| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-13页 |
| ·引言 | 第10-11页 |
| ·课题研究动态 | 第11页 |
| ·本文主要研究的内容 | 第11-12页 |
| ·文章的组织结构 | 第12-13页 |
| 第二章 免疫学及免疫匹配规则 | 第13-23页 |
| ·免疫学的基本理论 | 第13-16页 |
| ·免疫学的一些基本理论 | 第13-14页 |
| ·免疫系统的构成 | 第14-15页 |
| ·生物免疫系统的一些基本特点 | 第15-16页 |
| ·免疫细胞的激活门限 | 第16-17页 |
| ·免疫匹配规则 | 第17-23页 |
| ·匹配规则 | 第17-18页 |
| ·海明匹配规则(Hamming Match Rule) | 第18-19页 |
| ·连续r位匹配规则(r-Contiguous bits Rule) | 第19-23页 |
| 第三章 串匹配及KMP串匹配 | 第23-29页 |
| ·串匹配的定义 | 第23-24页 |
| ·一般的串匹配算法 | 第24-25页 |
| ·KMP串匹配算法 | 第25-29页 |
| 第四章 基于人工免疫的串匹配并行算法 | 第29-43页 |
| ·分布式环境与并行算法 | 第29-31页 |
| ·分布式环境 | 第29-30页 |
| ·并行算法基础 | 第30页 |
| ·程序并行性的条件 | 第30-31页 |
| ·并行算法的基本设计技术 | 第31-32页 |
| ·基于连续R位匹配规则的并行串匹配思想 | 第32-33页 |
| ·并行实现串匹配算法 | 第33-43页 |
| ·MPI简介 | 第33-37页 |
| ·算法的实现 | 第37-43页 |
| 第五章 并行计算及 CLUSTER机群 | 第43-57页 |
| ·并行计算概述 | 第43-44页 |
| ·并行计算机分类 | 第44-46页 |
| ·向量处理SIMD型计算机 | 第44-45页 |
| ·共享存储MIMD并行多处理机 | 第45-46页 |
| ·分布存储MIMD并行多处理机 | 第46页 |
| ·Cluster与MPP的区别 | 第46-48页 |
| ·Cluster机群环境构建 | 第48-57页 |
| ·硬件部署 | 第48-49页 |
| ·软件部署 | 第49-57页 |
| 第六章 串匹配概率与实验结果分析 | 第57-70页 |
| ·一般的连续R位匹配规则的匹配概率 | 第57-58页 |
| ·改进的连续R位匹配规则的匹配概率 | 第58-60页 |
| ·实验结果分析 | 第60-70页 |
| ·运行结果 | 第61-67页 |
| ·运算时间的分析 | 第67-68页 |
| ·匹配阈值r的分析 | 第68-69页 |
| ·可扩放性分析 | 第69-70页 |
| 第七章 总结 | 第70-72页 |
| 参考文献 | 第72-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文 | 第76页 |