| 前言 | 第4-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 主要缩略词 | 第10-13页 |
| 第一章 绪论-减数分裂中突变和同源重组的研究现状 | 第13-52页 |
| 1.1.引言 | 第13-15页 |
| 1.2. 突变相关研究 | 第15-25页 |
| 1.2.1. 突变类型及分子机制 | 第15-19页 |
| 1.2.2. 突变的影响因素 | 第19-22页 |
| 1.2.3. 不同生物中突变的研究 | 第22-25页 |
| 1.3. 同源重组相关研究 | 第25-39页 |
| 1.3.1. 同源重组的分子机制 | 第25-31页 |
| 1.3.2. 同源重组的影响因素 | 第31-35页 |
| 1.3.3. 不同生物中同源重组的研究现状 | 第35-39页 |
| 1.4. 重组及突变相关研究方法概述 | 第39-46页 |
| 1.4.1. 依据表型数据推断 | 第39-41页 |
| 1.4.2. 分子标记与基因组芯片技术的应用 | 第41-42页 |
| 1.4.3. 全基因组测序技术的应用 | 第42-46页 |
| 1.5. 重组和突变的生物学意义 | 第46-49页 |
| 1.5.1. 重组的生物学意义 | 第46-48页 |
| 1.5.2. 突变的生物学意义 | 第48页 |
| 1.5.3. 重组和突变与基因组演化 | 第48-49页 |
| 1.6. 本研究的背景、目的和意义 | 第49-52页 |
| 第二章 利用亲本-子代测序的遗传设计来研究多年生木本桃树的突变事件 | 第52-72页 |
| 2.1 引言 | 第52-53页 |
| 2.2 材料与方法 | 第53-62页 |
| 2.2.1 桃树不同组合方案设计 | 第53页 |
| 2.2.2 样品准备 | 第53-56页 |
| 2.2.3 DNA提取与测序 | 第56-58页 |
| 2.2.4 突变事件检测 | 第58-60页 |
| 2.2.5 突变率评估 | 第60-61页 |
| 2.2.6 基因组杂合率评估 | 第61页 |
| 2.2.7 统计学分析 | 第61-62页 |
| 2.3 结果 | 第62-69页 |
| 2.3.1 突变结果与评估 | 第62-64页 |
| 2.3.2 突变性质与分布规律 | 第64-66页 |
| 2.3.3 不同杂交组合突变率的比较 | 第66-69页 |
| 2.4 讨论 | 第69-70页 |
| 2.4.1 遗传设计优势 | 第69页 |
| 2.4.2 选用桃树作为研究对象的优势 | 第69-70页 |
| 2.4.3 杂交或者杂合度对突变率的影响 | 第70页 |
| 2.5 小结 | 第70-72页 |
| 第三章 利用亲本-子代测序的遗传设计来研究多年生木本桃树的同源重组事件 | 第72-88页 |
| 3.1 引言 | 第72-73页 |
| 3.2 材料与方法 | 第73-76页 |
| 3.2.1 桃树不同组合的遗传设计及实验测序 | 第73页 |
| 3.2.2 遗传分子标记的筛选和变异位点检测 | 第73-74页 |
| 3.2.3 交叉互换事件的鉴定 | 第74-76页 |
| 3.2.4 重组冷热点分析 | 第76页 |
| 3.3 结果 | 第76-85页 |
| 3.3.1 遗传标记的准确筛选 | 第76-77页 |
| 3.3.2 桃全基因组重组率的评估 | 第77-80页 |
| 3.3.3 桃重组的相关性质 | 第80-85页 |
| 3.4 讨论 | 第85-86页 |
| 3.4.1 桃树种内与种间的重组分布规律 | 第85-86页 |
| 3.4.2 重组与驯化 | 第86页 |
| 3.5 小结 | 第86-88页 |
| 第四章 桃减数分裂突变和重组与一年生植物拟南芥的比较 | 第88-105页 |
| 4.1 引言 | 第88-89页 |
| 4.2 材料与方法 | 第89-95页 |
| 4.2.1 拟南芥材料的来源和遗传设计 | 第89-92页 |
| 4.2.2 拟南芥中亲本和子代样本的二代测序 | 第92页 |
| 4.2.3 拟南芥中序列拼装及处理 | 第92-93页 |
| 4.2.4 拟南芥中遗传分子标记的筛选 | 第93-94页 |
| 4.2.5 拟南芥中同源重组事件的鉴定 | 第94页 |
| 4.2.6 桃树重组与突变关系的检验 | 第94-95页 |
| 4.3 结果 | 第95-100页 |
| 4.3.1 拟南芥测序结果与分子标记的筛选 | 第95-96页 |
| 4.3.2 拟南芥一次减数分裂中交叉互换的分析 | 第96-97页 |
| 4.3.3 拟南芥一次减数分裂中基因转换的分析 | 第97-99页 |
| 4.3.4 桃树重组和突变的相关性检验 | 第99-100页 |
| 4.4 讨论 | 第100-104页 |
| 4.4.1 拟南芥与桃树重组检测方法与结果比较 | 第100-102页 |
| 4.4.2 桃树突变率与拟南芥突变率的比较 | 第102-103页 |
| 4.4.3 桃树重组与拟南芥重组的比较 | 第103页 |
| 4.4.4 重组和突变 | 第103-104页 |
| 4.5 小结 | 第104-105页 |
| 全文结论 | 第105-106页 |
| 致谢 | 第106-107页 |
| 已发表和待发表的研究论文 | 第107-108页 |
| 参考文献 | 第108-126页 |
| 附表A | 第126-167页 |
| 致谢 | 第167-168页 |
