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猪PANE1基因的克隆,定位,表达谱与SNP分析以及PANE1基因和长非编码RNA基因与部分性状的关联分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-11页
1.文献综述第11-18页
   ·次要组织相容性抗原研究进展第11-15页
     ·次要组织相容性抗原的组织分布第11-12页
     ·次要组织相容性抗原的识别第12页
     ·次要组织相容性抗原的免疫优势第12-13页
     ·次要组织相容性抗原在GVHD/GVL中的作用第13-14页
     ·次要组织相容性抗原基因座第14页
     ·PANE1基因的研究现状第14-15页
   ·长非编码RNA第15-18页
     ·参与X染色体随机失活第16页
     ·参与基因组印记调控第16-17页
     ·参与形成RNA/蛋白质复合体第17页
     ·TncRNA的研究进展第17-18页
2.本研究的目的与意义第18-19页
3.材料和方法第19-30页
   ·材料与试剂第19-22页
     ·DNA样品和组织样品第19-20页
       ·DNA样品第19页
       ·组织样品第19页
       ·载体与菌株第19-20页
     ·主要药试剂及来源第20-21页
     ·常用试剂的配置第21页
     ·主要仪器设备第21页
     ·主要生物学数据库及生物学软件第21-22页
   ·试验方法第22-30页
     ·总RNA提取、完整性检测和DNase Ⅰ处理第22-23页
       ·总RNA提取采用两种方法第22-23页
       ·RNA的完整性检测第23页
       ·总RNA的无RNase的DNase-Ⅰ处理及其纯化第23页
       ·RNA的反转录第23页
     ·候选基因的克隆第23-26页
       ·猪PANE1基因EST-重叠群的构建第23-24页
       ·引物的设计第24页
       ·PCR扩增条件第24页
       ·PCR产物的纯化、克隆和测序第24-26页
     ·PANE1的RH定位第26-27页
     ·PANE1基因组织表达谱研究第27页
       ·总RNA的提取及RNA浓度与质量的检测第27页
       ·RT-PCR扩增体系第27页
     ·猪PANE1 SNP鉴定、分型和关联分析第27-30页
       ·引物设计第27页
       ·PCR扩增第27-28页
       ·试验猪群与测定性状第28页
       ·数据处理和统计分析第28-30页
4 结果第30-43页
   ·PANE1基因的克隆与序列分析第30-35页
     ·总RNA的提取与质量检测结果第30页
     ·RT-PCR扩增的结果第30-32页
       ·PANE1基因的进化分析第32-34页
     ·PANE1基因的表达特征分析第34-35页
   ·猪PANE1基因染色体的精细定位第35-37页
   ·猪PANE1基因的组织表达结果第37-38页
   ·猪PANE1基因多态及性状关联分析第38-43页
     ·SNP检测与分型第38页
     ·PANE1基因在不同猪群中的多态性分析结果第38-39页
     ·PANE1基因与胴体性状的关联分析第39-40页
     ·PANE1基因与免疫性状的关联分析第40页
     ·TncRNA基因在小型猪猪群中多态性分析结果第40-42页
     ·TncRNA基因与免疫性状的关联分析第42-43页
5.讨论第43-48页
   ·关于新基因的克隆与生物信息学分析第43-44页
     ·关于新基因的克隆第43页
     ·关于新基因的生物信息学分析第43-44页
   ·关于新基因定位第44-45页
   ·关于基因的组织表达谱第45页
   ·关于SNPs与性状的关联分析第45-48页
     ·猪PANE1基因多态与性状关联分析第46-47页
     ·猪TncRNA基因多态与免疫性状的关联分析第47-48页
6 小结第48-50页
   ·本研究获得的结果第48页
   ·本研究的创新点第48-49页
   ·本研究的不足之处第49页
   ·下一步值得研究的工作第49-50页
参考文献第50-57页
致谢第57-58页
附录第58-61页

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