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猪圆环病毒2型编码蛋白4的鉴定及其感染后的宿主免疫器官基因表达谱分析

目录第1-10页
摘要第10-12页
ABSTRACT第12-14页
论文创新点第14-15页
研究意义第15-16页
技术路线第16-17页
第一部分 文献综述第17-46页
 第一章 猪圆环病毒2型研究进展第17-35页
  1. PCV病毒的发现与分类第17-18页
  2. 基因组结构及其编码蛋白第18-25页
   ·基因组结构第18-19页
   ·Rep蛋白第19-21页
   ·Cap蛋白第21-22页
   ·ORF3蛋白第22-23页
   ·与复制相关的基因间区域第23-25页
  3. PCV复制第25页
  4. PCV转录第25-26页
  5. 病毒内吞第26-28页
  6. PCV2编码蛋白与宿主的相互作用第28-30页
   ·Rep蛋白与宿主蛋白的互作研究第28页
   ·Cap蛋白与宿主蛋白的互作研究第28-30页
   ·ORF3编码蛋白与宿主蛋白的互作研究第30页
  7. PCV2对免疫系统的影响第30-35页
   ·PCV2感染与天然免疫第30-31页
   ·PCV2感染的细胞因子变化第31-32页
   ·PCV2 DNA的免疫调节功能第32-33页
   ·体液免疫反应第33-35页
 第二章 芯片技术及应用进展第35-46页
  1. 基因芯片第35-42页
   ·基因芯片的原理第35-36页
   ·基因芯片分类第36-39页
     ·基因组(DNA)分析芯片第36-38页
     ·RNA水平分析芯片第38-39页
   ·基因芯片在病原研究中的运用第39-42页
  2. 蛋白质芯片第42-46页
   ·蛋白质芯片的原理第42页
   ·蛋白质芯片的分类第42-43页
   ·蛋白质芯片的应用第43-44页
     ·抗体的筛选第43页
     ·病原的检测第43-44页
     ·药物作用靶标的筛选第44页
     ·生物分子间互作关系的研究第44页
     ·在动物医学上的应用第44页
   ·蛋白质芯片的优缺点及前景第44-46页
第二部分 研究内容第46-136页
 第一章 ORF4编码产物蛋白水平及转录水平的鉴定第46-67页
  摘要第46-47页
  1. 材料与方法第47-59页
   ·材料第47页
     ·病毒,细胞和质粒第47页
   ·方法第47-59页
     ·ORF4转录本的Northern blot验证第48-53页
     ·ORF4编码蛋白的单克隆抗体制备第53-56页
     ·ORF4编码蛋白的多克隆抗体制备第56页
     ·ORF4编码蛋白的单/多克隆抗体特性分析第56-59页
     ·ORF4蛋白的亚细胞定位观察第59页
  2. 结果第59-65页
   ·Northern blot检测PCV2 ORF4转录本第59-61页
   ·PCV2 ORF4单克隆抗体和多克隆抗体的制备第61页
   ·ORF4抗体的特异性鉴定第61-63页
   ·ORF4抗体与PCV2感染的PK15细胞的反应第63页
   ·细胞内的分布及表达动态第63-64页
   ·ORF4抗体与PCV2感染细胞及pEGFP-ORF4转染细胞裂解物的western-blot检测第64-65页
  3. 讨论第65-67页
 第二章 PCV2 ORF4缺失体构建与ORF4蛋白功能分析第67-90页
  摘要第67-68页
  1. 材料与方法第68-76页
   ·材料第68页
   ·方法第68-76页
     ·PCV2正常感染性克隆及ORF4缺失突变体的构建第68-69页
     ·转染及IFA检测第69页
     ·rPCV2和PCV2Δ的传代和TCID_(50)测定第69-70页
     ·rPCV2与PCV2Δ的复制能力检测第70-71页
     ·rPCV2与PCV2Δ感染细胞的caspase3,8,9活性检测第71-72页
     ·BALB/c小鼠攻毒实验第72-76页
  2. 结果第76-87页
   ·PCV2感染性克隆构建与病毒拯救第76-77页
   ·ORF4蛋白是细胞培养中PCV2复制非必需的第77-78页
   ·rPCV2和PCV2Δ感染细胞的Caspase3、8、9的检测结果第78-80页
   ·PCV2Δ攻毒后基因稳定性分析第80页
   ·临床病症与显微病变第80-81页
   ·脾脏中的Cap抗原及ORF4蛋白检测第81-82页
   ·血清PCV2病毒载量检测第82-83页
   ·脾脏T淋巴细胞亚群计数第83-87页
  3. 讨论第87-90页
 第三章 猪圆环病毒2感染后的宿主免疫器官的基因表达谱分析第90-136页
  摘要第90-91页
  1. 材料与方法第91-105页
   ·材料第91-92页
   ·方法第92-105页
     ·BALB/c小鼠和猪的人工感染第92页
     ·BALB/c小鼠和猪的临床症状观察及组织样本收集第92-93页
     ·病毒血症检测第93页
     ·芯片RNA样品的制备与鉴定第93页
     ·利用小鼠和猪的Affymetrix芯片检测mRNA表达谱第93-98页
     ·筛选差异基因第98-99页
     ·SYBR green法荧光定量PCR验芯片结果第99-103页
     ·转录本的分类检索第103页
     ·Pathway分析第103页
     ·解聚因子destrin和cofilin1的蛋白水平验证第103-105页
  2. 结果第105-130页
   ·临床症状及组织病变第105-106页
   ·攻毒鼠和猪的病毒血症检测结果第106页
   ·差异基因分析结果第106页
   ·攻毒鼠和猪的差异基因分类第106-123页
   ·攻毒小鼠和猪的差异基因的pathway比较分析第123-126页
   ·荧光定量PCR验证芯片结果第126-129页
   ·攻毒猪cofilinl和DSTN的蛋白水平验证第129-130页
  3. 讨论第130-136页
   ·PCV2感染后机体呈现免疫与炎症反应抑制状态第131-133页
   ·PCV2感染导致机体代谢的紊乱第133-134页
   ·PCV2感染导致骨架蛋白调节蛋白的上调第134页
   ·PCV2感染诱导分化与发育相关因子上调第134-136页
全文总结第136-137页
参考文献第137-150页
附录A 常用缓冲液及配方第150-156页
附录B 攻博期间发表或待发表的学术论文第156-157页
致谢第157页

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