| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-23页 |
| §1.1 概述 | 第11-13页 |
| §1.2 遗传学发展简史与遗传流行病学 | 第13-15页 |
| §1.3 关联分析的重要性与研究现状 | 第15-21页 |
| §1.3.1 单倍型分析的重要性 | 第15-17页 |
| §1.3.2 关联分析的研究现状 | 第17-19页 |
| §1.3.3 单倍型关联分析的研究现状 | 第19-21页 |
| §1.4 本文的主要工作和结构安排 | 第21-23页 |
| 第二章 遗传学基本概念 | 第23-31页 |
| §2.1 概述 | 第23页 |
| §2.2 遗传学基本术语与部分统计学描述 | 第23-30页 |
| §2.3 说明与小结 | 第30-31页 |
| 第三章 基于单倍型聚类的关联分析方法 | 第31-57页 |
| §3.1 引言 | 第32-33页 |
| §3.2 一种有效的聚类算法仿射传播算法 | 第33-34页 |
| §3.3 单倍型相似性度量的提出 | 第34-37页 |
| §3.3.1 已有的单倍型相似性度量 | 第34-35页 |
| §3.3.2 一个例子 | 第35-36页 |
| §3.3.3 EG距离的提出 | 第36-37页 |
| §3.4 聚类后的单倍型关联分析 | 第37-40页 |
| §3.4.1 Logistic回归模型 | 第38-39页 |
| §3.4.2 检验与最优聚类 | 第39-40页 |
| §3.5 模拟研究 | 第40-52页 |
| §3.5.1 模拟数据集的产生 | 第40-41页 |
| §3.5.2 模拟设计 | 第41-42页 |
| §3.5.3 对原始数据集的预处理 | 第42-43页 |
| §3.5.4 APEG与已有方法的比较研究 | 第43-47页 |
| §3.5.5 考察APEG对参数的依赖程度 | 第47-52页 |
| §3.6 基于真实数据的比较研究 | 第52-54页 |
| §3.7 讨论 | 第54-57页 |
| 第四章 单倍型关联分析的非参数检验方法 | 第57-83页 |
| §4.1 引言 | 第57-59页 |
| §4.2 基于U-统计量的单倍型关联分析的U-EGS方法 | 第59-63页 |
| §4.2.1 组内U-统计量的提出 | 第60-61页 |
| §4.2.2 单倍型关联分析中常见的几种核函数 | 第61-62页 |
| §4.2.3 新的核函数的提出 | 第62-63页 |
| §4.3 渐进分布的研究 | 第63-71页 |
| §4.3.1 位点间独立的情况 | 第63-65页 |
| §4.3.2 位点间满足一阶Markov的情况 | 第65-71页 |
| §4.4 模拟与模拟结果 | 第71-78页 |
| §4.4.1 模拟设计 | 第71-73页 |
| §4.4.2 模拟结果 | 第73-78页 |
| §4.5 讨论 | 第78-83页 |
| 结论 | 第83-85页 |
| 附录 | 第85-93页 |
| 参考文献 | 第93-101页 |
| 在学期间公开发表(投稿)论文情况 | 第101-102页 |
| 致谢 | 第102页 |