| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-28页 |
| 1.1 分子系统学研究 | 第12-15页 |
| 1.1.1 分子系统学的定义 | 第12页 |
| 1.1.2 分子系统学的分类 | 第12页 |
| 1.1.3 分子系统学的研究步骤 | 第12-15页 |
| 1.2 线粒体基因组概述 | 第15-20页 |
| 1.2.1 线粒体的生物学特性 | 第15-16页 |
| 1.2.2 线粒体基因组结构特点 | 第16-18页 |
| 1.2.3 鱼类线粒体基因组组成和特点 | 第18-19页 |
| 1.2.4 线粒体基因组在海洋动物系统进化研究中的应用 | 第19-20页 |
| 1.3 两种茴鱼概况 | 第20-24页 |
| 1.3.1 新疆北极茴鱼概况 | 第20-22页 |
| 1.3.2 蒙古茴鱼概况 | 第22-23页 |
| 1.3.3 茴鱼属鱼类研究现状 | 第23-24页 |
| 1.4 魁蚶概况 | 第24-26页 |
| 1.4.1 分类地位和分布 | 第24页 |
| 1.4.2 形态特征 | 第24-25页 |
| 1.4.3 生物学特性 | 第25页 |
| 1.4.4 魁蚶分类遗传学研究现状 | 第25-26页 |
| 1.5 立题背景与意义 | 第26-28页 |
| 第二章 两种茴鱼线粒体全基因组序列分析及系统发育研究 | 第28-63页 |
| 2.1 引言 | 第28页 |
| 2.2 实验材料 | 第28-31页 |
| 2.2.1 样品采集 | 第28-29页 |
| 2.2.2 实验主要试剂 | 第29页 |
| 2.2.3 实验主要设备 | 第29-30页 |
| 2.2.4 常用溶液配制 | 第30-31页 |
| 2.3 实验方法 | 第31-39页 |
| 2.3.1 基因组DNA的提取 | 第31-32页 |
| 2.3.2 总DNA的检测 | 第32-33页 |
| 2.3.3 PCR扩增及测序 | 第33-37页 |
| 2.3.4 序列拼接和提交 | 第37页 |
| 2.3.5 线粒体DNA组成分析 | 第37-38页 |
| 2.3.6 系统进化树的构建 | 第38-39页 |
| 2.4 结果与讨论 | 第39-61页 |
| 2.4.1 两种茴鱼线粒体基因组基本组成 | 第39-44页 |
| 2.4.2 两种茴鱼线粒体基因顺序 | 第44页 |
| 2.4.3 两种茴鱼线粒体基因重叠和基因间隔序列 | 第44-45页 |
| 2.4.4 碱基组成 | 第45-47页 |
| 2.4.5 蛋白质编码基因与密码子使用 | 第47-51页 |
| 2.4.6 rRNA基因特点 | 第51-53页 |
| 2.4.7 tRNA基因特点 | 第53-55页 |
| 2.4.8 非编码区特点 | 第55-56页 |
| 2.4.9 线粒体DNA突变 | 第56-57页 |
| 2.4.10 遗传距离 | 第57-58页 |
| 2.4.11 茴鱼属系统发育分析 | 第58-61页 |
| 2.5 小结 | 第61-63页 |
| 第三章 鲑科鱼类分子系统进化研究 | 第63-75页 |
| 3.1 引言 | 第63页 |
| 3.2 实验材料 | 第63-64页 |
| 3.2.1 线粒体全基因组数据的获得 | 第63-64页 |
| 3.3 实验方法 | 第64-67页 |
| 3.3.1 基因组序列分析 | 第64页 |
| 3.3.2 不同基因在鲑科系统进化分析中的适用性 | 第64页 |
| 3.3.3 系统发育分析 | 第64-67页 |
| 3.4 结果与讨论 | 第67-74页 |
| 3.4.1 线粒体基因组的基本特征 | 第67页 |
| 3.4.2 碱基组成及变异 | 第67页 |
| 3.4.3 遗传距离 | 第67-68页 |
| 3.4.4 鲑科mtDNA的不同基因在系统进化分析中的适用性 | 第68-69页 |
| 3.4.5 鲑科鱼类系统发育分析 | 第69-74页 |
| 3.5 小结 | 第74-75页 |
| 第四章 魁蚶中国群体的分类学地位研究 | 第75-89页 |
| 4.1 引言 | 第75页 |
| 4.2 实验材料 | 第75-76页 |
| 4.2.1 样品采集 | 第75页 |
| 4.2.2 实验主要试剂 | 第75页 |
| 4.2.3 实验主要仪器 | 第75-76页 |
| 4.2.4 常用溶液配制 | 第76页 |
| 4.3 实验方法 | 第76-79页 |
| 4.3.1 基因组DNA的提取 | 第76页 |
| 4.3.2 PCR扩增及测序 | 第76-79页 |
| 4.4 结果与讨论 | 第79-87页 |
| 4.4.1 魁蚶中国群体线粒体基因序列特征 | 第79-80页 |
| 4.4.2 蚶科27种贝类基因序列特征 | 第80-82页 |
| 4.4.3 遗传分化 | 第82-83页 |
| 4.4.4 系统发育分析 | 第83-87页 |
| 4.5 小结 | 第87-89页 |
| 第五章 双壳贝类分子系统进化研究 | 第89-102页 |
| 5.1 引言 | 第89页 |
| 5.2 实验材料 | 第89-90页 |
| 5.2.1 样品采集 | 第89-90页 |
| 5.2.2 数据获得 | 第90页 |
| 5.3 实验方法 | 第90-94页 |
| 5.3.1 基因组DNA的提取 | 第90页 |
| 5.3.2 PCR扩增及测序 | 第90-94页 |
| 5.4 结果与讨论 | 第94-100页 |
| 5.4.1 双壳贝类线粒体基因序列分析 | 第94-95页 |
| 5.4.2 遗传距离 | 第95-96页 |
| 5.4.3 双壳贝类系统发育分析 | 第96-100页 |
| 5.5 小结 | 第100-102页 |
| 结论 | 第102-104页 |
| 参考文献 | 第104-116页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第116-117页 |
| 致谢 | 第117-118页 |
