摘要 | 第1-5页 |
Abstract | 第5-9页 |
插图索引 | 第9-10页 |
附表索引 | 第10-11页 |
第1章 绪论 | 第11-18页 |
·研究目的 | 第11页 |
·研究背景和意义 | 第11-12页 |
·研究现状 | 第12-16页 |
·蛋白质序列表达 | 第12-14页 |
·蛋白质亚细胞定位预测 | 第14-16页 |
·论文主要工作及结构安排 | 第16-17页 |
·小结 | 第17-18页 |
第2章 蛋白质亚基定位的生物信息学研究 | 第18-36页 |
·引言 | 第18页 |
·蛋白质简介 | 第18-22页 |
·生命中心法则 | 第18-19页 |
·细胞的基本组成 | 第19页 |
·亚细胞结构及功能 | 第19-21页 |
·20 种天然常见氨基酸 | 第21-22页 |
·蛋白质序列的特征表达 | 第22-25页 |
·氨基酸组成 | 第23页 |
·伪氨基酸组成 | 第23页 |
·二肽组成 | 第23-24页 |
·AAindex 方法 | 第24页 |
·自相关函数 | 第24-25页 |
·蛋白质序列编码及相似性分析 | 第25-30页 |
·基于物化特性的图形表示 | 第25-27页 |
·未基于物化特性的图形表示 | 第27-29页 |
·基于图形的序列相似性分析方法 | 第29-30页 |
·蛋白质亚细胞定位分类预测方法 | 第30-35页 |
·基于机器学习的分类预测方法 | 第31-34页 |
·基于统计的分类预测方法 | 第34-35页 |
·小结 | 第35-36页 |
第3章 基于 BLOSUM62 矩阵的特征提取方法 | 第36-46页 |
·引言 | 第36页 |
·实验平台 | 第36页 |
·基于 BLOSUM62 矩阵的蛋白质序列编码 | 第36-43页 |
·提取氨基酸的统计频率 | 第36-37页 |
·蛋白质比较表 | 第37-40页 |
·坐标系的构建 | 第40-41页 |
·坐标系可行性分析 | 第41-43页 |
·蛋白质序列特征提取 | 第43-45页 |
·特征提取 | 第43页 |
·距离公式 | 第43-44页 |
·实验数据 | 第44页 |
·实验结果分析 | 第44-45页 |
·小结 | 第45-46页 |
第4章 基于蛋白质序列的亚细胞定位预测 | 第46-55页 |
·引言 | 第46-47页 |
·算法预测性能评估方法 | 第47-48页 |
·数据集 | 第48-51页 |
·数据来源 | 第48-51页 |
·测试集与训练集的组成 | 第51页 |
·蛋白质亚基定位预测实验与讨论 | 第51-54页 |
·实验结果 | 第51-52页 |
·算法对比结果 | 第52-54页 |
·小结 | 第54-55页 |
结论 | 第55-57页 |
参考文献 | 第57-62页 |
致谢 | 第62-63页 |
附录 A 攻读硕士期间发表论文及参加的科研项目 | 第63-64页 |