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基于红腹锦鸡基因组、转录组测序的羽毛色素调控机制研究

摘要第5-8页
ABSTRACT第8-11页
第一章 文献综述第15-40页
    1.1 红腹锦鸡生物学研究概述第15-19页
        1.1.1 基本情况第15页
        1.1.2 生物学研究现状第15-18页
        1.1.3 研究意义第18-19页
    1.2 鸟类羽毛色素的合成机理与调控机制第19-30页
        1.2.1 黑色素第19-26页
        1.2.2 类胡萝卜素第26-29页
        1.2.3 展望第29-30页
    1.3 全基因组测序的基本策略及鸟类基因组研究进展第30-40页
        1.3.1 DNA测序及其发展第30-33页
        1.3.2 序列的组装第33-34页
        1.3.3 序列的注释第34-35页
        1.3.4 基因组与生物进化及鸟类基因组研究进展第35-40页
第二章 红腹锦鸡全基因组测序第40-59页
    前言第40-41页
    2.1 材料和方法第41-45页
        2.1.1 材料第41页
        2.1.2 方法第41-45页
    2.2 结果第45-55页
        2.2.1 红腹锦鸡全基因组测序及组装第45-46页
        2.2.2 红腹锦鸡基因组注释第46-48页
        2.2.3 红腹锦鸡基因组的演化第48-55页
    2.3 讨论第55-58页
    小结第58-59页
第三章 红腹锦鸡与白腹锦鸡羽毛色素的分离鉴定第59-72页
    前言第59-61页
    3.1 材料和方法第61-64页
        3.1.1 材料第61页
        3.1.2 方法第61-64页
    3.2 结果第64-70页
        3.2.1 红腹锦鸡的羽毛颜色第64-65页
        3.2.2 拉曼光谱分析第65-67页
        3.2.3 脂溶性色素分析第67页
        3.2.4 高效液相色谱分析第67-70页
    3.3 讨论第70-71页
    小结第71-72页
第四章 利用锦鸡羽毛转录组筛选色素相关基因第72-98页
    前言第72-73页
    4.1 材料和方法第73-78页
        4.1.1 材料第73-74页
        4.1.2 方法第74-78页
    4.2 结果第78-95页
        4.2.1 数据描述第78-82页
        4.2.2 红腹锦鸡与白腹锦鸡对应羽区差异基因的分析及富集第82-85页
        4.2.3 红腹锦鸡与白腹锦鸡羽色差异表达基因筛选第85-95页
    4.3 讨论第95-97页
    小结第97-98页
结论第98页
参考文献第98-120页
附录第120-125页
致谢第125-127页
攻读学位期间发表的学术论文第127页

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