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应用不同分型方法对布鲁氏菌临床分离株基因分型的研究

摘要第1-6页
Abstract第6-9页
符号及缩略语第9-12页
前言第12-15页
第一部分 文献综述第15-22页
 1 MLVA技术的原理第15-16页
 2 MLVA技术在布鲁氏菌分型和溯源中的应用第16-19页
   ·MLVA技术在布鲁氏菌应用的发展史第17页
   ·MLVA在布鲁氏菌分型的应用第17-18页
   ·MLVA在种系间遗传与进化的研究第18-19页
 3 MLVA技术与其他分型技术的比较第19-21页
   ·外膜蛋白分型第19页
   ·AMOS-PCR分型第19-20页
     ·插入序列IS711第19-20页
     ·AMOS-PCR在布鲁氏菌分型的应用第20页
   ·片段长度多态性扩增第20-21页
   ·多位点序列分型第21页
 4 展望第21-22页
第二部分 研究内容第22-53页
 第一章 16S rDNA和AMOS-PCR方法在布鲁氏菌种型鉴定中的应用第22-30页
  1 材料与方法第22-26页
   ·实验菌株第22-23页
   ·实验试剂第23-24页
   ·实验仪器第24页
   ·引物设计第24-25页
     ·16S rDNA引物第24页
     ·AMOS-PCR引物第24-25页
   ·布鲁氏菌临床分离株的收集和基因组的提取第25页
   ·PCR扩增第25-26页
     ·16S rDNA扩增第25页
     ·AMOS-PCR扩增第25-26页
   ·琼脂糖凝胶电泳检测第26页
     ·琼脂糖凝胶的配制第26页
     ·凝胶电泳第26页
   ·16S rDNA序列分析第26页
  2 结果第26-28页
   ·16S rDNA电泳检测结果第27页
   ·16S rDNA序列分析第27页
   ·AMOS-PCR电泳检测结果第27-28页
  3 讨论第28-30页
 第二章 布鲁氏菌分离株MLST分析第30-44页
  1 材料与方法第30-32页
   ·实验菌株第30页
   ·实验试剂第30页
   ·实验仪器第30-31页
   ·生物信息软件第31页
   ·引物设计第31页
   ·PCR扩增第31-32页
   ·琼脂糖凝胶电泳与测序第32页
   ·MLST序列整理及数据分析第32页
  2 结果第32-41页
   ·测序结果的分析第32-34页
   ·PCR产物电泳结果第34-36页
   ·CMLST和EMLST等位基因型和ST型比较分析第36-38页
   ·CMLST和EMLST等位基因数和多态性位点比较分析第38-39页
   ·不同ST型别的聚类分析第39-41页
     ·不同型别的分裂分解分析第39-40页
     ·不同型别的进化关系第40-41页
  3 讨论第41-44页
 第三章 布鲁氏菌分离株MLVA分析第44-53页
  1 材料与方法第44-47页
   ·实验菌株第44页
   ·实验试剂第44-45页
   ·实验仪器第45页
   ·生物信息软件第45页
   ·引物设计第45-46页
   ·PCR扩增第46-47页
   ·琼脂糖凝胶电泳与测序第47页
   ·MLVA序列整理及数据分析第47页
  2 结果第47-50页
   ·23株布鲁氏菌MLVA位点串联重复序列拷贝数的确定第47-48页
   ·23株布鲁氏菌的MLVA分型结果第48-49页
   ·基于16个MLVA位点对23株布鲁氏菌进行遗传进化分析第49-50页
  3 讨论第50-53页
结论第53-54页
参考文献第54-59页
致谢第59-61页
作者简介第61页

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