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甘蓝型油菜粒重候选基因筛选及转录组分析

摘要第5-6页
ABSTRACT第6页
符号表第10-11页
第一章 引言第11-21页
    1.1 粒重相关研究进展第11-13页
        1.1.1 油菜粒重的研究意义第11页
        1.1.2 油菜粒重分子水平研究进展第11页
        1.1.3 粒重基因克隆的研究进展第11-13页
    1.2 QTL定位的研究概述第13-16页
        1.2.1 QTL定位的原理第13-14页
        1.2.2 QTL定位分离群体的构建第14页
        1.2.3 分子标记的选择第14-15页
        1.2.4 QTL定位的方法第15页
        1.2.5 QTL定位的展望第15页
        1.2.6 甘蓝型油菜重要农艺性状QTL定位的研究进展第15-16页
    1.3 新一代测序技术第16-19页
        1.3.1 概述第16页
        1.3.2 新一代测序技术应用第16-19页
    1.4 研究设想与研究意义第19-21页
第二章 利用SLAF-seq技术快速定位粒重候选基因第21-47页
    2.1 材料与方法第21-30页
        2.1.1 主要仪器设备第21-22页
        2.1.2 试剂与酶第22页
        2.1.3 DH群体的构建第22-23页
        2.1.4 表型观察与性状数据测定第23页
        2.1.5 极端混合池的构建第23-26页
        2.1.6 亲本和极端群体基因组DNA提取第26页
        2.1.7 SLAF-seq测序上机DNA的准备第26页
        2.1.8 酶切方案设计第26-27页
        2.1.9 SLAF文库的构建第27-28页
        2.1.10 SLAF标签开发第28-29页
        2.1.11 关联分析方法第29-30页
    2.2 结果与讨论第30-46页
        2.2.1 酶切方案评估第30-32页
        2.2.2 测序数据统计与评估第32-34页
        2.2.3 实验建库评估第34-36页
        2.2.4 SLAF标记开发第36-38页
        2.2.5 关联分析第38-42页
        2.2.6 关联结果功能分析第42-46页
    2.3 本章小结第46-47页
第三章 调控甘蓝型油菜粒重的转录表达谱分析第47-72页
    3.1 材料与方法第47-52页
        3.1.1 主要仪器设备第47页
        3.1.2 试剂与酶第47页
        3.1.3 试验材料的收集第47-48页
        3.1.4 RNA样本的提取第48-49页
        3.1.5 RNA-seq测序文库的建立与上机测序第49页
        3.1.6 信息分析流程第49-50页
        3.1.7 差异表达基因的筛选第50页
        3.1.8 生物信息学分析第50-51页
        3.1.9 QRT-PCR第51-52页
    3.2 结果与讨论第52-71页
        3.2.1 测序数据统计与评估第52-54页
        3.2.2 RNA-Seq整体质量评估第54-58页
        3.2.3 基因结构分析第58-61页
        3.2.4 新基因分析第61页
        3.2.5 基因表达分析第61-62页
        3.2.6 基因差异表达分析第62-64页
        3.2.7 基因功能注释第64-67页
        3.2.8 甘蓝型油菜转录谱识别粒重相关基因第67-70页
        3.2.9 荧光定量PCR(qRT-PCR)检测分析第70-71页
    3.3 本章小结第71-72页
致谢第72-73页
参考文献第73-81页
附表第81-85页
博士后期间发表的学术论文第85页
个人简历第85-86页

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