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万州猕猴桃溃疡病病原菌的分离鉴定及环介导等温扩增快速检测

中文摘要第3-5页
英文摘要第5-7页
缩略词与中英文对照表第11-12页
1 前言第12-24页
    1.1 引言第12-13页
    1.2 猕猴桃溃疡病及其病原菌第13-15页
        1.2.1 猕猴桃溃疡病及其主要危害第13-14页
        1.2.2 猕猴桃溃疡病病原菌的分类第14页
        1.2.3 猕猴桃溃疡病病原菌的主要生物学特性第14-15页
    1.3 猕猴桃溃疡病病原菌检测方法的研究现状第15-16页
        1.3.1 病原菌的常规鉴定第15页
        1.3.2 病原菌的分子鉴定第15-16页
    1.4 LAMP技术原理及应用第16-21页
        1.4.1 LAMP技术原理第16-19页
        1.4.2 LAMP技术的优缺点第19-20页
        1.4.3 LAMP技术在植物病害检疫中的应用第20-21页
    1.5 研究目的、研究内容和技术路线第21-23页
        1.5.1 研究目的第21页
        1.5.2 研究内容第21页
        1.5.3 技术路线第21-23页
    1.6 本研究的创新点第23-24页
2 重庆猕猴桃溃疡病病原菌的分离与鉴定第24-40页
    2.1 材料与仪器第24-26页
        2.1.1 猕猴桃溃疡病病原菌分离材料第24页
        2.1.2 供试菌株第24页
        2.1.3 培养基第24-25页
        2.1.4 主要试剂第25页
        2.1.5 主要仪器第25-26页
    2.2 方法第26-33页
        2.2.1 猕猴桃溃疡病病原菌的分离第26页
        2.2.2 猕猴桃溃疡病病原菌的形态学及生理生化特性分析第26-27页
        2.2.3 病原菌的致病性测定第27-28页
        2.2.4 细菌基因组DNA的提取第28-29页
        2.2.5 病原菌 16S rDNA片段扩增第29页
        2.2.6 PCR产物纯化、克隆与测序第29-31页
        2.2.7 序列分析与系统发育树的构建第31页
        2.2.8 不同引物对病原菌的扩增第31-33页
    2.3 结果与分析第33-38页
        2.3.1 猕猴桃溃疡病病原菌分离结果第33-34页
        2.3.2 病原菌的形态学及生理生化特性分析第34-35页
        2.3.3 病原菌的致病性测定第35页
        2.3.4 病原菌 16S rDNA的扩增第35-36页
        2.3.5 对系统发育树的分析第36-37页
        2.3.6 不同引物对病原菌的扩增第37-38页
    2.4 讨论第38-40页
3 猕猴桃溃疡病LAMP快速检测方法的建立第40-53页
    3.1 材料与仪器第40页
        3.1.1 供试材料第40页
        3.1.2 供试菌株第40页
        3.1.3 培养基第40页
        3.1.4 主要试剂第40页
        3.1.5 主要仪器设备第40页
    3.2 方法第40-43页
        3.2.1 猕猴桃内生细菌的分离与鉴定第40-41页
        3.2.2 细菌基因组DNA的提取第41页
        3.2.3 LAMP靶序列的选取与引物设计第41-42页
        3.2.4 LAMP检测体系的建立及优化第42页
        3.2.5 LAMP外引物反应产物的分析第42页
        3.2.6 LAMP扩增产物的分析第42-43页
        3.2.7 LAMP特异性检测第43页
        3.2.8 LAMP与定量PCR和双重PCR灵敏度的比较第43页
        3.2.9 实际样品的应用检测第43页
    3.3 结果与分析第43-51页
        3.3.1 猕猴桃内生细菌的分离与鉴定第43-44页
        3.3.2 LAMP靶序列与引物第44页
        3.3.3 LAMP检测体系的优化第44-48页
        3.3.4 LAMP外引物反应产物的分析第48页
        3.3.5 LAMP扩增产物的分析第48-49页
        3.3.6 LAMP检测方法的特异性第49页
        3.3.7 LAMP与定量PCR和双重PCR灵敏度的比较第49-50页
        3.3.8 实际样品的应用检测第50-51页
    3.4 讨论第51-53页
4 主要研究结论与展望第53-54页
    4.1 主要研究结论第53页
    4.2 后续工作展望第53-54页
致谢第54-55页
参考文献第55-62页
附录第62页
    A. 作者在攻读学位期间发表的论文第62页
    B. 作者在攻读硕士学位期间参加的科研项目第62页

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