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荧光光谱技术在生物大分子相互作用以及解旋酶酶促反应研究中的应用

论文摘要第1-8页
ABSTRACT第8-10页
致谢第10-12页
REMERCIEMENTS第12-15页
TABLE AND MATERIALS第15-17页
TABLE OF FIGURES第17-18页
ABREVIATIONS第18-21页
摘要第21-29页
PREFACE第29-33页
INTRODUCTION_ON FLUORESCENCE第33-75页
 Ⅰ.1 General Definitions:Characteristics of fluorescence and the fluorescence microscope第35-50页
  Ⅰ.1.1 Photoluminescence process第35-38页
  Ⅰ.1.2 Steady-state characteristics of fluorescence emission第38-48页
  Ⅰ.1.3 Time-resolved characteristics of fluorescence emission,fuorescence lifetime第48-50页
 Ⅰ.2 Fluorescence anisotropy and instrumental considerations第50-59页
  Ⅰ.2.1 Steady-state fluorescence anisotropy:definition andprinciple第50-53页
  Ⅰ.2.2 Time-resolved fluorescence anisotropy:definition and principle第53-54页
  Ⅰ.2.3 Instrumentation and design of pulse fluorometers第54-57页
  Ⅰ.2.4 Examples of application of fluorescence anisotropy in the field of biology第57-59页
 Ⅰ.3 Fluorescence correlation spectroscopy第59-75页
  Ⅰ.3.1 Fluorescence correlation spectroscopy:definition第60-63页
  Ⅰ.3.2 Conceptual basis of Fluorescence correlation spectroscopy and determination of diffusion constant第63-64页
  Ⅰ.3.3 Fluorescence cross-correlation spectroscopy:definition and conceptual basis第64-66页
  Ⅰ.3.4 Instrumentations and methods of FCS and FCCS第66-72页
  Ⅰ.3.5 Example of application of FCS and FCCS in the field of biology第72-75页
MOTIVATION AND OBJECTIVE第75-78页
MATERIAL AND METHODES第78-89页
 Ⅱ.1 Reagents and buffers第79-81页
  Ⅱ.1.1 HIV integrase related buffers第79-80页
  Ⅱ.1.2 RecQ helicase related buffers第80-81页
 Ⅱ.2 Protein and oligonucleotides purification第81-84页
  Ⅱ.2.1 HIV integrase purification第81-82页
  Ⅱ.2.2 RecQ helicase purification第82-83页
  Ⅱ.2.3 Oligonucleotides purification and preparation第83-84页
 Ⅱ.3 Enzymatic activity measurements第84-89页
  Ⅱ.3.1 Steady-state fluorescence based activity measurements第84-85页
  Ⅱ.3.2 Fluorescence cross-correlation measurements第85-88页
  Ⅱ.3.3 Quantified maximum entropy method of time-resolved fluorescence data(MEM)第88-89页
APPLICATION OF FCCS TO STUDY THE ENZYMATIC KINETICS OF RECQ HELICASE第89-149页
 Ⅲ.1 General introduction to the relationship between DNA and helicases第90-102页
  Ⅲ.1.1 Structure and function of DNA第90-92页
  Ⅲ.1.2 The function of helicase in cellular processes involved with DNA第92-95页
  Ⅲ.1.3 Helicase characteristics and helicase deficiency diseases第95-102页
 Ⅲ.2 E.Coli RecQ Helicase Unwinding Activity as Monitored by Dual Color Fluorescence Correlation Spectroscopy第102-131页
  Ⅲ.2.1 Introduction第102-103页
  Ⅲ.2.2 Manuscript第103-128页
  Ⅲ.2.3 Conclusion第128-131页
 Ⅲ.3 Human RecQ5β Unwinding and Strand-Annealing Activity as Monitored by Dual Color Fluorescence Correlation Spectroscopy第131-149页
  Ⅲ.3.1 INTRODUCTION第131-132页
  Ⅲ.3.2 MATERIALS AND METHODS第132-133页
  Ⅲ.3.3 RESULTS第133-137页
  Ⅲ.3.4 DISCUSSION第137-140页
  Ⅲ.3.5 PROSPECTIVE第140-141页
  Ⅲ.3.6 FIG URES AND LEGENDS第141-149页
APPLICATION OF FLUORESCENCE ANISOTROPY TO STUDY ENZYMATIC KINETICS OF HIV-IN第149-177页
 Ⅳ.1 The basic biology of retroviruses第150-164页
  Ⅳ.1.1 Structural taxonomic for the family of retroviruses第150-152页
  Ⅳ.1.2 Replication cycle and pathology of HIV-virus第152-155页
  Ⅳ.1.3 Introduction to anti-retroviral treatments第155-158页
  Ⅳ.1.4 Structure and function of HIV-integrase第158-164页
 Ⅳ.2 The G140S mutation in HIV integrases from raltegravir-resistant patients rescues catalytic defect due to the resistance Q148H mutation第164-177页
  Ⅳ.2.1 Introduction第164-165页
  Ⅳ.2.2 Manuscript第165-175页
  Ⅳ.2.3 Conclusion第175-177页
APPLICATION OF PHOTOLUMINESCENCE DECAY TO CHRACTERIZE QDS FLUORESCENCE PROPERTIES第177-208页
 Ⅴ.1 General introduction to the semiconductor nanoparticles第178-189页
  Ⅴ.1.1 Definition of quantum dots第178-181页
  Ⅴ.1.2 Spectral properties of quantum dots第181-182页
  Ⅴ.1.3 Solubilization and biological applications of quantum dots第182-189页
 Ⅴ.2 Multi-exponential Photoluminescence Decay of CdTe Quantum Dots upon One and Two Photon Excitation第189-208页
  Ⅴ.2.1 INTRODUCTION第189-190页
  Ⅴ.2.2 MATERIALS AND METHODS第190-194页
  Ⅴ.2.3 RESULTS第194-197页
  Ⅴ.2.4 DISCUSSION AND CONCLUSION第197-199页
  Ⅴ.2.5 PROSPECTIVE第199页
  Ⅴ.2.6 FIGURES AND LEGENDS第199-208页
GENERAL CONCLUSION第208-213页
REFERENCES第213-230页

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