| 致谢 | 第1-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 专业词汇中英文对照表 | 第11-17页 |
| 1 引言 | 第17-41页 |
| ·DNA甲基化表观遗传修饰研究 | 第17-22页 |
| ·DNA 5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5mC) | 第17页 |
| ·DNA甲基转移酶(DNMT)与5mC的形成 | 第17-19页 |
| ·DNA甲基结合蛋白 | 第19-21页 |
| ·SmC的功能 | 第21-22页 |
| ·TET蛋白与DNA去甲基化 | 第22-29页 |
| ·TET蛋白的鉴定及早期研究 | 第22页 |
| ·TET蛋白是DNA上5mC的氧化酶 | 第22-24页 |
| ·TET蛋白的结构特点 | 第24-26页 |
| ·TET蛋白介导的DNA去甲基化机制 | 第26-29页 |
| ·DNA去甲基化与5-羟甲基胞嘧啶(5hmC) | 第29-39页 |
| ·5hmC的发现及形成 | 第29-30页 |
| ·5hmC的检测方法及测序技术 | 第30-33页 |
| ·5hmC在组织细胞中的分布 | 第33-34页 |
| ·5hmC的基因组分布 | 第34-36页 |
| ·5hmC和TET的生物学功能 | 第36-39页 |
| ·醌类化合物与DNA羟甲基化 | 第39-40页 |
| ·研究设想 | 第40-41页 |
| 2 材料与方法 | 第41-57页 |
| ·实验材料 | 第41-47页 |
| ·实验试剂 | 第41-46页 |
| ·实验耗材 | 第46-47页 |
| ·实验材料实验方法 | 第47-57页 |
| ·细胞培养 | 第47页 |
| ·细胞处理 | 第47-48页 |
| ·基因组DNA的提取和酶解 | 第48页 |
| ·UHPLC-MS/MS检测分析 | 第48页 |
| ·DNA斑点印迹检测实验 | 第48-49页 |
| ·动物细胞总蛋白提取及浓度测定 | 第49页 |
| ·蛋白免疫印迹实验 | 第49-50页 |
| ·RNA提取 | 第50页 |
| ·RT,半定量PCR和实时定量荧光(Real-time)PCR | 第50-52页 |
| ·5hmC-DNA的富集实验 | 第52-55页 |
| ·5hmC测序及生物信息学分析 | 第55页 |
| ·5hmC测序结果验证 | 第55-56页 |
| ·转录组测序及生物信息学分析 | 第56页 |
| ·基因功能富集分析 | 第56页 |
| ·统计性分析 | 第56-57页 |
| 3 研究结果 | 第57-79页 |
| ·醌类化合物调节DNA羟甲基化与去甲基化 | 第57-61页 |
| ·醌类化合物影响细胞基因组DNA中5hmC含量 | 第58-59页 |
| ·醌类化合物诱导的5hmC形成具有剂量和时间效应关系 | 第59-61页 |
| ·醌类化合物诱导5hmC形成的机制研究 | 第61-66页 |
| ·醌类化合物诱导5hmC形成依赖于TET蛋白 | 第61-63页 |
| ·醌类化合物影响TET蛋白的催化活性 | 第63页 |
| ·醌类化合物通过调控Fe~(2+)水平从而影响TET蛋白的催化活性 | 第63-65页 |
| ·其他醌类化合物对5hmC含量的影响 | 第65-66页 |
| ·醌类化合物诱导整体水平的5hmC形成 | 第66-72页 |
| ·基因组DNA中5hmC的富集 | 第66-67页 |
| ·5hmC-DNA测序(5hmC-seq)及分布分析 | 第67-70页 |
| ·5hmC富集基因的功能分析 | 第70-72页 |
| ·醌类化合物诱导的5hmC形成对基因表达的影响 | 第72-79页 |
| ·TCBQ和DMSO处理的MRC-5细胞的转录组测序(RNA-seq)及分析 | 第72-74页 |
| ·TCBQ诱导形成的5hmC与基因表达的关系研究 | 第74-75页 |
| ·TCBQ诱导形成的5hmC与基因表达水平的验证 | 第75-77页 |
| ·醌类化合物调控DNA羟甲基化的分子机制 | 第77-79页 |
| 4 讨论 | 第79-81页 |
| 参考文献 | 第81-100页 |
| 作者简历及攻读学位期间发表的学术论文与研究成果 | 第100-101页 |
