草珊瑚叶片cDNA文库构建及EST分析
| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 1 引言 | 第11-26页 |
| ·草珊瑚的研究概况 | 第11-19页 |
| ·本草考证 | 第11页 |
| ·生物学特征和资源概述 | 第11-12页 |
| ·化学成分及药理作用 | 第12-14页 |
| ·草珊瑚的研究现状 | 第14-19页 |
| ·全长cDNA文库的构建及应用 | 第19-23页 |
| ·基本概念及特点 | 第19页 |
| ·分类 | 第19-21页 |
| ·全长cDNA文库的构建策略 | 第21-23页 |
| ·表达序列标签(EST) | 第23-25页 |
| ·基本概念及原理 | 第23-24页 |
| ·EST分析的应用 | 第24-25页 |
| ·药用植物次生代谢物在功能基因组学上的研究进展 | 第25页 |
| ·研究的目的与意义 | 第25-26页 |
| 2 材料与方法 | 第26-36页 |
| ·试验材料 | 第26页 |
| ·主要试验设备 | 第26页 |
| ·主要试剂 | 第26-27页 |
| ·试验试剂 | 第26页 |
| ·主要溶液配制与处理 | 第26-27页 |
| ·RNA提取 | 第27-29页 |
| ·CTAB法提取草珊瑚叶片总RNA | 第27页 |
| ·CTAB-LiCl法提取草珊瑚叶片总RNA | 第27-28页 |
| ·CTAB-Trizol法提取草珊瑚叶片总RNA | 第28页 |
| ·Trizol法提取草珊瑚叶片总RNA | 第28页 |
| ·百泰克试剂盒法提取草珊瑚叶片总RNA | 第28页 |
| ·天根试剂盒法提取草珊瑚叶片总RNA | 第28-29页 |
| ·RNA纯化 | 第29页 |
| ·RNA质量检测 | 第29页 |
| ·全长cDNA文库的构建 | 第29-35页 |
| ·第一链cDNA的合成 | 第29-30页 |
| ·双链cDNA的合成 | 第30-31页 |
| ·cDNA片段的纯化分级 | 第31页 |
| ·cDNA片段与载体的连接 | 第31-32页 |
| ·连接产物的电转化 | 第32-33页 |
| ·文库质量检测 | 第33-34页 |
| ·原始文库扩增 | 第34-35页 |
| ·EST测序与生物信息学分析 | 第35-36页 |
| ·EST测序 | 第35页 |
| ·序列的初步处理与EST序列生物信息学分析 | 第35-36页 |
| 3 结果与分析 | 第36-47页 |
| ·总RNA的提取 | 第36-39页 |
| ·总RNA的纯度与浓度 | 第36-37页 |
| ·总RNA的完整性 | 第37页 |
| ·总RNA中的DNA去除及纯化 | 第37-38页 |
| ·六种总RNA提取方法的成本和时间比较 | 第38-39页 |
| ·cDNA文库结果分析 | 第39-42页 |
| ·dsDNA的合成 | 第39页 |
| ·cDNA分级分离 | 第39-40页 |
| ·文库质量评价 | 第40-42页 |
| ·EST序列测定及生物信息学分析 | 第42-47页 |
| ·EST长度统计 | 第42-43页 |
| ·序列重复性分析及基因表达丰度分析 | 第43-44页 |
| ·ESTs功能统计 | 第44页 |
| ·KO目录及KEGG注释 | 第44页 |
| ·Blast2GO功能基因分类 | 第44-45页 |
| ·物种相似性分布 | 第45-47页 |
| 4 结论与讨论 | 第47-51页 |
| ·结论 | 第47-48页 |
| ·RNA的提取 | 第47页 |
| ·cDNA文库构建 | 第47页 |
| ·EST序列的统计分析 | 第47页 |
| ·EST序列的生物信息学分析 | 第47-48页 |
| ·讨论 | 第48-51页 |
| ·RNA的提取方法比较 | 第48-49页 |
| ·cDNA文库质量评价 | 第49-51页 |
| 参考文献 | 第51-55页 |
| 缩略词(Abbreviation) | 第55-56页 |
| 附录1 | 第56-60页 |
| 附录2 | 第60-61页 |
| 附录3 | 第61-64页 |
| 附图 | 第64-66页 |
| 读研期间发表论文 | 第66-67页 |
| 致谢 | 第67页 |
