基因组序列的特征提取和进化树构建方法研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 目录 | 第7-9页 |
| 插图索引 | 第9-10页 |
| 附表索引 | 第10-11页 |
| 第1章 绪论 | 第11-17页 |
| ·项目来源 | 第11页 |
| ·研究背景和意义 | 第11-12页 |
| ·国内外研究现状与发展趋势 | 第12-14页 |
| ·本课题的主要工作 | 第14-15页 |
| ·论文组织结构 | 第15页 |
| ·小结 | 第15-17页 |
| 第2章 系统发育分析概述 | 第17-26页 |
| ·生物信息学 | 第17-20页 |
| ·生物信息学的研究背景及意义 | 第17-18页 |
| ·生物信息学的研究内容 | 第18-20页 |
| ·应用前景与展望 | 第20页 |
| ·基因组学 | 第20-22页 |
| ·原核基因组 | 第20-21页 |
| ·真核基因组 | 第21页 |
| ·基因组序列分析 | 第21-22页 |
| ·系统发育分析 | 第22-25页 |
| ·系统发生树构建方法 | 第22-23页 |
| ·系统发生树的可靠性 | 第23-24页 |
| ·全基因组系统发育分析 | 第24-25页 |
| ·小结 | 第25-26页 |
| 第3章 基于统计关联特征的特征提取方法 | 第26-45页 |
| ·序列统计特征概述 | 第26-27页 |
| ·单词频率 | 第26-27页 |
| ·DRA 特征 | 第27页 |
| ·BBC 特征 | 第27页 |
| ·一种新的统计特征—TBC 特征 | 第27-28页 |
| ·基于传递闭包法的进化树构建 | 第28-30页 |
| ·数据归一化 | 第28-29页 |
| ·模糊相似矩阵 | 第29页 |
| ·传递闭包法 | 第29-30页 |
| ·算法流程与算法描述 | 第30-31页 |
| ·实验结果与分析 | 第31-44页 |
| ·48 种 HEV 病毒基因组构建的进化树 | 第31-35页 |
| ·24 种冠状病毒基因组构建的进化树 | 第35-39页 |
| ·24 种转铁蛋白基因组构建的进化树 | 第39-41页 |
| ·20 种哺乳动物基因组构建的进化树 | 第41-44页 |
| ·小结 | 第44-45页 |
| 第4章 基于模糊聚类的进化树构建方法 | 第45-56页 |
| ·模糊聚类算法简介 | 第45-48页 |
| ·直接聚类法 | 第45页 |
| ·基于等价关系的模糊聚类方法 | 第45-47页 |
| ·最大树法 | 第47页 |
| ·基于划分的模糊聚类方法 | 第47-48页 |
| ·基于改进的模糊 K 均值算法构建进化树 | 第48-50页 |
| ·模糊 K 均值 | 第48-49页 |
| ·一种新的进化树构建方法 | 第49-50页 |
| ·实验结果与分析 | 第50-55页 |
| ·20 种哺乳动物基因组构建的进化树 | 第50-51页 |
| ·24 种转铁蛋白基因组构建的进化树 | 第51-52页 |
| ·24 种冠状病毒基因组构建的进化树 | 第52-53页 |
| ·48 种 HEV 病毒基因组构建的进化树 | 第53-55页 |
| ·小结 | 第55-56页 |
| 结论 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 附录A (攻读硕士期间发表论文和参加的项目) | 第65-66页 |
