| 符号说明 | 第4-9页 |
| 中文摘要 | 第9-11页 |
| Abstract | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第13-29页 |
| 1.1 遗传图谱的研究进展 | 第14-15页 |
| 1.2 遗传连锁图谱的构建 | 第15-23页 |
| 1.2.1 作图群体的选择 | 第16-20页 |
| 1.2.2 作图群体的大小 | 第20页 |
| 1.2.3 分子标记的选择 | 第20-23页 |
| 1.3 SSR标记的开发 | 第23-24页 |
| 1.3.1 高通量测序技术 | 第23页 |
| 1.3.2 基于高通量测序技术开发SSR标记 | 第23-24页 |
| 1.4 遗传图谱的应用 | 第24-25页 |
| 1.4.1 分子标记辅助育种 | 第24页 |
| 1.4.2 基于遗传图谱的基因克隆 | 第24-25页 |
| 1.4.3 比较基因组学研究 | 第25页 |
| 1.4.4 数量性状基因位点的定位和分析 | 第25页 |
| 1.5 植物QTL定位简介 | 第25-28页 |
| 1.5.1 QTL作图的原理和步骤 | 第26页 |
| 1.5.2 QTL定位的方法 | 第26-28页 |
| 1.5.3 丹参QTL定位 | 第28页 |
| 1.6 基于基因组SSR标记的遗传连锁图谱构建及QTL定位 | 第28-29页 |
| 2 材料与方法 | 第29-34页 |
| 2.1 丹参基因组SSR标记开发 | 第29-30页 |
| 2.1.1 DNA提取 | 第29页 |
| 2.1.2 亲本ZH23 DNA文库构建、高通量测序与序列组装 | 第29-30页 |
| 2.1.3 SSR位点的开发与引物设计 | 第30页 |
| 2.2 遗传图谱的构建 | 第30-34页 |
| 2.2.1 试验材料 | 第30-31页 |
| 2.2.2 仪器与试剂 | 第31页 |
| 2.2.3 丹参DNA的提取 | 第31-32页 |
| 2.2.4 DNA检测 | 第32页 |
| 2.2.5 SSR引物来源 | 第32-33页 |
| 2.2.6 SSR引物的筛选 | 第33页 |
| 2.2.7 SSR的检测方法 | 第33页 |
| 2.2.8 图谱构建及数据分析 | 第33-34页 |
| 2.3 丹参数量性状统计分析 | 第34页 |
| 2.3.1 试验材料 | 第34页 |
| 2.3.2 丹参数量性状调查 | 第34页 |
| 2.3.3 丹参数量性状的QTL分析方法 | 第34页 |
| 3 结果与分析 | 第34-53页 |
| 3.1 丹参基因组测序与SSR开发 | 第34-39页 |
| 3.1.1 高通量测序数据质量基本情况 | 第34-37页 |
| 3.1.2 丹参SSR的分布及频率 | 第37-38页 |
| 3.1.3 丹参基因组微卫星优势重复单元类型碱基构成 | 第38-39页 |
| 3.2 丹参连锁图的构建 | 第39-46页 |
| 3.2.1 DNA的检测 | 第39-40页 |
| 3.2.2 SSR引物的筛选结果及多态性分析 | 第40-41页 |
| 3.2.3 F1代作图群体SSR标记分离检测 | 第41-42页 |
| 3.2.4 遗传图谱的构建 | 第42-43页 |
| 3.2.5 与宗成堃构建图谱进行比较分析 | 第43-46页 |
| 3.3 丹参表型性状的统计 | 第46-53页 |
| 3.3.1 F1群体农艺性状统计分析 | 第46-49页 |
| 3.3.2 F1群体株系农艺性状的频率分布 | 第49-52页 |
| 3.3.3 QTL分析 | 第52-53页 |
| 4 讨论 | 第53-59页 |
| 4.1 丹参基因组SSR分布 | 第53-54页 |
| 4.2 作图群体 | 第54-55页 |
| 4.3 分子标记在连锁图谱中的偏分离现象 | 第55页 |
| 4.4 遗传连锁图谱的构建 | 第55-56页 |
| 4.5 QTLs分析 | 第56-59页 |
| 5 结论 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-69页 |
| 致谢 | 第69-70页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第70页 |
