| 中文摘要 | 第1-10页 |
| 英文摘要 | 第10-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-36页 |
| 第一节 植物转座因子的研究进展 | 第14-28页 |
| 1． 植物转座因子研究的历史回顾 | 第14-15页 |
| 2． DNA转座因子 | 第15-19页 |
| 2．1 Ac／Ds家族 | 第15-16页 |
| 2．2 En／Spm家族 | 第16-17页 |
| 2．3 Mu转座子家族 | 第17-18页 |
| 2．4 Uq-Ruq家族 | 第18页 |
| 2．5 MITE转座因子 | 第18-19页 |
| 3． 逆转座因子 | 第19-21页 |
| 4． 植物转座因子在生物学中的应用 | 第21-22页 |
| 4．1 植物DNA转座子在生物学中的应用 | 第21页 |
| 4．2 植物逆转座子在生物学中的应用 | 第21-22页 |
| 参考文献 | 第22-28页 |
| 第二节 植物CACTA转座因子的研究进展 | 第28-36页 |
| 1． CACTA类转座子在多种植物中广泛存在，且具有特定的结构特点 | 第29-32页 |
| 2． 植物CACTA转座子符合统一的结构模式 | 第32页 |
| 3． 尚需值得研究的问题 | 第32页 |
| 参考文献 | 第32-36页 |
| 第二章 水稻Rim2 BAC亚克隆和结构分析 | 第36-52页 |
| 第一节 筛选水稻BAC文库及亚克隆 | 第36-39页 |
| 1． 材料和方法 | 第36-39页 |
| 1．1 材料 | 第36页 |
| 1．2 方法 | 第36-39页 |
| 1．2．1 探针制备 | 第36页 |
| 1．2．2 筛选水稻BAC文库 | 第36页 |
| 1．2．3 BAC文库亚克隆 | 第36-37页 |
| 1．2．4 DNA测序 | 第37页 |
| 1．2．5 质粒连接、转化和提纯 | 第37-39页 |
| 1．2．6 序列分析 | 第39页 |
| 2． Rim2亚克隆的获得 | 第39页 |
| 第二节 Rim2因子的结构分析 | 第39-41页 |
| 1． 具有Class2转座子结构特征的Rim2因子的发现 | 第39-40页 |
| 2． Rim2因子的结构模式以及与CACTA因子的比较 | 第40-41页 |
| 2．1 Rim2因子的结构 | 第40页 |
| 2．2 Rim2因子的结构模式 | 第40页 |
| 2．3 Rim2因子与CACTA因子的比较 | 第40-41页 |
| 2．4 关于Rim2因子结构的讨论 | 第41页 |
| 结论 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-43页 |
| 图表 | 第43-52页 |
| 第三章 Rim2因子在水稻基因组中的分布 | 第52-70页 |
| 第一节 Rim2因子在染色体上的分布（FISH） | 第52页 |
| 第二节 Rim2因子的数据库检索（Data mining） | 第52-53页 |
| 1． 同源因子的检索策略 | 第52页 |
| 2． Rim2因子的检索结果 | 第52-53页 |
| 第三节 Rim2因子在染色体上的定位作图 | 第53页 |
| 第四节 Rim2因子插入位点的分析 | 第53-54页 |
| 1． Rim2因子具有插入高AT含量区域的偏好性 | 第53页 |
| 2． Rim2因子具有插入基因内部的倾向 | 第53-54页 |
| 第五节 Rim2因子编码区为水稻基因组所特有 | 第54页 |
| 结论 | 第54页 |
| 参考文献 | 第54-56页 |
| 图表 | 第56-70页 |
| 第四章 Rim2因子的分子进化 | 第70-78页 |
| 第一节 Rim2因子家族的多态性 | 第70页 |
| 1． Rim2因子DNA序列的多态性 | 第70页 |
| 2． Rim2因子预测编码蛋白的多态性 | 第70页 |
| 第二节 Rim2因子曾经是活跃的 | 第70-72页 |
| 1． 某些高度同源的Rim2因子 | 第71页 |
| 2． Resite证据 | 第71-72页 |
| 结论 | 第72页 |
| 参考文献 | 第72-73页 |
| 图表 | 第73-78页 |
| 第五章 Rim2因子编码亚组在品种间的多态性及指纹分析 | 第78-93页 |
| 第一节 Rim2因子在不同水稻品种上的分布 | 第78-79页 |
| 1． 不同起源水稻品种基因组DNA的提取 | 第78页 |
| 2． Southern杂交 | 第78-79页 |
| 第二节 PCR检测不同水稻品种Rim2因子编码序列的多态性 | 第79页 |
| 1． 所用引物及反应条件 | 第79页 |
| 2． PCR结果 | 第79页 |
| 第三节 利用Rim2因子编码序列对水稻品种进行指纹分析 | 第79-80页 |
| 1． 水稻材料及引物 | 第79页 |
| 2． 结果和分析 | 第79-80页 |
| 结论 | 第80页 |
| 参考文献 | 第80-81页 |
| 图表 | 第81-93页 |
| 第六章 全文总结、讨论与展望 | 第93-101页 |
| 第一节 全文总结 | 第93-94页 |
| 第二节 全文讨论 | 第94-95页 |
| 1． Rim2因子是Class 2转座子在转录水平上受病原菌诱导的首次报道 | 第94页 |
| 2． Rim2因子是与CACTA转座子有明显差异的超级家族 | 第94页 |
| 3． Rim2因子参与基因组重建，影响基因结构与表达 | 第94-95页 |
| 4． Rim2超级家族的形成与环境胁迫 | 第95页 |
| 第三节 展望 | 第95-96页 |
| 1． Rim2因子超级家族的应用价值 | 第95-96页 |
| 2． Rim2因子的前瞻性研究 | 第96页 |
| 参考文献 | 第96-100页 |
| 实验中常用试剂的配制 | 第100-101页 |
| 缩略词、所用软件及有关网址 | 第101-104页 |
| 发表文章 | 第104-105页 |
| 致谢 | 第105页 |
