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牦牛MMP3、ADAM17、ARG2基因SNPs与其高原低氧适应性相关分析

摘要第1-5页
SUMMARY第5-10页
缩略表第10-11页
前言第11页
第一部分 文献综述第11-26页
 1 牦牛概述第12-16页
   ·牦牛的分类及分布第12-13页
     ·牦牛的分类第12-13页
     ·牦牛的分布第13页
   ·牦牛适应高原环境的生物学特征第13-16页
     ·牦牛的形态、结构与低氧适应性第13-14页
     ·牦牛肺脏的组织结构与低氧适应性第14-15页
     ·牦牛血液学特性与低氧适应性第15-16页
 2 MMP3 基因的研究进展第16-18页
   ·MMP3 概述第16页
   ·MMP3 的生物学特点第16-17页
   ·MMP3 的功能第17页
   ·MMP3 的活性调节第17-18页
 3 ADAM17 基因的研究进展第18-19页
   ·ADAM17 概述第18-19页
 4 ARG2 基因的研究进展第19-21页
   ·ARG2 概述第19-21页
 5 低氧诱导因子研究进展第21-23页
   ·低氧诱导因子-1a(HiF-1a)概述第21页
   ·HiF-1 结构与功能第21-22页
   ·HiF-1 调节机制第22页
   ·HIF-1 的作用机制第22-23页
 6 HRM 分型法概述第23-24页
 7 研究目的和意义第24-26页
第二部分 材料与方法第26-32页
 1 试验材料第26页
   ·血液样品的采集第26页
 2 主要仪器设备第26页
 3 主要试剂第26页
 4 实验方法第26-29页
   ·DNA 的提取第26页
   ·构建 DNA 混合池第26-27页
   ·引物的设计和 PCR 扩增第27-29页
     ·MMP3 基因 SNP 检测引物的设计与合成第27页
     ·ADAM17 基因 SNP 检测引物的设计与合成第27-28页
     ·ARG2 基因 SNP 检测引物的设计与合成第28-29页
   ·PCR 扩增体系(25μl)及程序第29页
 5 DNA 测序分析第29-30页
 6 高分辨率熔解曲线分型系统基因分型第30-31页
   ·MMP3 基因 rs2977 和 rs4331 位点 HRM 分型第30页
     ·分型引物设计与合成第30页
   ·ADAM17 基因 rs21928 和 rs38991 位点 HRM 分型第30页
     ·分型引物设计与合成第30页
   ·ARG2 基因 rs30979 和 rs32860 位点 HRM 分型第30-31页
     ·分型引物设计与合成第30-31页
 7 数据统计分析方法第31-32页
   ·遗传多态性分析第31-32页
第三部分 结果与分析第32-48页
 1 牦牛血样 DNA 提取质量的检测第32页
 2 牦牛 MMP3 基因遗传变异检测第32-37页
   ·PCR 产物电泳检测第32页
   ·牦牛 MMP3 序列比对分析第32-33页
   ·牦牛 MMP3 基因 SNPs 基因型检测第33-34页
   ·SNPs 基因型频率和等位基因频率在 4 个牦牛群体中的分布第34-35页
     ·位点 rs2977(G→A)基因型频率和等位基因频率分布第34页
     ·位点 rs4331(C→G)基因型频率和等位基因频率分布第34-35页
   ·各牦牛群体中 SNPs 位点的 Hardy-Weinberg 平衡检验结果第35页
   ·各群体间基因型频率和等位基因频率差异比较第35-36页
   ·各牦牛群体连锁不平衡分析第36-37页
   ·各牦牛群体单倍型分析第37页
 3 牦牛 ADAM17 基因遗传变异检测第37-42页
   ·PCR 产物琼脂糖凝胶电泳检测第37-38页
   ·牦牛 ADAM17 序列比对分析第38页
   ·牦牛 ADAM17 基因 SNPs 基因型检测第38-39页
   ·SNPs 基因型频率和等位基因频率在 4 个牦牛群体中的分布第39-40页
   ·各牦牛群体中 SNPs 位点的 Hardy-Weinberg 平衡检验结果第40页
   ·各群体间基因型频率和等位基因频率差异比较第40-41页
   ·各牦牛群体连锁不平衡分析第41-42页
   ·不同牦牛群体单倍型分析第42页
 4 牦牛 ARG2 基因遗传变异检测第42-48页
   ·PCR 产物琼脂糖凝胶电泳检测第42页
   ·牦牛 ARG2 序列比对分析第42-43页
   ·牦牛 ARG2 基因 SNPs 基因型检测第43-44页
   ·SNPs 基因型频率在 4 个牦牛群体中的分布第44-45页
   ·各牦牛群体中 SNPs 位点的 Hardy-Weinberg 平衡检验结果第45页
   ·各群体间基因型频率和等位基因频率差异比较第45-46页
   ·连锁不平衡关系分析第46-47页
   ·不同牦牛群体单倍型分析第47-48页
第四部分 讨论第48-54页
 1 采样和试验方法第49页
   ·样品采集第49页
   ·DNA 混合池第49页
 2 候选基因的 SNPs 与低氧适应性第49-54页
   ·MMP3 基因的 SNPs 与低氧适应性的关系第49-51页
   ·ADAM17 基因的 SNPs 与低氧适应性的关系第51-52页
   ·ARG2 基因的 SNPs 与低氧适应性的关系第52-54页
第五部分 结论第54-55页
参考文献第55-60页
附录第60-62页
致谢第62-63页
导师简介第63-64页
个人简介第64-65页

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