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MeJA和NO诱导冷藏黄瓜抗冷性与抗氧化防御系统的关系

摘要第3-5页
abstract第5-7页
缩略词表第8-18页
第1章 前言第18-32页
    1.1 研究背景第18-19页
    1.2 国内外研究进展第19-30页
        1.2.1 植物冷害的生理机制第19-21页
            1.2.1.1 冷害对膜系统的影响第19-20页
            1.2.1.2 冷害对抗氧化能力和渗透调节物质的影响第20-21页
        1.2.2 植物冷害的分子机制第21-22页
        1.2.3 低温信号转导及不同信号途径的“Cross-talk”第22-27页
        1.2.4 与不同信号途径的“交谈”(Cross-talk)第27-28页
            1.2.4.1 抗冷性与抗氧化防御系统的关系第27-28页
        1.2.5 NO和MeJA在园艺作物诱导抗冷性中的研究进展第28-29页
        1.2.6 NO与MeJA之间的相互关系第29-30页
    1.3 研究目的意义第30-32页
第2章 MeJA和NO诱导黄瓜抗冷性的生理机理第32-50页
    2.1 引言第32页
    2.2 材料与方法第32-37页
        2.2.1 试验材料与处理第32-33页
            2.2.1.1 供试材料第32页
            2.2.1.2 试验处理第32-33页
        2.2.2 表观指标的观察及生理指标的测定第33-36页
            2.2.2.1 次生病害指数观察第33页
            2.2.2.2 果实失重率的测定第33-34页
            2.2.2.3 相对电导率测定第34页
            2.2.2.4 丙二醛MDA含量测定第34页
            2.2.2.5 活性氧及防御酶活性的测定第34-36页
                2.2.2.5.1 过氧化氢(H_2O_2)含量的测定第34-35页
                2.2.2.5.2 CAT活性测定第35页
                2.2.2.5.3 POD活性测定第35页
                2.2.2.5.4 SOD活性测定第35页
                2.2.2.5.5 PPO活性的测定第35页
                2.2.2.5.6 超氧阴离子(O_2~(·?))产生速率的测定第35-36页
                2.2.2.5.7 PAL活性的测定第36页
        2.2.3 主要试剂及仪器设备第36页
            2.2.3.1 主要试剂第36页
            2.2.3.2 主要仪器设备第36页
        2.2.4 数据分析第36-37页
    2.3 结果与分析第37-48页
        2.3.1 不同贮藏温度对黄瓜采后寿命的影响第37-38页
        2.3.2 低温冷害条件下不同贮藏时间对采后黄瓜贮藏寿命的影响第38-40页
        2.3.3 不同浓度MeJA和SNP对冷藏黄瓜抗冷性的影响第40-42页
            2.3.3.1 不同浓度MeJA和SNP对相对电导率的影响第40页
            2.3.3.2 不同浓度MeJA和SNP对失重率的影响第40-41页
            2.3.3.3 不同浓度MeJA和SNP对次生病情指数的影响第41-42页
        2.3.4 MeJA和SNP处理减轻黄瓜冷害的生理机理第42-48页
            2.3.4.1 MeJA和SNP处理对冷藏黄瓜膜系统的影响第42-43页
            2.3.4.2 MeJA和SNP处理对冷藏黄瓜失重率的影响第43-44页
            2.3.4.3 MeJA和SNP处理对冷藏黄瓜次生病情指数的影响第44页
            2.3.4.4 MeJA和SNP处理对冷藏黄瓜活性氧及防御酶活性的影响第44-48页
                2.3.4.4.1 对O_2~(·?)产生速率的影响第44-45页
                2.3.4.4.2 对H_2O_2含量的影响第45-46页
                2.3.4.4.3 对CAT活性的影响第46页
                2.3.4.4.4 对POD活性的影响第46-47页
                2.3.4.4.5 对SOD活性的影响第47页
                2.3.4.4.6 对PPO活性的影响第47-48页
                2.3.4.4.7 对PAL活性的影响第48页
    2.4 小结第48-50页
