| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第1章 前言 | 第10-18页 |
| ·研究的背景和目的 | 第10-11页 |
| ·CA-4类似物的研究现状 | 第11-13页 |
| ·计算机辅助药物设计的发展 | 第13-14页 |
| ·分子对接的研究进展 | 第14页 |
| ·定量构效关系的研究进展 | 第14-16页 |
| ·配体和受体间的结合能的研究进展 | 第16-17页 |
| ·本课题的研究目的及意义 | 第17页 |
| ·本课题的研究内容 | 第17-18页 |
| 第2章 理论基础和计算方法 | 第18-27页 |
| ·引言 | 第18页 |
| ·定量构效关系(QSAR) | 第18-22页 |
| ·3D-QSAR中的CoMFA和CoMSIA的基本原理 | 第18-19页 |
| ·影响CoMFA和CoMSIA模型的重要因素 | 第19-20页 |
| ·CoMFA和CoMSIA的研究过程 | 第20-22页 |
| ·分子对接 | 第22-23页 |
| ·分子对接的分类 | 第22-23页 |
| ·常用分子对接的软件 | 第23页 |
| ·分子动力学 | 第23-25页 |
| ·基本理论 | 第24-25页 |
| ·药效团模型 | 第25-27页 |
| 第3章 CA-4类似物的3D-QSAR研究 | 第27-45页 |
| ·CA-4类似物的3D-QSAR研究 | 第27-43页 |
| ·样本的搜集 | 第27-30页 |
| ·CoMFA和CoMSIA模型的统计学结果 | 第30-33页 |
| ·生物测试结果及模型的验证 | 第33-40页 |
| ·CoMFA和CoMSIA的色块图分析 | 第40-42页 |
| ·设计新的抑制性分子 | 第42-43页 |
| ·本章结论 | 第43-45页 |
| 第4章 分子对接(Surflex-Dock) | 第45-48页 |
| ·SURFLEX-DOCK | 第45-47页 |
| ·Surflex-Dock中准备蛋白 | 第45-46页 |
| ·Surflex-Dock中创建对接口袋及分析对接结果 | 第46-47页 |
| ·本章结论 | 第47-48页 |
| 第5章 分子动力学 | 第48-57页 |
| ·初始构型的确定及配体、受体、复合物的处理 | 第48页 |
| ·能量优化 | 第48页 |
| ·动力学模拟 | 第48-49页 |
| ·升温 | 第48页 |
| ·平衡体系 | 第48-49页 |
| ·在生产相条件下进行动力学采样 | 第49页 |
| ·结果与分析 | 第49-53页 |
| ·结合能的计算及结果 | 第53-56页 |
| ·本章结论 | 第56-57页 |
| 第6章 药效团与虚拟筛选 | 第57-62页 |
| ·药效团模型的建立 | 第57-60页 |
| ·活性化合物的选择及特征元素的定义(训练集的选择) | 第57页 |
| ·分子叠合及药效团的识别 | 第57页 |
| ·最优药效团的选择 | 第57-59页 |
| ·最优药效团的分析 | 第59-60页 |
| ·用药效团模型进行虚拟筛选 | 第60页 |
| ·本章结论 | 第60-62页 |
| 第7章 全文总结 | 第62-63页 |
| 参考文献 | 第63-72页 |
| 致谢 | 第72-73页 |
| 攻读学位期间所开展的科研项目和发表的学术论文 | 第73页 |
