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基于Markov模型的昆虫杆状病毒基因组的进化研究

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-9页
第1章 绪论第9-15页
   ·生物信息学的研究背景和意义第9-10页
   ·蛋白质的结构和功能及蛋白质中k-子串的研究现状第10-12页
   ·生物序列图形表示的研究现状第12-13页
   ·本文的主要工作和内容第13-15页
第2章 Markov 模型及应用第15-30页
   ·Markov 模型第15-18页
   ·Markov 模型的应用第18-30页
     ·30 个昆虫杆状病毒简介第18-22页
     ·Markov 模型在30 个昆虫杆状病毒上的应用第22-30页
第3章 k-子串对生物分类的作用分析第30-49页
   ·杆状病毒的基因功能研究第30-32页
   ·实际出现次数较多的4-子串分析第32-43页
     ·重复出现的短串分析第32-33页
     ·单个物种中单独多次出现的短串分析第33-36页
     ·在部分物种中出现较多的短串分析第36-43页
   ·出现相对数较多的短串分析第43-49页
第4章 昆虫杆状病毒进化树的构造第49-57页
   ·进化树的构建方法第49-50页
   ·构建进化树工具PHYLIP 软件包简介第50-51页
   ·构建30 个昆虫杆状病毒的进化树第51-57页
     ·4-子串实际出现次数所对应的30 个物种的进化树第51-53页
     ·4-子串出现相对数所对应的30 个物种的进化树第53-57页
第5章 蛋白质序列相似性分析的一种新方法第57-71页
   ·蛋白质序列的图形表示第57-59页
   ·二阶差矩阵第59-60页
   ·蛋白质序列的相似性分析第60-65页
   ·新方法的应用第65-71页
第6章 总结与展望第71-72页
参考文献第72-77页
致谢第77-78页
攻读硕士学位期间的研究成果第78页

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