| EPIGRAPH | 第7-8页 |
| ABSTRACT | 第8-11页 |
| 摘要 | 第12-15页 |
| LIST OF SYMBOLS AND ABBREVIATIONS | 第15-17页 |
| CONTENTS | 第17-19页 |
| LIST OF FIGURES | 第19-20页 |
| LIST OF TABLES | 第20-21页 |
| CHAPTER 1 INTRODUCTION | 第21-47页 |
| 1.1 Introduction | 第21-33页 |
| 1.2 Reference | 第33-47页 |
| CHAPTER 2 LITERATURE REVIEW | 第47-67页 |
| 2.1 General overview and back ground | 第47-48页 |
| 2.2 Mitochondrial genome | 第48页 |
| 2.3 Nucleotide composition | 第48-50页 |
| 2.4 Transitions vs Transversions | 第50-51页 |
| 2.5 Genetic distance | 第51页 |
| 2.6 Clockwise Evolution | 第51-52页 |
| 2.7 Genetic diversity | 第52页 |
| 2.8 Phylogenetic | 第52-53页 |
| 2.9 Gene duplication | 第53页 |
| 2.10 DNA barcoding | 第53-54页 |
| 2.11 Universal primers | 第54-55页 |
| 2.12 Conservation and management | 第55-56页 |
| 2.13 References | 第56-67页 |
| CHAPTER 3 MATERIALS AND METHODS | 第67-77页 |
| 3.1 Sampling and DNA Extraction | 第67-69页 |
| 3.2 Construction of mitochondrial genome sequence | 第69页 |
| 3.3 Phylogenetic analysis | 第69-70页 |
| 3.4 Nucleotide compostion measurement | 第70-71页 |
| 3.5 Transition vsTransversions measurement | 第71页 |
| 3.6 Genetic distance measurement | 第71页 |
| 3.7 Clockwise evolution rate | 第71-72页 |
| 3.8 Data analysis | 第72-74页 |
| 3.9 References | 第74-77页 |
| CHAPTER 4 MITOCHONDRIAL GENOME ORGANIZATION AND COMPOSITION | 第77-103页 |
| 4.1 Introduction | 第77-79页 |
| 4.2 Materials and methods | 第79页 |
| 4.3 Universal primers | 第79-82页 |
| 4.4 Rita rita complete genome | 第82-86页 |
| 4.5 Sperata seenghala complete genome | 第86-90页 |
| 4.6 Bagarius bagarius complete genome | 第90-94页 |
| 4.7 Wallago attu complete genome | 第94-99页 |
| 4.8 Summary | 第99页 |
| 4.9 References | 第99-103页 |
| CHAPTER 5 PHYLOGENETIC ANALYSIS OF CATFISHES OF THE (ORDER SILURIFORMES) | 第103-143页 |
| 5.1 Introduction | 第103-104页 |
| 5.2 Material and methods | 第104-108页 |
| 5.3 Phylogenetic relationship between species | 第108-120页 |
| 5.4 Maximum Likelihood Estimate of Transition/Transversion Bias | 第120-121页 |
| 5.5 Clockwise evolution | 第121-122页 |
| 5.6 Nucleotide compositions | 第122-125页 |
| 5.7 All frequencies are averages over all taxa | 第125-126页 |
| 5.8 Distance analysis | 第126-127页 |
| 5.9 Discussion | 第127-128页 |
| 5.10 References | 第128-143页 |
| CHAPTER 6 CONCLUSION AND FUTURE WORK | 第143-146页 |
| ACKNOWLEDGEMENT | 第146-148页 |
| LIST OF PUBLICATIONS | 第148-149页 |
