生物信息学中模体聚类算法的研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-8页 |
| 第一章 相关背景 | 第8-14页 |
| ·背景 | 第8-10页 |
| ·生物学相关知识 | 第10-14页 |
| ·关键字介绍 | 第10-12页 |
| ·识别方法 | 第12-14页 |
| 第二章 CliClustering算法的相关研究 | 第14-20页 |
| ·图形建立 | 第15-16页 |
| ·寻找及合并团区域 | 第16-17页 |
| ·调整和精炼合并团区域中的序列 | 第17-18页 |
| ·实际表现和补充方法 | 第18-20页 |
| 第三章 其他相关算法的研究 | 第20-26页 |
| ·基于图的聚类 | 第20页 |
| ·MCL | 第20-23页 |
| ·MCL的聚类过程 | 第21-23页 |
| ·MCL的聚类 | 第23页 |
| ·AP算法简介 | 第23-24页 |
| ·MotifCut | 第24页 |
| ·几种算法的比较 | 第24-26页 |
| 第四章 测试数据及研究 | 第26-31页 |
| ·前期对几种算法的比对和参考的研究结果 | 第26-27页 |
| ·对实验所用数据库的分析 | 第27-28页 |
| ·实验及测试数据集的介绍 | 第28-31页 |
| ·结合位点及它们的背景序列 | 第28-29页 |
| ·人工生成数据库集 | 第29页 |
| ·通过遗传系谱印记法得到的数据集 | 第29-31页 |
| 第五章 用motif数据来评估与测试 | 第31-40页 |
| ·人工生成数据库 | 第31-36页 |
| ·核苷酸序列长度为8的模体 | 第31-33页 |
| ·核苷酸序列长度为16的模体 | 第33-36页 |
| ·真实数据 | 第36-38页 |
| ·从相同基因组中取得的序列 | 第36-37页 |
| ·真菌和细菌 | 第37-38页 |
| ·结论 | 第38-40页 |
| 参考文献 | 第40-44页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文及参与项目情况 | 第44-45页 |
| 致谢 | 第45页 |
