| 摘要 | 第4-6页 |
| SUMMARY | 第6-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-20页 |
| 1 兰州鲇概述 | 第12页 |
| 2 遗传标记与分子标记 | 第12-13页 |
| 3 分子标记 | 第13-17页 |
| 3.1 基于分子杂交技术的分子标记 | 第13-15页 |
| 3.1.1 限制性片段长度多态性（RFLP） | 第13-14页 |
| 3.1.2 串联数目重复多态性（VNTR） | 第14-15页 |
| 3.2 基于PCR技术的分子标记技术 | 第15-17页 |
| 3.2.1 随机扩增多态DNA（RAPD） | 第15页 |
| 3.2.2 扩增片段长度多态（AFLP） | 第15-16页 |
| 3.2.3 微卫星DNA（Microsatellite） | 第16页 |
| 3.2.4 表达序列标签（EST） | 第16-17页 |
| 3.3 基于DNA芯片技术的分子标记技术 | 第17页 |
| 3.3.1 单核苷酸多态性（SNP） | 第17页 |
| 4 SSR筛选的主要方法 | 第17-19页 |
| 4.1 传统法 | 第17-18页 |
| 4.2 富集法 | 第18页 |
| 4.2.1 选择性杂交法 | 第18页 |
| 4.2.2 FIASCO法 | 第18页 |
| 4.3 数据库查找法 | 第18-19页 |
| 4.4 近缘物种筛选法 | 第19页 |
| 5 分子辅助育种在鱼类中的应用 | 第19页 |
| 6 本研究的目的及意义 | 第19-20页 |
| 第二章 兰州鲇基因组微卫星分子标记开发 | 第20-32页 |
| 1 实验材料 | 第20-22页 |
| 1.1 兰州鲇样本采集 | 第20页 |
| 1.2 主要仪器设备 | 第20页 |
| 1.3 主要试剂及材料 | 第20-21页 |
| 1.4 溶液、试剂配制 | 第21-22页 |
| 1.4.1 DNA提取试剂的配制 | 第21页 |
| 1.4.2 琼脂糖凝胶电泳试剂配制 | 第21-22页 |
| 1.4.3 探针与磁珠杂交、洗脱相关试剂配方 | 第22页 |
| 1.4.4 克隆相关试剂配制 | 第22页 |
| 2 试验方法 | 第22-28页 |
| 2.1 基因组DNA的提取 | 第22-23页 |
| 2.2 DNA质量和浓度检测 | 第23-24页 |
| 2.3 基因组DNA酶切、接头连接与PCR预扩增 | 第24-25页 |
| 2.3.1 基因组酶切 | 第24页 |
| 2.3.2 接头制备及连接 | 第24页 |
| 2.3.3 接头引物预扩增 | 第24-25页 |
| 2.4 生物素探针杂交 | 第25页 |
| 2.5 磁珠富集 | 第25-26页 |
| 2.5.1 磁珠预处理 | 第25页 |
| 2.5.2 磁珠与目的片断杂交 | 第25页 |
| 2.5.3 磁珠洗脱 | 第25页 |
| 2.5.4 单链微卫星片断PCR预扩增 | 第25-26页 |
| 2.6 纯化回收PCR目的片段 | 第26页 |
| 2.7 克隆测序 | 第26-28页 |
| 2.7.1 氯化钙法制备感受态细胞 | 第26-27页 |
| 2.7.2 连接与转化 | 第27页 |
| 2.7.3 阳性克隆的鉴定及测序 | 第27页 |
| 2.7.4 序列分析及数据统计 | 第27-28页 |
| 3 结果与分析 | 第28-30页 |
| 3.1 兰州鲇基因组DNA提取、酶切 | 第28页 |
| 3.2 单链扩增最佳循环次数 | 第28-29页 |
| 3.3 菌液双引物PCR鉴定结果 | 第29页 |
| 3.4 微卫星序列筛选 | 第29-30页 |
| 4 讨论 | 第30-32页 |
| 第三章 基于胡鲇科和鲇科ESTS筛选兰州鲇E-SSR分子标记 | 第32-37页 |
| 1 实验材料 | 第32页 |
| 1.1 胡鲇科和鲇科EST序列来源及兰州鲇样本采集 | 第32页 |
| 1.2 试剂及溶液的配置 | 第32页 |
| 1.3 主要仪器和设备 | 第32页 |
| 2 实验方法 | 第32-33页 |
| 2.1 胡鲇科和鲇科EST序列获取及筛选 | 第32页 |
| 2.2 胡鲇科和鲇科E-SSR位点查找 | 第32页 |
| 2.3 兰州鲇基因组DNA提取 | 第32页 |
| 2.4 引物设计PCR扩增及产物鉴定 | 第32-33页 |
| 2.5 PCR产物的克隆及测序 | 第33页 |
| 3 结果与分析 | 第33-35页 |
| 4 讨论 | 第35-37页 |
| 第四章 兰州鲇多态性微卫星标记筛选 | 第37-46页 |
| 1 实验材料 | 第37-38页 |
| 1.1 兰州鲇样本采集 | 第37页 |
| 1.2 试剂及溶液的配置 | 第37页 |
| 1.3 微卫星引物设计 | 第37页 |
| 1.4 主要仪器设备 | 第37-38页 |
| 2 实验方法 | 第38-39页 |
| 2.1 兰州鲇基因组总DNA提取 | 第38页 |
| 2.2 PCR扩增 | 第38页 |
| 2.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第38-39页 |
| 2.4 数据分析方法 | 第39页 |
| 3 结果与分析 | 第39-45页 |
| 3.1 兰州鲇多态性微卫星引物筛选 | 第39-45页 |
| 3.1.1 兰州鲇多态性引物筛选与分析 | 第39页 |
| 3.1.2 兰州鲇群体遗传多样性分析 | 第39-45页 |
| 4 讨论 | 第45-46页 |
| 第五章 初步筛选兰州鲇生长相关微卫星标记 | 第46-52页 |
| 1 实验材料 | 第46-47页 |
| 1.1 兰州鲇样本采集 | 第46页 |
| 1.2 试剂及溶液的配置 | 第46页 |
| 1.3 微卫星引物 | 第46页 |
| 1.4 主要仪器设备 | 第46-47页 |
| 2 实验方法 | 第47-48页 |
| 2.1 兰州鲇基因组总DNA提取 | 第47页 |
| 2.2 PCR扩增 | 第47页 |
| 2.3 聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第47页 |
| 2.4 数据分析方法 | 第47-48页 |
| 3 结果与分析 | 第48-50页 |
| 3.1 初步筛选与兰州鲇生长相关性微卫星位点 | 第48-50页 |
| 3.1.1 群体遗传多样性分析 | 第48页 |
| 3.1.2 与兰州鲇体重、体长、体高关联的微卫星位点的初步验证 | 第48-50页 |
| 4 讨论 | 第50-52页 |
| 4.1 兰州鲇养殖群体的遗传多样性 | 第50页 |
| 4.2 分析方法 | 第50-51页 |
| 4.3 与兰州鲇生长性状显著相关的SSR标记 | 第51-52页 |
| 第六章 全文结论及不足 | 第52-54页 |
| 1 全文结论 | 第52页 |
| 2 全文不足 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 作者简介 | 第65-66页 |
| 导师简介 | 第66-67页 |
