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球毛壳菌次生代谢的分子生物学研究

中文摘要第1-7页
Abstract第7-15页
第一章 前言第15-66页
 第一节 球毛壳菌概述第15-19页
     ·球毛壳菌形态特征第15-17页
     ·球毛壳菌的研究价值第17-18页
     ·球毛壳菌分子生物学研究进展第18-19页
 第二节 真菌次生代谢产物的研究进展第19-28页
     ·真菌次生代谢与生长发育第20-23页
     ·真菌次生代谢与信号传导通路第23页
     ·调控次生代谢物生物合成的基因第23-26页
     ·真菌次生代谢产物的多样性第26-28页
 第三节 真菌聚酮化合物和聚酮合酶研究进展第28-40页
     ·真菌聚酮合酶分类第29-30页
     ·真菌聚酮合酶的结构和特性第30-32页
     ·真菌聚酮合酶的功能及参与的次生代谢物合成第32-36页
     ·真菌PKS基因的功能分析方法第36-38页
     ·球毛壳菌素第38-40页
 第四节 真菌G蛋白及其信号转导通路第40-47页
     ·真菌G蛋白的结构和功能第40-45页
     ·真菌G蛋白信号通路介导的生物学过程第45-47页
 第五节 真菌降解利用纤维素研究进展第47-55页
     ·纤维素酶的组成及作用机理第47-49页
     ·纤维素酶基因表达的调控第49-53页
     ·真菌降解纤维素的功能基因组学研究第53-54页
     ·纤维素酶的应用与发展趋势第54-55页
 第六节 真菌RNA干扰的研究进展第55-64页
     ·RNA干扰的发现第55-56页
     ·小RNA的分类第56页
     ·真菌不同RNAi途径第56-58页
     ·RNAi在真菌基因功能研究中的应用第58-64页
 第七节 研究目的和意义第64-66页
第二章 球毛壳菌RNA干扰方法的建立第66-111页
 第一节 实验材料第66-71页
     ·菌种第66-67页
     ·质粒第67-68页
     ·引物第68页
     ·试剂第68-70页
     ·培养基及相关溶液第70页
     ·实验仪器第70-71页
 第二节 实验方法第71-89页
     ·沉默质粒的构建第71-78页
     ·沉默质粒原生质体转化NK102第78-80页
     ·转化子的筛选和鉴定第80-84页
     ·转录水平基因表达分析第84-89页
 第三节 实验结果第89-109页
     ·球毛壳菌NK102中PKS-1蛋白的生物信息学分析第89-91页
     ·pks-1的表达量随时间梯度变化第91-92页
     ·球毛壳菌黑色素合成通路的鉴定第92-93页
     ·沉默质粒pPKS-1a和pPKS-1b的构建第93-95页
     ·沉默质粒转化得到黑色素缺失转化子第95-98页
     ·RNA干扰质粒在转化子中的存在状态第98-102页
     ·用实时定量验证沉默转化子的pks-1基因的表达量第102-106页
     ·pks-1沉默转化子的显微结构变化第106-109页
 第四节 讨论第109-111页
第三章 球毛壳菌素生物合成分子机制的初步研究第111-146页
 第一节 实验材料第111-116页
     ·菌种和质粒第111页
     ·引物第111-112页
     ·试剂第112-114页
     ·培养基及相关溶液第114页
     ·实验仪器第114-116页
 第二节 实验方法第116-122页
     ·沉默质粒的构建第116-119页
     ·基因沉默转化子的获得第119页
     ·转化子的筛选和鉴定第119页
     ·转录水平基因表达分析第119页
     ·发酵产物的检测第119-120页
     ·发酵产物的鉴定第120-122页
 第三节 实验结果第122-143页
     ·C.globosum NK102中ChA的鉴定和分离提纯第122-124页
     ·PKS-1的基因沉默对球毛壳菌素生物合成的影响第124-127页
     ·G蛋白GNA-1和PKA调节亚基PKAR的基因沉默第127-139页
     ·组蛋白去乙酰化酶HDAC的基因沉默第139-143页
 第四节 讨论第143-146页
第四章 球毛壳菌纤维素酶系的研究第146-169页
 第一节 实验材料第146-150页
     ·菌株和质粒第146页
     ·引物第146-147页
     ·试剂第147-149页
     ·培养基及相关溶液第149页
     ·实验仪器第149-150页
 第二节 实验方法第150-154页
     ·纤维素降解菌的鉴定第150-151页
     ·纤维素酶活力测定第151-152页
     ·纤维素基因的表达量测定第152页
     ·RNA-Seq及数据分析第152-154页
 第三节 实验结果第154-166页
     ·球毛壳菌NK102具有降解纤维素的能力第154页
     ·球毛壳菌中纤维素酶分析及主要纤维素酶基因的差异表达谱第154-156页
     ·不同碳源对纤维素酶基因表达和酶活性的影响第156-159页
     ·光照对纤维素酶基因表达和酶活性的影响第159页
     ·cAMP通路对NK102纤维素酶基因表达酶活性的调控第159-166页
 第四节 讨论第166-169页
第五章 球毛壳菌对根结线虫的生物防治作用第169-188页
 第一节 实验材料第170-171页
     ·菌种和线虫第170页
     ·试剂第170页
     ·培养基及相关溶液第170页
     ·实验仪器第170-171页
     ·分析软件第171页
 第二节 实验方法第171-176页
     ·南方根结线虫二龄幼虫(J2)的准备第171页
     ·南方根结线虫卵准备第171-172页
     ·球毛壳菌发酵液的准备和球毛壳菌素的提纯第172页
     ·J2趋化性实验第172-173页
     ·NK102发酵滤液和提纯ChA对J2的致死率第173页
     ·NK102发酵滤液和提纯ChA对卵孵化的影响第173-174页
     ·NK102发酵滤液和提纯ChA处理线虫后对其侵染根部的影响第174-175页
     ·提纯ChA对线虫繁殖和植物的影响第175-176页
     ·统计学分析方法第176页
 第三节 实验结果第176-186页
     ·南方根结线虫的生活史观察第176-178页
     ·NK102对二龄幼虫的趋避第178-179页
     ·NK102发酵液和提纯ChA对J2的影响第179-181页
     ·发酵液和提纯ChA对卵孵化的影响第181-183页
     ·NK102发酵液和提纯ChA对线虫侵染的影响第183-184页
     ·NK102发酵液和提纯ChA对线虫繁殖的影响第184-186页
 第四节 讨论第186-188页
第六章 结论第188-191页
参考文献第191-213页
致谢第213-214页
附录 常规溶液的配制第214-226页
 附录A 培养基第214-218页
 附录B 常用抗生素及药品类溶液第218页
 附录C 缓冲液和相关试剂的配制第218-226页
个人简历、在学期间发表的论文与研究成果第226页

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