| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第1章 绪论 | 第10-20页 |
| 1.1 环境胁迫的概念及种类 | 第10-11页 |
| 1.2 植物盐胁迫研究进展 | 第11-13页 |
| 1.2.1 形态结构的变化 | 第11-12页 |
| 1.2.2 水分含量的变化 | 第12页 |
| 1.2.3 叶绿素含量的变化 | 第12页 |
| 1.2.4 可溶性蛋白含量的变化 | 第12页 |
| 1.2.5 抗氧化酶活性的变化 | 第12-13页 |
| 1.3 中药红花的研究进展 | 第13-16页 |
| 1.3.1 红花简介 | 第13-15页 |
| 1.3.2 研究价值及前景 | 第15-16页 |
| 1.3.3 红花相关性研究 | 第16页 |
| 1.4 转录组学概述 | 第16-19页 |
| 1.4.1 转录组学 | 第16-17页 |
| 1.4.2 第二代高通量测序技术 | 第17-18页 |
| 1.4.3 第二代高通量测序技术的应用 | 第18-19页 |
| 1.5 论文研究的目的及意义 | 第19页 |
| 1.6 主要技术路线 | 第19-20页 |
| 第2章 红花幼苗对盐胁迫的生理响应 | 第20-29页 |
| 2.1 实验材料 | 第20-21页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第20页 |
| 2.1.2 实验仪器 | 第20-21页 |
| 2.1.3 实验试剂 | 第21页 |
| 2.2 实验方法 | 第21-25页 |
| 2.2.1 植物叶片含水量的测定 | 第21-22页 |
| 2.2.2 植物叶片叶绿素含量的测定 | 第22页 |
| 2.2.3 植物叶片可溶性蛋白含量的测定 | 第22-23页 |
| 2.2.4 植物叶片抗氧化酶活性的测定 | 第23-25页 |
| 2.3 实验结果与讨论 | 第25-28页 |
| 2.3.1 红花幼苗叶片的生长状况 | 第25页 |
| 2.3.2 植物叶片水含量的测定结果 | 第25-26页 |
| 2.3.3 植物叶片叶绿素含量的测定结果 | 第26页 |
| 2.3.4 植物叶片可溶性蛋白的测定结果 | 第26-27页 |
| 2.3.5 植物叶片抗氧化酶活性测定结果 | 第27-28页 |
| 2.4 小结 | 第28-29页 |
| 第3章 红花幼苗盐胁迫响应的转录组测序 | 第29-37页 |
| 3.1 实验材料 | 第29-30页 |
| 3.1.1 植物材料 | 第29页 |
| 3.1.2 实验器材 | 第29-30页 |
| 3.1.3 实验试剂 | 第30页 |
| 3.2 实验方法 | 第30-34页 |
| 3.2.1 RNA的提取与质量检测 | 第30-31页 |
| 3.2.2 cDNA文库的构建与质量检测 | 第31-33页 |
| 3.2.3 Illumina上机测序 | 第33-34页 |
| 3.3 实验结果与讨论 | 第34-36页 |
| 3.3.1 RNA的质量检测 | 第34页 |
| 3.3.2 cDNA文库的质量检测 | 第34-35页 |
| 3.3.3 测序结果 | 第35-36页 |
| 3.4 小结 | 第36-37页 |
| 第4章 红花幼苗盐胁迫响应的转录组数据分析 | 第37-49页 |
| 4.1 分析方法 | 第37-40页 |
| 4.1.1 数据分析流程 | 第37页 |
| 4.1.2 原始数据的格式转换 | 第37-38页 |
| 4.1.3 低质量数据的过滤与质量检查 | 第38页 |
| 4.1.4 Cleanreads的拼接 | 第38页 |
| 4.1.5 Unigene的表达定量 | 第38页 |
| 4.1.6 Unigene的功能注释 | 第38-39页 |
| 4.1.7 差异表达基因的分析与提取 | 第39页 |
| 4.1.8 差异基因的GO(Gene Ontology)富集分析与KEGG Pathway分析 | 第39-40页 |
| 4.2 分析结果与讨论 | 第40-48页 |
| 4.2.1 Cleandata的FastQC分析及组装 | 第40-41页 |
| 4.2.2 Unigene的表达定量 | 第41-42页 |
| 4.2.3 Unigene功能注释 | 第42-43页 |
| 4.2.4 样本相关性研究 | 第43页 |
| 4.2.5 基因差异表达分析 | 第43-44页 |
| 4.2.6 Unigene的GO分类 | 第44-45页 |
| 4.2.7 KEGG pathway分析 | 第45-47页 |
| 4.2.8 盐胁迫相关的主要代谢途径分析 | 第47-48页 |
| 4.3 小结 | 第48-49页 |
| 结论 | 第49-50页 |
| 参考文献 | 第50-58页 |
| 附件A Contig片段长度与Unigene的片段长度分布表格 | 第58-59页 |
| 附件B 攻读学位期间所发表的学术论文 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60页 |
