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基于结构解析的醛酮还原酶AKR5C3的底物选择性研究

摘要第1-6页
Abstract第6-10页
第1章 文献综述第10-20页
   ·氧化葡萄糖酸杆菌中酶的研究第10-12页
     ·膜结合脱氢酶的研究第10-11页
     ·胞质中氧化还原酶的研究第11-12页
   ·醛酮还原酶(AKRs)家族概述第12-16页
     ·醛酮还原酶家族分类第13-14页
     ·醛酮还原酶参与的反应类型第14-15页
     ·醛酮还原酶家族结构上的共性第15-16页
   ·蛋白质晶体的获得与晶体结构的分析第16-17页
     ·蛋白质分子结晶原理第16-17页
     ·蛋白质分子结晶技术第17页
     ·影响蛋白质结晶的因素第17页
   ·定点突变技术第17-19页
   ·本课题的研究意义和内容第19-20页
第2章 材料与方法第20-30页
   ·实验材料第20-21页
     ·菌株与质粒第20页
     ·主要试剂第20页
     ·培养基配方第20页
     ·主要仪器及设备第20-21页
     ·实验所用程序及软件第21页
   ·实验方法第21-30页
     ·野生型蛋白质Gox0644的表达和纯化第21-22页
     ·Gox0644晶体的获得第22页
     ·晶体结构的获得第22页
     ·晶体结构的建立第22页
     ·晶体结构分析第22页
     ·氨基酸序列分析第22页
     ·家族分类第22页
     ·氧化葡萄糖酸杆菌基因组的抽提第22-23页
     ·PCR引物设计第23页
     ·PCR反应体系第23页
     ·常规PCR扩增第23页
     ·质粒抽提第23-24页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第24页
     ·氨基酸定点突变第24-26页
     ·化学转化大肠杆菌感受态细胞第26页
     ·阳性克隆的筛选及验证第26-27页
     ·重组质粒突变后的诱导表达第27页
     ·粗酶液制备第27页
     ·SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)检测突变蛋白的表达第27-28页
     ·突变蛋白浓度测定第28-29页
     ·突变蛋白活性测试第29-30页
第3章 结果与讨论第30-57页
   ·Gox0644在醛酮还原酶超家族中的分类第30-31页
   ·Gox0644蛋白质晶体结构分析第31-34页
     ·整体结构概述第32页
     ·辅酶结合第32-33页
     ·底物结合第33-34页
   ·Gox0644与Gox1615的比较第34-39页
     ·氨基酸序列分析第35页
     ·酶学性质差异第35-37页
     ·晶体结构比较第37-39页
   ·突变位点的设计与定点突变第39-46页
     ·突变基因的获得第40-41页
     ·突变基因的测序验证第41-46页
   ·突变基因在大肠杆菌BL21中的表达第46-50页
     ·与催化四联体相关的突变体蛋白表达第46-48页
     ·与辅酶或底物结合位点相关突变体的蛋白表达第48-49页
     ·突变体对目的蛋白可溶性表达的影响第49-50页
   ·突变体的酶活测定分析第50-57页
     ·蛋白浓度测定第50页
     ·与催化四联体相关的突变体酶活分析第50-53页
     ·与辅酶结合位点相关的突变体酶活分析第53页
     ·与底物结合位点相关的突变体酶活分析第53-55页
     ·R192G、D53A突变体的酮还原活性分析第55-57页
第4章 结论与展望第57-58页
   ·结论第57页
   ·展望第57-58页
参考文献第58-63页
致谢第63页

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