| 摘要 | 第11-14页 |
| ABSTRACT | 第14-16页 |
| 缩略词 | 第17-19页 |
| 第一章 绪论 | 第19-30页 |
| 1.1 琼胶及琼胶寡糖 | 第19-21页 |
| 1.1.1 琼胶 | 第19-20页 |
| 1.1.2 琼胶寡糖 | 第20-21页 |
| 1.2 琼胶降解酶 | 第21-25页 |
| 1.2.1 琼胶酶 | 第21-23页 |
| 1.2.2 新琼二糖水解酶 | 第23-25页 |
| 1.3 琼胶降解途径 | 第25-29页 |
| 1.3.1 α-琼胶酶降解途径 | 第25页 |
| 1.3.2 β-琼胶酶降解途径 | 第25-27页 |
| 1.3.3 β-紫菜胶酶降解途径 | 第27-29页 |
| 1.4 立题依据 | 第29-30页 |
| 第二章 四株海洋新菌的分类鉴定及两株噬琼胶菌的基因组分析 | 第30-74页 |
| 2.1 实验材料 | 第30-32页 |
| 2.1.1 实验菌株 | 第30-31页 |
| 2.1.2 主要试剂及仪器 | 第31页 |
| 2.1.3 培养基与溶液 | 第31-32页 |
| 2.2 实验方法 | 第32-41页 |
| 2.2.1 表型特征鉴定 | 第32页 |
| 2.2.2 生理生化特征鉴定 | 第32-34页 |
| 2.2.3 基于遗传学的分类鉴定 | 第34-39页 |
| 2.2.4 化学特征鉴定 | 第39-40页 |
| 2.2.5 基因组测序 | 第40-41页 |
| 2.2.6 菌株保藏 | 第41页 |
| 2.3 实验结果与分析 | 第41-73页 |
| 2.3.1 噬琼胶科尔韦尔氏菌(Colwellia agarivorans sp.nov)QM50~T的多相分类鉴定 | 第41-47页 |
| 2.3.2 噬琼胶黏着杆菌(Tenacibaculum agarivorans sp.nov.)HZ1~T的多相分类鉴定 | 第47-53页 |
| 2.3.3 橙色鲨鱼球菌(Pistricoccus aurantiacus gen.nov,sp.nov)SS9T的多相分类鉴定 | 第53-61页 |
| 2.3.4 沉积物深海杆菌(Thalassotalea sediminis sp.nov)N211~T的多相分类鉴定 | 第61-68页 |
| 2.3.5 噬琼胶菌QM50~T和HZ1~T的基因组分析 | 第68-73页 |
| 2.4 本章小结 | 第73-74页 |
| 第三章 菌株Q1~T和HQM9~T琼胶降解酶基因的克隆表达分析 | 第74-112页 |
| 3.1 实验材料 | 第74-75页 |
| 3.1.1 实验菌株与质粒 | 第74页 |
| 3.1.2 主要试剂及仪器 | 第74-75页 |
| 3.1.3 培养基与溶液 | 第75页 |
| 3.2 实验方法 | 第75-85页 |
| 3.2.1 琼胶降解酶基因的生物信息学分析 | 第75页 |
| 3.2.2 琼胶降解酶基因的克隆 | 第75-79页 |
| 3.2.3 重组琼胶降解酶的表达与纯化 | 第79-82页 |
| 3.2.4 重组琼胶酶酶学性质研究 | 第82-83页 |
| 3.2.5 重组琼胶降解酶酶解产物分析 | 第83-85页 |
| 3.3 结果与分析 | 第85-111页 |
| 3.3.1 琼胶降解酶基因的生物信息学分析 | 第85-94页 |
| 3.3.2 琼胶降解酶基因的克隆表达 | 第94-99页 |
| 3.3.3 琼胶酶基因诱导表达优化及可溶性重组琼胶酶的纯化 | 第99-102页 |
| 3.3.4 重组琼胶降解酶粗酶液降解底物的产物分析 | 第102-104页 |
| 3.3.5 重组酶Q1B1的纯化与复性 | 第104-105页 |
| 3.3.6 重组酶Q1B1的酶学性质研究 | 第105-111页 |
| 3.4 本章小结 | 第111-112页 |
| 第四章 菌株Q1~T中的琼胶降解相关基因表达特性研究 | 第112-122页 |
| 4.1 实验材料 | 第112-113页 |
| 4.1.1 实验菌株及培养基 | 第112-113页 |
| 4.1.2 主要试剂与仪器 | 第113页 |
| 4.2 实验方法 | 第113-117页 |
| 4.2.1 菌株Q1~T生长曲线的测定 | 第113页 |
| 4.2.2 菌株Q1~T的诱导培养及菌体收集 | 第113页 |
| 4.2.3 细菌总RNA的提取及浓度检测 | 第113-114页 |
| 4.2.4 cDNA的合成 | 第114页 |
| 4.2.5 菌株Q1~T琼胶降解相关基因的筛选及引物设计 | 第114-116页 |
| 4.2.6 实时荧光定量PCR检测琼胶降解相关基因的表达 | 第116-117页 |
| 4.3 结果与分析 | 第117-121页 |
| 4.3.1 菌株Q1~T的生长曲线 | 第117-118页 |
| 4.3.2 细菌总RNA检测 | 第118页 |
| 4.3.3 琼胶降解相关基因的表达差异分析 | 第118-121页 |
| 4.4 本章小结 | 第121-122页 |
| 总结与展望 | 第122-123页 |
| 参考文献 | 第123-134页 |
| 附录1 | 第134-137页 |
| 附录2 | 第137-151页 |
| 致谢 | 第151-152页 |
| 资助情况 | 第152-153页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第153-154页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第154页 |
