| 中文摘要 | 第1-10页 |
| ABSTRACT | 第10-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-35页 |
| 1 遗传多样性分析 | 第13-18页 |
| ·遗传多样性的概念 | 第13页 |
| ·遗传多样性研究意义 | 第13-14页 |
| ·有利于揭示群体间的遗传分化和系统进化关系 | 第13页 |
| ·有利于揭示群体的遗传结构 | 第13-14页 |
| ·有利于生物遗传改良和育种 | 第14页 |
| ·有利于珍稀濒危物种保护 | 第14页 |
| ·遗传多样性的研究方法 | 第14-18页 |
| ·形态学 | 第14页 |
| ·细胞遗传学方法 | 第14-15页 |
| ·生化标记方法 | 第15页 |
| ·分子生物学方法 | 第15-18页 |
| ·鱼类遗传多样性概况 | 第18页 |
| 2 形态学分析在鱼类遗传多样性研究中的应用 | 第18-21页 |
| ·鱼类形态学研究的主要内容 | 第18页 |
| ·形态学研究的主要方法 | 第18-19页 |
| ·主成分分析 | 第18-19页 |
| ·判别分析 | 第19页 |
| ·聚类分析 | 第19页 |
| ·差异分析 | 第19页 |
| ·鱼类形态学的遗传多样性研究概况 | 第19-21页 |
| ·通过形态学差异研究鱼类的遗传结构和育种效果检测 | 第19-20页 |
| ·通过形态学差异进行物种有效性分析 | 第20页 |
| ·通过形态学差异分析物种亲缘关系 | 第20-21页 |
| 3 微卫星标记在鱼类遗传多样性研究中的应用 | 第21-28页 |
| ·微卫星序列获得 | 第21-23页 |
| ·构建小片段基因组文库 | 第21-22页 |
| ·PIMA 法（PCR Isolation of Microsatellite Array） | 第22页 |
| ·富集法 | 第22页 |
| ·利用网络信息获得 | 第22页 |
| ·借助亲缘关系相近物种的微卫星序列 | 第22-23页 |
| ·微卫星标记主要分析指标 | 第23-25页 |
| ·群体杂合度（Heterozygosity, H） | 第23页 |
| ·多态信息含量（Polymorphism Information Content, PIC） | 第23页 |
| ·有效等位基因数（Effective number of alleles, Ne） | 第23页 |
| ·等位基因频率（Pi） | 第23-24页 |
| ·Hardy-Weinberg 平衡的χ~2 检验 | 第24页 |
| ·遗传距离（Genetic distance, Gd） | 第24页 |
| ·F-statistic 固定指数 | 第24-25页 |
| ·群体每代迁移数（Number of migrants per generateon, Nm） | 第25页 |
| ·微卫星标记在鱼类遗传育种中的应用 | 第25-28页 |
| ·物种遗传多样性分析 | 第25-26页 |
| ·物种遗传结构分析 | 第26-27页 |
| ·亲缘关系分析和个体识别 | 第27页 |
| ·遗传图谱建立和数量性状基因的QTL 定位 | 第27-28页 |
| 4 线粒体控制区（MTDNA D-LOOP）在鱼类遗传多样性中的应用 | 第28-33页 |
| ·鱼类线粒体控制区的结构和特点 | 第28页 |
| ·鱼类线粒体控制区的检测方法 | 第28-29页 |
| ·内切酶图谱法 | 第28-29页 |
| ·限制性内切酶片段长度多态法（RFLP） | 第29页 |
| ·PCR-RFLP 法 | 第29页 |
| ·探针法 | 第29页 |
| ·直接测序法 | 第29页 |
| ·MTDNA D-LOOP 方法主要分析指标 | 第29-30页 |
| ·核苷酸序列多态性 | 第29-30页 |
| ·核苷酸替代平均数目 | 第30页 |
| ·UPGMA 和NJ 系统树 | 第30页 |
| ·MTDNA D-LOOP 方法在鱼类遗传遗传多样性研究中的应用 | 第30-33页 |
| ·遗传差异和遗传结构分析 | 第30-31页 |
| ·物种鉴定和亲缘关系分析 | 第31-32页 |
| ·系统发育与分化分析 | 第32-33页 |
