| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第12-20页 |
| 1.1 四种常用品系大鼠的简介 | 第12-13页 |
| 1.2 SNP的概述 | 第13-18页 |
| 1.2.1 SNP标记的特点 | 第14-15页 |
| 1.2.2 SNP的检测方法 | 第15-16页 |
| 1.2.3 SNP标记的应用 | 第16-18页 |
| 1.3 SNP标记在大鼠遗传检测中的研究进展 | 第18页 |
| 1.4 研究内容和意义 | 第18-20页 |
| 第二章 基因组分析及SNP标记的初步筛选 | 第20-29页 |
| 2.1 引言 | 第20-21页 |
| 2.2 实验材料与设备 | 第21-22页 |
| 2.2.1 供试样本 | 第21页 |
| 2.2.2 主要仪器与设备 | 第21页 |
| 2.2.3 主要试剂与耗材 | 第21-22页 |
| 2.3 实验过程与方法 | 第22-25页 |
| 2.3.1 样本的采集 | 第22页 |
| 2.3.2 基因组DNA的提取及电泳检测 | 第22-23页 |
| 2.3.3 Wistar大鼠与GK大鼠的重测序 | 第23页 |
| 2.3.4 基因组测序数据的比对 | 第23-24页 |
| 2.3.5 SNP的检测和初步筛选 | 第24页 |
| 2.3.6 提取SNP位点上下游延伸序列 | 第24-25页 |
| 2.4 实验结果与讨论 | 第25-28页 |
| 2.4.1 测序及比对结果 | 第25页 |
| 2.4.2 SNP的检测结果 | 第25页 |
| 2.4.3 初筛的两组SNP结果 | 第25-27页 |
| 2.4.4 讨论 | 第27-28页 |
| 2.5 本章小结 | 第28-29页 |
| 第三章 用于鉴定四种品系大鼠的SNP标记筛选 | 第29-51页 |
| 3.1 引言 | 第29-30页 |
| 3.2 实验材料与设备 | 第30-31页 |
| 3.2.1 供试样本 | 第30页 |
| 3.2.2 主要仪器与设备 | 第30-31页 |
| 3.2.3 主要试剂与耗材 | 第31页 |
| 3.3 实验过程与方法 | 第31-35页 |
| 3.3.1 样本的采集 | 第31页 |
| 3.3.2 基因组DNA的提取及电泳检测 | 第31-32页 |
| 3.3.3 引物设计 | 第32-33页 |
| 3.3.4 模板(单个个体与混合池)的准备 | 第33-34页 |
| 3.3.5 PCR反应体系及程序 | 第34页 |
| 3.3.6 PCR产物的电泳检测 | 第34-35页 |
| 3.3.7 PCR产物的测序与比对 | 第35页 |
| 3.3.8 DNA混合池实验 | 第35页 |
| 3.4 实验结果与讨论 | 第35-50页 |
| 3.4.1 基因组DNA提取结果 | 第35-36页 |
| 3.4.2 单个个体扩增产物的电泳结果 | 第36页 |
| 3.4.3 单个个体扩增产物的测序及比对结果 | 第36-44页 |
| 3.4.4 混合池扩增产物的电泳结果 | 第44页 |
| 3.4.5 混合池扩增产物的测序及比对结果 | 第44-49页 |
| 3.4.6 讨论 | 第49-50页 |
| 3.5 本章小结 | 第50-51页 |
| 第四章 用于评估四种品系大鼠遗传多样性的SNP标记筛选 | 第51-69页 |
| 4.1 引言 | 第51-52页 |
| 4.2 实验材料与设备 | 第52-53页 |
| 4.2.1 供试样本 | 第52页 |
| 4.2.2 主要仪器与设备 | 第52-53页 |
| 4.2.3 主要试剂与耗材 | 第53页 |
| 4.3 实验过程与方法 | 第53-57页 |
| 4.3.1 样本处理及DNA混合池的构建 | 第53页 |
| 4.3.2 引物设计 | 第53-55页 |
| 4.3.3 PCR反应体系及程序 | 第55页 |
| 4.3.4 PCR产物电泳检测 | 第55-56页 |
| 4.3.5 PCR产物的测序与比对 | 第56页 |
| 4.3.6 等位基因频率估算 | 第56页 |
| 4.3.7 检验 | 第56-57页 |
| 4.4 实验结果与讨论 | 第57-68页 |
| 4.4.1 扩增产物的电泳结果 | 第57页 |
| 4.4.2 扩增产物的测序及比对结果 | 第57-63页 |
| 4.4.3 等位基因频率估算结果 | 第63-64页 |
| 4.4.4 检验结果 | 第64-66页 |
| 4.4.5 讨论 | 第66-68页 |
| 4.5 本章小结 | 第68-69页 |
| 结论与展望 | 第69-71页 |
| 参考文献 | 第71-78页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第78-79页 |
| 致谢 | 第79-80页 |
| 附表 | 第80页 |