| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-20页 |
| 1.1 玉米与干旱胁迫 | 第10-11页 |
| 1.2 基因芯片与转录组测序分析 | 第11-14页 |
| 1.2.1 基因芯片 | 第12页 |
| 1.2.2 RNA-seq | 第12-14页 |
| 1.2.2.1 共表达分析 | 第13-14页 |
| 1.2.2.2 转录因子 | 第14页 |
| 1.3 WRKY转录因子 | 第14-18页 |
| 1.3.1 WRKY转录因子参与植物发育 | 第16页 |
| 1.3.2 WRKY转录因子参与植物生物胁迫 | 第16-17页 |
| 1.3.3 WRKY转录因子参与植物非生物胁迫 | 第17-18页 |
| 1.4 研究的目的与意义 | 第18-20页 |
| 第二章 干旱条件下玉米中差异表达基因的系统性分析 | 第20-32页 |
| 2.1 前言 | 第20页 |
| 2.2 材料与方法 | 第20-22页 |
| 2.2.1 数据的收集和处理 | 第20页 |
| 2.2.2 与参考基因组的比对和组装 | 第20-21页 |
| 2.2.3 主成分分析和层次聚类 | 第21页 |
| 2.2.4 差异表达基因分析 | 第21页 |
| 2.2.5 共表达网络的构建 | 第21页 |
| 2.2.6 功能富集分析 | 第21页 |
| 2.2.7 枢纽基因的鉴定 | 第21页 |
| 2.2.8 枢纽基因在玉米进化中的关系 | 第21-22页 |
| 2.3 结果 | 第22-31页 |
| 2.3.1 不同样品的基因表达情况 | 第22-23页 |
| 2.3.2 共表达网络构建与分析 | 第23-25页 |
| 2.3.3 网络中枢纽基因的鉴定 | 第25-27页 |
| 2.3.4 枢纽基因中的复制情况 | 第27-29页 |
| 2.3.5 玉米干旱胁迫下的转录调控网络 | 第29-31页 |
| 2.4 讨论 | 第31-32页 |
| 2.4.1 玉米不同组织发育时期下基因表达的分化 | 第31页 |
| 2.4.2 共表达网络模块功能差异 | 第31页 |
| 2.4.3 干旱胁迫下和发育过程中基因的双重角色 | 第31-32页 |
| 第三章 WRKY转录因子的进化与表达分析 | 第32-47页 |
| 3.1 前言 | 第32页 |
| 3.2 材料与方法 | 第32-33页 |
| 3.2.1 鉴定玉米中的WRKY基因 | 第32页 |
| 3.2.2 基因在染色体上的分布与复制分析 | 第32页 |
| 3.2.3 WRKY蛋白质的基序分析和基因结构分析 | 第32页 |
| 3.2.4 WRKY基因在干旱胁迫中的应答图谱 | 第32-33页 |
| 3.2.5 定量PCR验证 | 第33页 |
| 3.2.6 候选基因启动子区域顺式元件分析和蛋白质相互作用分析 | 第33页 |
| 3.3 结果 | 第33-45页 |
| 3.3.1 玉米中WRKY转录因子的鉴定 | 第33-39页 |
| 3.3.2 WRKY转录因子蛋白结构域与基因结构 | 第39-41页 |
| 3.3.3 公共数据库中数据挖掘 | 第41-42页 |
| 3.3.4 定量验证WRKY基因表达 | 第42-43页 |
| 3.3.5 候选WRKY基因的启动子分析与蛋白质互作分析 | 第43-45页 |
| 3.4 讨论 | 第45-47页 |
| 3.4.1 玉米中响应干旱的WRKY基因的鉴定 | 第45-46页 |
| 3.4.2 ZmWRKY基因在非生物胁迫下的调控 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-52页 |
| 附录 | 第52-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
| 作者简介 | 第56页 |