第3章 H_2O_2在MeJA和NO诱导黄瓜抗冷性中的作用第50-70页
    3.1 引言第50-51页
    3.2 材料与方法第51-60页
        3.2.1 供试材料第51页
        3.2.2 试验处理第51页
        3.2.3 表观指标的观察及生理指标的测定第51-52页
            3.2.3.1 次生病害指数观察第51页
            3.2.3.2 相对电导率测定第51-52页
            3.2.3.3 活性氧及防御酶活性的测定第52页
                3.2.3.3.1 过氧化氢(H_2O_2)含量的测定第52页
                3.2.3.3.2 CAT活性测定第52页
        3.2.4 黄瓜CsCAT1、CsCAT3表达检测第52-55页
            3.2.4.1 黄瓜果皮总RNA的提取第52页
            3.2.4.2 总RNA浓度的测定及完整性检测第52-53页
            3.2.4.3 总RNA的纯化及检测第53页
            3.2.4.4 cDNA第一链的合成第53-54页
            3.2.4.5 荧光定量PCR的引物设计和筛选第54-55页
        3.2.5 黄瓜果皮蛋白样品的制备与Western blot第55-59页
            3.2.5.1 黄瓜果皮总蛋白的提取第55-56页
            3.2.5.2 蛋白定量第56页
            3.2.5.3 电泳第56页
            3.2.5.4 染色和脱色第56页
            3.2.5.5 Western blot杂交步骤第56-57页
            3.2.5.6 制备黄瓜CsCAT3蛋白抗体第57-59页
                3.2.5.6.1 原核表达载体的构建第57-59页
                3.2.5.6.2 蛋白的表达及可溶性分析第59页
                3.2.5.6.3 将构建好的重组载体交由杭州华安生物技术有限公司制备抗体第59页
        3.2.6 主要试剂及仪器设备第59-60页
            3.2.6.1 主要试剂第59-60页
            3.2.6.2 主要仪器设备第60页
        3.2.7 数据统计与分析第60页
    3.3 结果与分析第60-68页
        3.3.1 DPI及其与MeJA或NO结合处理对冷藏黄瓜相对电导率的影响第60-61页
        3.3.2 DPI及其与MeJA或NO结合处理对冷藏黄瓜次生病情指数的影响第61-62页
        3.3.3 DPI及其与MeJA或NO结合处理对冷藏黄瓜H_2O_2含量的影响第62-63页
        3.3.4 DPI及其与MeJA或NO结合处理对冷藏黄瓜CAT活性的影响第63页
        3.3.5 DPI及其与MeJA或NO结合处理对冷藏黄瓜CsCAT1表达的影响第63-64页
        3.3.6 DPI及其与MeJA或NO结合处理对冷藏黄瓜CsCAT3表达的影响第64-65页
        3.3.7 黄瓜CAT3抗体的制备第65-68页
            3.3.7.1 分离CsCAT3基因第65-66页
            3.3.7.2 重组载体双酶切第66-68页
            3.3.7.3 MeJA和NO对冷藏黄瓜CsCAT3蛋白表达的影响及其与H_2O_2的关系第68页
    3.4 小结第68-70页
第4章 MeJA和NO在诱导黄瓜抗冷性中的相互作用关系第70-87页
    4.1 引言第70页
    4.2 材料与方法第70-74页
        4.2.1 供试材料第70-71页
        4.2.2 试验处理第71页
        4.2.3 表观指标的观察及生理指标的测定第71-72页
            4.2.3.1 次生病害指数观察第71页
            4.2.3.2 果实失重率的测定第71页
            4.2.3.3 相对电导率测定第71页
            4.2.3.4 丙二醛MDA含量测定第71-72页
            4.2.3.5 活性氧及防御酶活性的测定第72页
                4.2.3.5.1 过氧化氢(H_2O_2)含量的测定第72页
                4.2.3.5.2 CAT活性测定第72页
                4.2.3.5.3 POD活性测定第72页
                4.2.3.5.4 SOD活性测定第72页
                4.2.3.5.5 PPO活性测定第72页
                4.2.3.5.6 超氧阴离子(O_2~(·?))产生速率的测定第72页
