摘要 | 第1-6页 |
Abstract | 第6-9页 |
符号及缩略语 | 第9-12页 |
前言 | 第12-15页 |
第一部分 文献综述 | 第15-22页 |
1 MLVA技术的原理 | 第15-16页 |
2 MLVA技术在布鲁氏菌分型和溯源中的应用 | 第16-19页 |
·MLVA技术在布鲁氏菌应用的发展史 | 第17页 |
·MLVA在布鲁氏菌分型的应用 | 第17-18页 |
·MLVA在种系间遗传与进化的研究 | 第18-19页 |
3 MLVA技术与其他分型技术的比较 | 第19-21页 |
·外膜蛋白分型 | 第19页 |
·AMOS-PCR分型 | 第19-20页 |
·插入序列IS711 | 第19-20页 |
·AMOS-PCR在布鲁氏菌分型的应用 | 第20页 |
·片段长度多态性扩增 | 第20-21页 |
·多位点序列分型 | 第21页 |
4 展望 | 第21-22页 |
第二部分 研究内容 | 第22-53页 |
第一章 16S rDNA和AMOS-PCR方法在布鲁氏菌种型鉴定中的应用 | 第22-30页 |
1 材料与方法 | 第22-26页 |
·实验菌株 | 第22-23页 |
·实验试剂 | 第23-24页 |
·实验仪器 | 第24页 |
·引物设计 | 第24-25页 |
·16S rDNA引物 | 第24页 |
·AMOS-PCR引物 | 第24-25页 |
·布鲁氏菌临床分离株的收集和基因组的提取 | 第25页 |
·PCR扩增 | 第25-26页 |
·16S rDNA扩增 | 第25页 |
·AMOS-PCR扩增 | 第25-26页 |
·琼脂糖凝胶电泳检测 | 第26页 |
·琼脂糖凝胶的配制 | 第26页 |
·凝胶电泳 | 第26页 |
·16S rDNA序列分析 | 第26页 |
2 结果 | 第26-28页 |
·16S rDNA电泳检测结果 | 第27页 |
·16S rDNA序列分析 | 第27页 |
·AMOS-PCR电泳检测结果 | 第27-28页 |
3 讨论 | 第28-30页 |
第二章 布鲁氏菌分离株MLST分析 | 第30-44页 |
1 材料与方法 | 第30-32页 |
·实验菌株 | 第30页 |
·实验试剂 | 第30页 |
·实验仪器 | 第30-31页 |
·生物信息软件 | 第31页 |
·引物设计 | 第31页 |
·PCR扩增 | 第31-32页 |
·琼脂糖凝胶电泳与测序 | 第32页 |
·MLST序列整理及数据分析 | 第32页 |
2 结果 | 第32-41页 |
·测序结果的分析 | 第32-34页 |
·PCR产物电泳结果 | 第34-36页 |
·CMLST和EMLST等位基因型和ST型比较分析 | 第36-38页 |
·CMLST和EMLST等位基因数和多态性位点比较分析 | 第38-39页 |
·不同ST型别的聚类分析 | 第39-41页 |
·不同型别的分裂分解分析 | 第39-40页 |
·不同型别的进化关系 | 第40-41页 |
3 讨论 | 第41-44页 |
第三章 布鲁氏菌分离株MLVA分析 | 第44-53页 |
1 材料与方法 | 第44-47页 |
·实验菌株 | 第44页 |
·实验试剂 | 第44-45页 |
·实验仪器 | 第45页 |
·生物信息软件 | 第45页 |
·引物设计 | 第45-46页 |
·PCR扩增 | 第46-47页 |
·琼脂糖凝胶电泳与测序 | 第47页 |
·MLVA序列整理及数据分析 | 第47页 |
2 结果 | 第47-50页 |
·23株布鲁氏菌MLVA位点串联重复序列拷贝数的确定 | 第47-48页 |
·23株布鲁氏菌的MLVA分型结果 | 第48-49页 |
·基于16个MLVA位点对23株布鲁氏菌进行遗传进化分析 | 第49-50页 |
3 讨论 | 第50-53页 |
结论 | 第53-54页 |
参考文献 | 第54-59页 |
致谢 | 第59-61页 |
作者简介 | 第61页 |