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人源ADP核糖焦磷酸水解酶结构与功能的研究

摘要第1-5页
Abstract第5-10页
1. 引言第10-26页
   ·Nudix 水解酶超家族概况第10-18页
     ·大肠杆菌Nudix 水解酶第11-14页
     ·人源Nudix 水解酶第14-18页
   ·ADP 核糖焦磷酸水解酶亚家族概况第18-19页
   ·ADP 核糖焦磷酸水解酶亚家族的晶体结构第19-23页
     ·大肠杆菌ADP-Ribose 焦磷酸水解酶的晶体结构第19-22页
     ·人源ADP-Ribose 焦磷酸水解酶的晶体结构第22-23页
   ·ADP 核糖焦磷酸水解酶亚家族的催化反应机理第23-25页
   ·人源ADP 核糖焦磷酸水解酶的研究进展第25-26页
2. 材料和方法第26-39页
   ·材料和试剂第26-28页
     ·常用试剂和材料第26页
     ·菌株第26页
     ·仪器第26-28页
   ·方法第28-39页
     ·hNUDT5基因的克隆、表达载体和菌株构建第28页
     ·ΔhNUDT5突变体的构建第28-29页
     ·hNUDT5的表达和纯化第29-32页
       ·全长hNUDT5 N端6HIS tag的融合蛋白的表达纯化第29页
       ·C末端9氨基酸切除型的表达纯化第29-30页
       ·硒代甲硫氨酸取代的ΔhNUDT5的表达纯化第30-32页
       ·ΔhNUDT5(肽段1-210)突变体的表达纯化第32页
     ·蛋白质浓度测定方法第32页
     ·蛋白质纯度鉴定和浓缩第32页
     ·溶液中蛋白质分子尺寸和聚集状态分析第32-33页
     ·晶体生长-悬滴气相扩散法第33-36页
       ·结晶条件筛选第33页
       ·全长hNUDT5 N端6HIS tag融合蛋白晶体的生长和优化第33页
       ·ΔhNUDT5和底物ADPR二元复合物晶体的生长和优化第33-34页
       ·ΔhNUDT5和产物AMP及R5P复合物晶体的生长和优化第34页
       ·ΔhNUDT5和产物AMP及Mg三元复合物晶体2第34页
       ·ΔhNUDT5和底物类似物AMPCPR及Mg三元复合物晶体2第34-35页
       ·硒代ΔhNUDT5晶体的生长和优化第35-36页
     ·X-射线晶体衍射和数据处理第36-37页
       ·晶体的低温流冷冻保护(cryo cooli第36页
       ·数据收集和处理第36-37页
     ·结构解析第37-38页
       ·多波长反常散射法解析相位第37页
       ·初始模型的建立和结构精修第37-38页
         ·初始模型的建立第37页
         ·结构精修第37-38页
     ·hNUDT5 酶活力的检测第38-39页
3. 结果第39-62页
   ·全长hNUDT5 的表达、纯化和结晶第39-41页
   ·ΔhNUDT5 截短体的克隆表达、纯化和结晶第41-46页
   ·hNUDT5 各种晶体的结构解析第46-60页
     ·全长hNUDT5 apo形式晶体的结构第49-51页
     ·ΔhNUDT5和底物ADPR二元复合物晶体的结构第51-54页
     ·ΔhNUDT5和产物AMP及Mg三元复合物晶体的结构2第54-56页
     ·ΔhNUDT5和底物类似物AMPCPR及Mg三元复合物晶体的结构2第56-60页
   ·hNUDT5 酶活力的检测第60-62页
4. 讨论第62-73页
   ·hNUDT5 和大肠杆菌 ADP 核糖焦磷酸水解酶的比较第62-66页
   ·hNUDT5 和 hNUDT9 的比较第66-68页
   ·ΔhNUDT5 突变体的动力学研究第68-71页
     ·和底物嘌呤环识别相关氨基酸突变体的影响第68-69页
     ·和底物磷酸分子和核糖残基结合相关氨基酸突变体的影响第69-70页
     ·和底物活性相关氨基酸突变体的影响第70-71页
   ·hNUDT5 的催化反应机理模型第71-73页
5. 结论第73-74页
参考文献第74-86页
蛋白数据库入口 PDB 号第86-87页
附表第87-88页
发表文章目录第88-89页
致谢第89-90页

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