 卡那霉素抗性筛选 | 第62-64页 |
4.2.4 DsRed荧光筛选分析 | 第64页 |
4.2.5 发根的PCR检测结果 | 第64-65页 |
4.2.6 转基因的发根中靶基因的表达分析 | 第65-66页 |
4.2.7 线虫接种实验 | 第66-67页 |
4.3 小结与讨论 | 第67-69页 |
第五章 禾谷孢囊线虫FAR基因及致死候选基因功能验证 | 第69-82页 |
5.1 试验材料和方法 | 第69-76页 |
5.1.1 供试植物材料 | 第69-70页 |
5.1.2 供试线虫材料 | 第70页 |
5.1.3 主要试剂和耗材 | 第70页 |
5.1.4 主要仪器 | 第70页 |
5.1.5 总RNA的提取和cDNA第一链的合成 | 第70-71页 |
5.1.6 DsRNA干扰片段的合成 | 第71-73页 |
5.1.7 DsRNA浸泡小麦禾谷孢囊线虫二龄幼虫 | 第73页 |
5.1.8 定量RT-qPCR检测Ha-far-1,Ha-far-2 的发育表达及dsRNA处理后基因的转录丰度 | 第73-75页 |
5.1.9 接种实验 | 第75页 |
5.1.10 小麦根组织内线虫染色 | 第75-76页 |
5.1.11 Ha-far-1,Ha-far-2 的进化树分析 | 第76页 |
5.2 结果与分析 | 第76-80页 |
5.2.1 DsRNA的合成效果 | 第76页 |
5.2.2 二龄幼虫吞咽效果 | 第76-77页 |
5.2.3 DsRNA处理后Ha-far-1,Ha-far-2 及致死候选基因的转录丰度检测 | 第77页 |
5.2.4 禾谷孢囊线虫Ha-far-1,Ha-far-2 基因的发育表达结果 | 第77-78页 |
5.2.5 活体外介导的RNAi处理对线虫侵染能力的影响 | 第78-79页 |
5.2.6 活体外介导的RNAi对线虫发育的影响 | 第79页 |
5.2.7 线虫FAR蛋白的进化树分析 | 第79-80页 |
5.3 小结与讨论 | 第80-82页 |
第六章 全文总结 | 第82-83页 |
参考文献 | 第83-101页 |
附录 | 第101-102页 |
致谢 | 第102-103页 |
作者简介 | 第103页 |