| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 第1章 绪论 | 第9-15页 |
| ·虚拟细胞 | 第9-11页 |
| ·虚拟细胞的概念 | 第9页 |
| ·现有虚拟细胞模型 | 第9-11页 |
| ·化学反应定量计算的方法与算法的研究现状 | 第11-12页 |
| ·研究的意义 | 第12-13页 |
| ·课题来源 | 第13页 |
| ·本文的主要工作和结构安排 | 第13-15页 |
| 第2章 确定型算法与随机型算法 | 第15-36页 |
| ·确定型算法 | 第15-18页 |
| ·确定型算法原理及实现 | 第15-17页 |
| ·确定型算法的改进 | 第17-18页 |
| ·简单碰撞理论与随机型算法概述 | 第18-21页 |
| ·Direct Method 算法 | 第21-22页 |
| ·First Reaction Method 算法 | 第22-23页 |
| ·Next Reaction Method 算法 | 第23-25页 |
| ·tau-leap Method 算法 | 第25-30页 |
| ·Langevin Method 算法 | 第30-32页 |
| ·tau-selection Method 算法 | 第32-33页 |
| ·非精确随机算法的改进 | 第33-34页 |
| ·本章小结 | 第34-36页 |
| 第3章 混合型算法 | 第36-46页 |
| ·静态分组混合型算法 | 第36-38页 |
| ·动态分组混合型算法 | 第38-45页 |
| ·Dynamic-fit 算法 | 第38-41页 |
| ·Dynamic-knn 算法 | 第41-45页 |
| ·本章小结 | 第45-46页 |
| 第4章 软件平台的体系结构设计与应用 | 第46-63页 |
| ·简单工厂模式 | 第46-47页 |
| ·化学反应定量计算软件平台 | 第47-51页 |
| ·简单化学反应模型 | 第51页 |
| ·简单化学反应模型的模拟结果 | 第51-54页 |
| ·热休克反应模型 | 第54-56页 |
| ·大肠杆菌热休克反应的机理 | 第56-59页 |
| ·大肠杆菌热休克反应模拟结果 | 第59-62页 |
| ·本章小结 | 第62-63页 |
| 结论 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-68页 |
| 哈尔滨工业大学硕士学位论文原创性声明 | 第68页 |
| 哈尔滨工业大学硕士学位论文使用授权书 | 第68页 |
| 哈尔滨工业大学硕士学位涉密论文管理 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69页 |