纤维素酶E4的同源建模和分子对接研究
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 缩略词 | 第8-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-30页 |
| ·纤维素与纤维素酶 | 第11-12页 |
| ·纤维素酶的分类 | 第12-16页 |
| ·内切纤维素酶 | 第13-14页 |
| ·外切纤维素酶 | 第14-15页 |
| ·β-葡萄糖苷酶 | 第15-16页 |
| ·纤维素酶的催化作用机制 | 第16-18页 |
| ·纤维素酶结构与功能 | 第18-20页 |
| ·纤维素酶 E4 研究进展 | 第20-22页 |
| ·本文所涉及的分子模拟方法简介及进展 | 第22-28页 |
| ·同源建模 | 第22-27页 |
| ·分子对接 | 第27-28页 |
| ·本文的研究内容与方法 | 第28-30页 |
| ·纤维素酶 E4 的同源建模和模型的优化评估 | 第28页 |
| ·纤维素链与酶 E4 的分子对接研究 | 第28-29页 |
| ·突变模型的构建 | 第29-30页 |
| 第二章 纤维素酶 E4 的同源建模 | 第30-41页 |
| ·实验材料 | 第30-32页 |
| ·供试材料 | 第30-32页 |
| ·生物信息数据库和软件 | 第32页 |
| ·实验过程 | 第32-40页 |
| ·目标序列搜索建模模板 | 第32-33页 |
| ·目标序列与模板序列的多重序列比对 | 第33-34页 |
| ·基于目标序列与模板多重序列比对的同源模型的构建 | 第34-36页 |
| ·模型的能量最小化优化 | 第36-37页 |
| ·模型评价与分析 | 第37-40页 |
| ·实验结果与讨论 | 第40-41页 |
| 第三章 纤维素酶 E4 蛋白模型的分子对接 | 第41-47页 |
| ·实验材料 | 第41页 |
| ·供试材料 | 第41页 |
| ·生物信息软件 | 第41页 |
| ·实验过程 | 第41-43页 |
| ·受体蛋白的准备 | 第41页 |
| ·配体小分子的准备 | 第41页 |
| ·分子对接 | 第41-43页 |
| ·实验结果与讨论 | 第43-47页 |
| 第四章 氨基酸点突变模型的构建 | 第47-54页 |
| ·实验材料 | 第47页 |
| ·供试材料 | 第47页 |
| ·生物信息软件 | 第47页 |
| ·实验过程 | 第47-54页 |
| ·点突变实验方案的选定 | 第47页 |
| ·基础模型的设置 | 第47页 |
| ·点突变模型的建立 | 第47-50页 |
| ·模型的能量最小化优化 | 第50页 |
| ·模型的评价与分析 | 第50-52页 |
| ·模型的分子对接研究 | 第52-53页 |
| ·实验结果与讨论 | 第53-54页 |
| 结论 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-59页 |
| 附录 | 第59-63页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 附件 | 第65页 |