| 5 长鳍鲤、锦鲤和龙凤鲤起源及研究现状 | 第33-34页 |
| ·长鳍鲤、锦鲤和龙凤鲤的种属概况 | 第33页 |
| ·3 种鲤鱼的起源 | 第33页 |
| ·3 种鲤鱼的研究现状 | 第33-34页 |
| 6 本研究的目的和意义 | 第34-35页 |
| 第二章 龙凤鲤形态差异的比较研究 | 第35-49页 |
| 1 材料和方法 | 第35-38页 |
| ·实验材料 | 第35-36页 |
| ·样本采集 | 第35-36页 |
| ·实验试剂和器材 | 第36页 |
| ·实验方法 | 第36-38页 |
| ·捕鱼 | 第36页 |
| ·麻醉 | 第36页 |
| ·形态指标测量 | 第36-37页 |
| ·统计分析 | 第37-38页 |
| 2 结果 | 第38-46页 |
| ·形态特征比较和T 检验 | 第38页 |
| ·主成分分析 | 第38-40页 |
| ·判别分析 | 第40-45页 |
| ·差异系数（C.D）检验 | 第45-46页 |
| 3 讨论 | 第46-49页 |
| ·形态特征比较和T 检验结果 | 第46页 |
| ·主成分分析结果 | 第46-47页 |
| ·判别分析结果 | 第47-48页 |
| ·差异系数检验结果 | 第48-49页 |
| 第三章 利用微卫星标记分析长鳍鲤、锦鲤和龙凤鲤的遗传多样性 | 第49-64页 |
| 1 材料和方法 | 第49-53页 |
| ·实验材料 | 第49-52页 |
| ·样本采集 | 第49-50页 |
| ·主要试剂和配制 | 第50页 |
| ·主要仪器 | 第50-51页 |
| ·微卫星引物 | 第51-52页 |
| ·实验方法 | 第52-53页 |
| ·基因组DNA 提取 | 第52-53页 |
| ·PCR 扩增和产物检测 | 第53页 |
| ·统计方法 | 第53页 |
| 2 结果与分析 | 第53-59页 |
| ·PCR 扩增结果 | 第53-54页 |
| ·遗传多样性分析 | 第54-58页 |
| ·HARDY-WEINBERG 平衡估算和遗传分化分析 | 第58页 |
| ·遗传距离及基因流NM 分析 | 第58-59页 |
| 3 讨论 | 第59-64页 |
| ·3 个鲤鱼群体的遗传多样性分析 | 第59-60页 |
| ·HARDY-WEINBERG 平衡估算和遗传分化分析 | 第60-61页 |
| ·群体间的亲缘关系分析 | 第61-62页 |
| ·微卫星标记 | 第62页 |
| ·3 种鲤鱼的选育 | 第62-64页 |
| 第四章 长鳍鲤、锦鲤和龙凤鲤MTDNA D-LOOP 区遗传多样性及亲缘关系的研究 | 第64-81页 |
| 1 材料和方法 | 第64-66页 |
| ·实验材料 | 第64-65页 |
| ·样品采集（同第3 章） | 第64页 |
| ·主要实验试剂和仪器 | 第64-65页 |
| ·引物 | 第65页 |
| ·实验方法 | 第65-66页 |
| ·基因组DNA 提取同第三章 | 第65页 |
| ·PCR 扩增 | 第65页 |
| ·产物纯化与切胶回收 | 第65-66页 |
| ·测序 | 第66页 |
| ·统计分析 | 第66页 |
| 2 结果与分析 | 第66-76页 |
| ·DNA 提取、PCR 扩增产物及回收DNA 检测 | 第66-68页 |
| ·3 个群体MTDNA D-LOOP 区部分序列的序列长度和碱基组成 | 第68页 |
| ·核苷酸序列多态位点变异 | 第68-73页 |
| ·3 个群体单倍型分析 | 第73页 |
| ·3 个群体的核苷酸多样度 | 第73-74页 |
| ·3 群体遗传距离和系统树构建 | 第74-76页 |
| 3 讨论 | 第76-81页 |
| ·3 种鲤鱼MTDNA D-LOOP 区的终止序列结构 | 第76页 |
| ·3 个群体MTDNA D-LOOP 区的序列分析 | 第76-78页 |
| ·3 个群体的单倍型和核苷酸多样度分析 | 第78-79页 |
| ·MTDNA D-LOOP 标记方法分析 | 第79-81页 |
| 全文结论 | 第81-83页 |
| 参考文献 | 第83-93页 |
| 致谢 | 第93-95页 |
| 攻读硕士期间发表的学术论文 | 第95页 |
