| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-28页 |
| ·酸性矿坑水的来源及化学性质 | 第10-11页 |
| ·酸性矿坑水的微生物多样性 | 第11-19页 |
| ·自养和异养生命形式及其分类 | 第11-15页 |
| ·AMD环境中嗜酸性微生物的基本特征 | 第15页 |
| ·AMD环境中嗜酸性微生物的能量代谢 | 第15-17页 |
| ·AMD环境中嗜酸性微生物的群落结构及其相互关系 | 第17-19页 |
| ·环境微生物多样性的基因组学分析方法及其优缺点 | 第19-22页 |
| ·基因指纹图谱法 | 第19-21页 |
| ·核酸分子杂交法 | 第21页 |
| ·定量PCR分析法 | 第21-22页 |
| ·基因序列系统发育分析法 | 第22页 |
| ·基因芯片技术在环境微生物群落多样性及功能研究中的应用 | 第22-27页 |
| ·用于环境微生物研究的基因芯片 | 第23-25页 |
| ·基因芯片在环境微生物研究中应用 | 第25-26页 |
| ·基因芯片在环境微生物研究中应用的技术难点 | 第26-27页 |
| ·本文的主要研究内容 | 第27页 |
| ·论文课题来源 | 第27-28页 |
| 第二章 群落基因组芯片的构建 | 第28-36页 |
| ·引言 | 第28-29页 |
| ·材料与方法 | 第29-34页 |
| ·菌株与培养基 | 第29页 |
| ·基因组DNA的提取与纯化 | 第29-32页 |
| ·基因组DNA的定量 | 第32-33页 |
| ·群落基因组芯片的设计、构建与后处理 | 第33-34页 |
| ·小结 | 第34-36页 |
| 第三章 群落基因组芯片的评估 | 第36-45页 |
| ·引言 | 第36页 |
| ·基因组DNA的荧光标记、芯片杂交、图像处理和数据分析 | 第36-38页 |
| ·基因组DNA的荧光标记 | 第36-37页 |
| ·芯片杂交 | 第37页 |
| ·图像处理和数据分析 | 第37-38页 |
| ·群落基因组芯片的杂交温度优化 | 第38-39页 |
| ·群落基因组芯片的杂交特异性 | 第39-40页 |
| ·群落基因组芯片的检测灵敏度 | 第40-41页 |
| ·群落基因组芯片的定量性能 | 第41-43页 |
| ·讨论与小结 | 第43-45页 |
| 第四章 群落基因组芯片在酸性环境微生物群落分析中的应用 | 第45-50页 |
| ·引言 | 第45页 |
| ·材料与方法 | 第45-46页 |
| ·环境样品来源 | 第45页 |
| ·环境样品基因组DNA的提取与纯化 | 第45-46页 |
| ·DNA的荧光标记、芯片杂交、图像处理和数据分析 | 第46页 |
| ·结果与分析 | 第46-48页 |
| ·讨论与小结 | 第48-50页 |
| 第五章 结论 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-62页 |
| 致谢 | 第62-63页 |
| 攻读学位期间主要研究成果 | 第63页 |