                4.2.3.5.7 PAL活性测定第72页
        4.2.4 黄瓜CsCAT1、CsCAT3表达检测第72-73页
        4.2.5 主要试剂及仪器设备第73页
            4.2.5.1 主要试剂第73页
            4.2.5.2 仪器设备第73页
        4.2.6 数据统计与分析第73-74页
    4.3 结果与分析第74-85页
        4.3.1 MeJA和NO生物合成抑制剂对MeJA和NO诱导黄瓜抗冷性的影响第74-77页
            4.3.1.1 对相对电导率的影响第74页
            4.3.1.2 对失重率的影响第74-75页
            4.3.1.3 对次生病情指数的影响第75-76页
            4.3.1.4 对丙二醛含量的影响第76-77页
        4.3.2 抑制MeJA和NO的生物合成对MeJA和NO激活黄瓜抗氧化防御酶系统的影响第77-85页
            4.3.2.1 对O_2~(·?)产生速率的影响第77-78页
            4.3.2.2 对H_2O_2含量的影响第78页
            4.3.2.3 对CAT活性的影响第78-79页
            4.3.2.4 对POD活性的影响第79-80页
            4.3.2.5 对SOD活性的影响第80-81页
            4.3.2.6 对PPO活性的影响第81-82页
            4.3.2.7 对PAL活性的影响第82-83页
            4.3.2.8 对黄瓜CAT1表达的影响第83-84页
            4.3.2.9 对黄瓜CAT3表达的影响第84-85页
    4.4 小结第85-87页
第5章 MeJA和NO处理黄瓜后的转录组分析第87-137页
    5.1 前言第87-88页
    5.2 材料与方法第88-101页
        5.2.1 试验材料第88-89页
        5.2.2 试验处理第89页
        5.2.3 测序建库流程第89-91页
            5.2.3.1 黄瓜果皮总RNA提取第90页
            5.2.3.2 文库构建第90-91页
            5.2.3.3 库检第91页
            5.2.3.4 上机测序第91页
        5.2.4 生物信息分析流程第91-99页
            5.2.4.1 原始序列数据第92页
            5.2.4.2 测序质量评估第92-93页
                5.2.4.2.1 测序错误率分布检查第92页
                5.2.4.2.2 A/T/C/G含量分布检查第92-93页
                5.2.4.2.3 测序数据过滤第93页
            5.2.4.3 参考序列比对分析第93-94页
                5.2.4.3.1 Reads在参考基因组不同区域的分布情况第94页
                5.2.4.3.2 Reads在染色体上的密度分布情况第94页
            5.2.4.4 可变剪切分析第94页
            5.2.4.5 新转录本预测第94-95页
            5.2.4.6 SNP和lnDel分析第95页
            5.2.4.7 基因表达水平分析第95页
            5.2.4.8 RNA-seq整体质量评估第95-96页
                5.2.4.8.1 表达水平的饱和曲线检查第95-96页
                5.2.4.8.2 均一性分布检查第96页
            5.2.4.9 差异表达水平第96-97页
                5.2.4.9.1 基因表达水平对比第96页
                5.2.4.9.2 差异基因列表第96-97页
                5.2.4.9.3 差异表达基因筛选第97页
                5.2.4.9.4 差异基因聚类分析第97页
                5.2.4.9.5 差异基因韦恩图第97页
            5.2.4.10 差异基因GO富集分析第97-98页
            5.2.4.11 差异基因KEGG富集分析第98-99页
                5.2.4.11.1 差异基因KEGG富集散点图第99页
        5.2.5 相关基因qRT-PCR验证第99-100页
        5.2.6 主要试剂及仪器设备第100-101页
    5.3 结果与分析第101-135页
        5.3.1 黄瓜果皮组织总RNA质量检测第101页
