| 摘要 | 第1-4页 |
| ABSTRACT | 第4-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第7-21页 |
| ·鲍曼不动杆菌的生物学特性 | 第7-9页 |
| ·鲍曼不动杆菌的定义 | 第7页 |
| ·鲍曼不动杆菌的分型 | 第7-9页 |
| ·鲍曼不动杆菌的耐药现状与流行病学 | 第9-10页 |
| ·鲍曼不动杆菌的耐药机制 | 第10-14页 |
| ·氨基糖苷类 | 第10页 |
| ·β-内酰胺类抗生素 | 第10-11页 |
| ·喹诺酮类 | 第11-12页 |
| ·非酶耐药机制 | 第12-14页 |
| ·鲍曼不动杆菌感染的治疗策略 | 第14页 |
| ·DNA 测序技术发展综述 | 第14-17页 |
| ·国内外对鲍曼不动杆菌的研究进展 | 第17-20页 |
| ·研究热点 | 第17-18页 |
| ·高通量测序技术在鲍曼不动杆菌基因组学的研究现状 | 第18-20页 |
| ·本课题研究思路 | 第20-21页 |
| 第二章 鲍曼不动杆菌 MDR-TJ 的全基因组测序 | 第21-41页 |
| ·实验材料 | 第21-25页 |
| ·菌株 | 第21页 |
| ·实验耗材 | 第21-24页 |
| ·实验主要设备 | 第24页 |
| ·部分溶液和培养基配制 | 第24-25页 |
| ·全基因组测序 | 第25-35页 |
| ·基因组 DNA 样品准备及文库构建 | 第25-31页 |
| ·油包水 PCR (emPCR) | 第31-34页 |
| ·上机测序 | 第34-35页 |
| ·数据处理 | 第35-36页 |
| ·测序数据处理流程 | 第35页 |
| ·序列拼接结果 | 第35-36页 |
| ·缺口补平 | 第36-41页 |
| ·引物设计 | 第36-39页 |
| ·缺口补平方法 | 第39-41页 |
| 第三章 生物信息学分析 | 第41-56页 |
| ·鲍曼不动杆菌 MDR-TJ 的基因组 | 第41-48页 |
| ·MDR-TJ 基因组的注释、校对与递交 | 第41-42页 |
| ·MDR-TJ 中的基因组岛分析 | 第42-47页 |
| ·进化树分析 | 第47页 |
| ·多位点序列分型（Multiple locus sequence typing） | 第47-48页 |
| ·鲍曼不动杆菌 MDR-TJ 的耐药机制 | 第48-55页 |
| ·耐药基因组岛 | 第48-49页 |
| ·欧洲克隆 II 型鲍曼不动杆菌耐药岛结构的比较 | 第49-52页 |
| ·鲍曼不动杆菌 MDR-TJ 的其他耐药机制 | 第52-55页 |
| ·质粒 pABTJ1 和 pABTJ2 | 第55-56页 |
| 第四章 结论与展望 | 第56-57页 |
| ·结论 | 第56页 |
| ·展望 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-63页 |
| 发表论文和参加科研情况说明 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64页 |