融合插入/缺失信息的DNA进化模型的改进
| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 1 绪论 | 第9-23页 |
| ·研究背景和意义 | 第9-12页 |
| ·国内外研究现状 | 第12-21页 |
| ·核苷酸置换模型 | 第13-18页 |
| ·涉及indel的模型 | 第18-21页 |
| ·本文的研究内容和结构 | 第21-23页 |
| 2 使用工具和技术路线 | 第23-26页 |
| ·使用工具 | 第23-24页 |
| ·技术路线 | 第24-26页 |
| ·研究方法和技术 | 第24-25页 |
| ·论文可行性分析 | 第25-26页 |
| 3 改进模型的构建 | 第26-33页 |
| ·JC69+gap'模型 | 第28-29页 |
| ·F81+gap'模型 | 第29-30页 |
| ·HKY85+gap'模型 | 第30-31页 |
| ·F84+gap'模型 | 第31-33页 |
| 4 结果与分析 | 第33-62页 |
| ·测试数据 | 第33-37页 |
| ·真实DNA序列的选取 | 第33-34页 |
| ·模拟DNA序列的产生 | 第34-37页 |
| ·方法 | 第37-41页 |
| ·最大似然法 | 第37-39页 |
| ·遗传算法 | 第39-41页 |
| ·真实数据的结果与分析 | 第41-51页 |
| ·测试结果 | 第41-46页 |
| ·检验分析 | 第46-51页 |
| ·模拟数据的结果与分析 | 第51-62页 |
| 5 小结 | 第62-63页 |
| 6 展望 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-68页 |
| 附录A：模型的置换概率矩阵的推导过程 | 第68-70页 |
| 附录B：JC69+gap’模型的距离公式推导 | 第70-72页 |
| 附录C：F81+gap’模型的距离公式推导 | 第72-74页 |
| 附录D：计算机模拟序列的多序列比对数据 | 第74-85页 |
| 致谢 | 第85页 |