        5.3.2 测序质量评估第101-105页
        5.3.3 参考序列比对分析第105-109页
            5.3.3.1 Reads与参考基因组比对情况第105-106页
            5.3.3.2 Reads在参考基因组不同区域的分布情况第106-107页
            5.3.3.3 Reads在染色体上的密度分布情况第107-109页
        5.3.4 可变剪切(alternative splicing,AS)分析第109-110页
        5.3.5 基因表达水平分析第110-111页
        5.3.6 RNA-seq整体质量评估第111-114页
        5.3.7 差异基因表达分析第114-117页
        5.3.8 差异基因GO富集分析第117-120页
        5.3.9 差异基因KEGG富集分析第120-130页
        5.3.10 差异基因表达验证第130-135页
    5.4 小结第135-137页
第6章 超表达CsCAT3的拟南芥植株对低温胁迫的反应第137-156页
    6.1 前言第137-138页
    6.2 材料与方法第138-145页
        6.2.1 植物材料第138页
        6.2.2 试验处理第138页
        6.2.3 试验方法第138-144页
            6.2.3.1 黄瓜过氧化氢酶(Catalase3)基因的克隆与功能分析第138-139页
            6.2.3.2 pCAMBIA2300-CsCAT3基因超表达重组载体构建第139-141页
            6.2.3.3 表达载体转化农杆菌(电击法转化根癌农杆菌LBA4404感受态细胞)第141页
            6.2.3.4 拟南芥的栽培和转化第141-142页
            6.2.3.5 转基因植株的筛选第142页
            6.2.3.6 转化植株的PCR检测第142-143页
            6.2.3.7 基因表达水平检测第143-144页
        6.2.4 转基因拟南芥相关生理指标测定第144-145页
            6.2.4.1 相对电导率测定第144页
            6.2.4.2 组织化学染色法检测H_2O_2、O_2~(·?)含量及细胞死亡第144页
            6.2.4.3 拟南芥CAT活性测定第144-145页
        6.2.5 主要试剂及仪器设备第145页
        6.2.6 数据统计与分析第145页
    6.3 结果与分析第145-155页
        6.3.1 CsCAT3生物信息学分析第145-147页
            6.3.1.1 CsCAT3序列分析第145-146页
            6.3.1.2 CsCAT3序列比对及系统进化树分析第146-147页
        6.3.2 黄瓜CsCAT3表达载体构建和在拟南芥中表达第147-150页
            6.3.2.1 重组载体构建第147-148页
            6.3.2.2 转基因拟南芥植株的筛选第148-149页
            6.3.2.3 转基因拟南芥植株T3代PCR检测第149-150页
        6.3.3 超表达CsCAT3的拟南芥植株对低温的反应第150-155页
            6.3.3.1 低温胁迫对拟南芥叶片相对电导率的影响第150-151页
            6.3.3.2 低温胁迫对拟南芥叶片活性氧水平及细胞活性的影响第151-153页
            6.3.3.3 低温胁迫对拟南芥CAT活性的影响第153页
            6.3.3.4 低温胁迫对拟南芥相关基因表达的影响第153-155页
    6.4 小结第155-156页
第7章 讨论第156-162页
    7.1 MeJA或NO处理对采后黄瓜抗氧化防御系统的影响及其与抗冷性的关系第156-157页
    7.2 H_2O_2在MeJA、NO诱导黄瓜抗冷性的生理机制第157-158页
    7.3 CAT在MeJA和NO诱导采后黄瓜抗冷性中的作用第158-159页
    7.4 MeJA和NO在诱导黄瓜抗氧化系统和抗冷性中的作用及其相互关系第159-162页
全文结论第162-163页
致谢第163-164页
参考文献第164-183页
附录第183-185页
    附录A DPI及其与MeJA、SNP结合处理对冷藏黄瓜抗冷性的影响第183-184页
    附图B 抑制内源JA和NO的合成对NO和MeJA诱导黄瓜抗冷性的影响第184-185页
    附录C 攻读博士期间取得的科研成果第185页

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