摘要 | 第5-6页 |
ABSTRACT | 第6页 |
符号表 | 第10-11页 |
第一章 引言 | 第11-21页 |
1.1 粒重相关研究进展 | 第11-13页 |
1.1.1 油菜粒重的研究意义 | 第11页 |
1.1.2 油菜粒重分子水平研究进展 | 第11页 |
1.1.3 粒重基因克隆的研究进展 | 第11-13页 |
1.2 QTL定位的研究概述 | 第13-16页 |
1.2.1 QTL定位的原理 | 第13-14页 |
1.2.2 QTL定位分离群体的构建 | 第14页 |
1.2.3 分子标记的选择 | 第14-15页 |
1.2.4 QTL定位的方法 | 第15页 |
1.2.5 QTL定位的展望 | 第15页 |
1.2.6 甘蓝型油菜重要农艺性状QTL定位的研究进展 | 第15-16页 |
1.3 新一代测序技术 | 第16-19页 |
1.3.1 概述 | 第16页 |
1.3.2 新一代测序技术应用 | 第16-19页 |
1.4 研究设想与研究意义 | 第19-21页 |
第二章 利用SLAF-seq技术快速定位粒重候选基因 | 第21-47页 |
2.1 材料与方法 | 第21-30页 |
2.1.1 主要仪器设备 | 第21-22页 |
2.1.2 试剂与酶 | 第22页 |
2.1.3 DH群体的构建 | 第22-23页 |
2.1.4 表型观察与性状数据测定 | 第23页 |
2.1.5 极端混合池的构建 | 第23-26页 |
2.1.6 亲本和极端群体基因组DNA提取 | 第26页 |
2.1.7 SLAF-seq测序上机DNA的准备 | 第26页 |
2.1.8 酶切方案设计 | 第26-27页 |
2.1.9 SLAF文库的构建 | 第27-28页 |
2.1.10 SLAF标签开发 | 第28-29页 |
2.1.11 关联分析方法 | 第29-30页 |
2.2 结果与讨论 | 第30-46页 |
2.2.1 酶切方案评估 | 第30-32页 |
2.2.2 测序数据统计与评估 | 第32-34页 |
2.2.3 实验建库评估 | 第34-36页 |
2.2.4 SLAF标记开发 | 第36-38页 |
2.2.5 关联分析 | 第38-42页 |
2.2.6 关联结果功能分析 | 第42-46页 |
2.3 本章小结 | 第46-47页 |
第三章 调控甘蓝型油菜粒重的转录表达谱分析 | 第47-72页 |
3.1 材料与方法 | 第47-52页 |
3.1.1 主要仪器设备 | 第47页 |
3.1.2 试剂与酶 | 第47页 |
3.1.3 试验材料的收集 | 第47-48页 |
3.1.4 RNA样本的提取 | 第48-49页 |
3.1.5 RNA-seq测序文库的建立与上机测序 | 第49页 |
3.1.6 信息分析流程 | 第49-50页 |
3.1.7 差异表达基因的筛选 | 第50页 |
3.1.8 生物信息学分析 | 第50-51页 |
3.1.9 QRT-PCR | 第51-52页 |
3.2 结果与讨论 | 第52-71页 |
3.2.1 测序数据统计与评估 | 第52-54页 |
3.2.2 RNA-Seq整体质量评估 | 第54-58页 |
3.2.3 基因结构分析 | 第58-61页 |
3.2.4 新基因分析 | 第61页 |
3.2.5 基因表达分析 | 第61-62页 |
3.2.6 基因差异表达分析 | 第62-64页 |
3.2.7 基因功能注释 | 第64-67页 |
3.2.8 甘蓝型油菜转录谱识别粒重相关基因 | 第67-70页 |
3.2.9 荧光定量PCR(qRT-PCR)检测分析 | 第70-71页 |
3.3 本章小结 | 第71-72页 |
致谢 | 第72-73页 |
参考文献 | 第73-81页 |
附表 | 第81-85页 |
博士后期间发表的学术论文 | 第85页 |
个人简历 | 第85-86页 |