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番茄中microRNA的功能和应用研究

缩略词表第1-9页
摘要第9-10页
Abstract第10-12页
第一章 前言第12-33页
 1 从反义RNA到人工miRNA的植物基因沉默技术革新第12-24页
   ·基因沉默的发现与第一代基因沉默技术第13-16页
   ·microRNA的发现与人工microRNA技术第16-21页
   ·人工ta-siRNA技术第21-22页
     ·下一代基因沉默技术第22-23页
   ·展望第23-24页
 2 植物抗病毒基因工程第24-27页
   ·蛋白质介导的病毒抗性第24-25页
   ·RNA介导的病毒抗性第25-26页
   ·微卫星RNA介导的病毒抗性第26页
   ·非病毒来源的抗性第26-27页
 3 microRNA与植物发育第27-29页
   ·microRNA与分生组织第27-28页
   ·microRNA调控叶片发育第28页
   ·microRNA与根的发育第28页
   ·microRNA与花器官的发育第28-29页
   ·microRNA与花期第29页
 4 microRNA与植物逆境应答第29-31页
   ·microRNA与过氧化物的清除第29-30页
   ·microRNA与干旱逆境第30页
   ·microRNA调控矿物营养平衡第30-31页
 5 本研究的目的和意义第31-33页
第二章 利用人工miRNA培育抗病毒番茄第33-75页
 1 前言第33-35页
 2 材料与方法第35-43页
   ·植物和病毒材料第35页
   ·菌株和质粒第35页
   ·人工miRNA植物表达载体的构建第35-36页
   ·GFP-Target报告基因表达载体的构建第36页
   ·番茄的遗传转化第36-37页
   ·转基因植株的PCR检测第37-38页
   ·Southern杂交第38页
   ·RNA提取和Northern杂交第38-39页
   ·内源疑似靶基因以及病毒RNA的RT-PCR分析第39-41页
   ·TYLCV的PCR检测第41页
   ·嫁接第41-42页
   ·病毒接种第42页
   ·ELISA检测CMV病毒的积累第42-43页
   ·农杆菌渗入烟草叶片瞬时表达以及GFP荧光检测第43页
 3 结果与分析第43-69页
   ·靶位点的选择第43-46页
   ·人工miRNA植物表达载体的构建第46-51页
   ·人工miRNA的干涉功能检测第51-54页
   ·转基因番茄的获得和分子检测第54-56页
   ·转基因植物的CMV抗性检测第56-60页
   ·嫁接接种检测人工miRNA对病毒的持久抗性第60-62页
   ·人工miRNA对植物的保护是细胞自主性的第62-63页
   ·多种病毒复合侵染情况下人工miRNA对植物的保护能力第63-66页
   ·人工miRNA的靶标特异性第66-67页
   ·转基因株系在CMV感染和正常生长状况下的果实大小和产量分析第67-69页
 4 讨论第69-75页
   ·同时敲出多个基因产生更高的抗病效率第69页
   ·针对3’UTR保守区产生广谱抗性第69页
   ·amiR-2a/b阻遏病毒侵染途径的多个步骤第69-71页
   ·靶向3'UTR与靶向编码区的人工miRNA可能具有不同的抗病毒途径第71-72页
   ·人工miRNA在植物中细胞自主性作用方式的理论与现实意义第72-73页
   ·人工miRNA抗病毒功能不受非目标病毒入侵的影响是一个重要优势第73-74页
   ·人工miRNA可以避免脱靶现象第74-75页
第三章 超表达sly-miR169提高番茄植株耐旱性第75-93页
 1 前言第75-76页
 2 材料与方法第76-80页
   ·植物材料与栽培条件第76页
   ·植物表达载体的构建与番茄的遗传转化第76页
   ·RNA抽提与Northern杂交第76页
   ·半定量RT-PCR第76-77页
   ·Real-time RT-PCR第77页
   ·干旱处理第77-78页
   ·气孔开度测量第78页
   ·气孔导度和蒸腾速率的测定第78页
   ·离体叶片失水率测定第78页
   ·离体枝条吸水速率测量第78-79页
   ·NaCl处理下发芽实验第79页
   ·生物信息学分析第79页
   ·数据处理第79-80页
 3 结果与分析第80-90页
   ·番茄中的miR169家族及其靶基因第80页
   ·Sly-miR169靶基因的组织表达谱第80-81页
   ·干旱处理时Sly-miR169的表达上升而靶基因的表达下降第81-83页
   ·在番茄中超表达Sly-miR169可以降低SlNF-YA1/2/3和SlMRP1的RNA积累第83-87页
   ·转基因植株抗旱性增强第87页
   ·转基因植株气孔开度缩小蒸腾速度降低第87-89页
   ·转基因植株对盐处理更敏感第89-90页
   ·MRP1是miR169的一个古老但处于演化中的靶基因第90页
 4 讨论第90-93页
   ·35S-miR169番茄可能由于保卫细胞离子运输降低影响气孔运动第90-92页
   ·通过调控sly-miR169提高植物水分利用率的可能性第92-93页
第四章 Sly-miR156调控番茄生长发育第93-112页
 1 前言第93-94页
 2 材料与方法第94-97页
   ·植物材料与栽培环境第94页
   ·载体构建与植物的遗传转化第94-95页
   ·RNA抽提和Northern杂交第95页
   ·半定量RT-PCR和real-time RT-PCR第95页
   ·生物信息学分析和数据处理第95-97页
 3 结果与分析第97-109页
   ·Sly-miR156及其靶基因第97-101页
   ·MiR156在番茄中的组织表达谱并在番茄中超量表达sly-miR156a第101-104页
   ·超表达sly-miR156a的番茄植株产生多种生长发育和生殖发育上的表型变化第104-106页
   ·靶基因在野生型和转基因番茄中的表达谱第106-108页
   ·转基因植物中SFT基因的表达下降第108-109页
 4 讨论第109-112页
   ·miRNA156在调节植物发育过程中功能的保守性和物种特异性第109页
   ·miR156可能通过调控SFT控制花序结构和开花时间第109-110页
   ·Sly-miR156与番茄果实成熟第110页
   ·Sly-miR156与番茄果实大小和产量第110-111页
   ·Sly-miR156与髓的发育和气生根的形成第111页
   ·Sly-miR156的分子调控和环境影响第111-112页
结语第112-114页
参考文献第114-130页
附录第130-132页
致谢第132页

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