| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-23页 |
| 1. 赤潮研究背景和概况 | 第11-16页 |
| 1.1 赤潮及其危害 | 第11-12页 |
| 1.2 赤潮爆发机理的研究现状 | 第12-14页 |
| 1.3 甲藻与赤潮 | 第14-16页 |
| 2. 转录组测序、全长扩增与荧光定量技术 | 第16-21页 |
| 2.1 转录组测序技术 | 第16-18页 |
| 2.2 cDNA 的全长扩增技术 | 第18-19页 |
| 2.3 荧光定量 PCR 技术 | 第19-21页 |
| 3. 课题研究的目的及意义 | 第21-23页 |
| 第二章 链状亚历山大藻转录组测序及分析 | 第23-43页 |
| 1. 前言 | 第23页 |
| 2. 材料和方法 | 第23-30页 |
| 2.1 藻种 | 第23页 |
| 2.2 f/2 培养基 | 第23-24页 |
| 2.3 试剂 | 第24页 |
| 2.4 仪器与耗材 | 第24-25页 |
| 2.5 链状亚历山大藻的培养 | 第25页 |
| 2.6 链状亚历山大藻细胞的收集和总 RNA 的提取 | 第25-27页 |
| 2.7 mRNA 文库的构建 | 第27-28页 |
| 2.8 数据过滤和从头组装 | 第28页 |
| 2.9 Unigene 的功能注释 | 第28-29页 |
| 2.10 Unigene 的 SSR 序列分析 | 第29页 |
| 2.11 组蛋白 H1 序列进化分析 | 第29页 |
| 2.12 SL 序列检测 | 第29-30页 |
| 3. 结果与讨论 | 第30-42页 |
| 3.1 数据统计与从头组装结果 | 第30-31页 |
| 3.2 功能注释 | 第31-34页 |
| 3.3 SSR 序列分析 | 第34-38页 |
| 3.4 Unigene 的功能概况和组蛋白 H1 的进化分析 | 第38-40页 |
| 3.5 内吞作用 | 第40-41页 |
| 3.6 SL 序列分析 | 第41-42页 |
| 4. 小结 | 第42-43页 |
| 第三章 富含甘氨酸蛋白基因的全长扩增和表达分析 | 第43-66页 |
| 1. 前言 | 第43页 |
| 2. 实验材料与试剂 | 第43-44页 |
| 2.1 实验材料 | 第43-44页 |
| 2.2 试剂和仪器 | 第44页 |
| 3. 实验方法 | 第44-56页 |
| 3.1 链状亚历山大藻细胞的收集 | 第44-45页 |
| 3.2 引物设计 | 第45-46页 |
| 3.3 样本的 RNA 提取 | 第46页 |
| 3.4 一链 cDNA 的制备 | 第46-48页 |
| 3.5 一链合成效率的检测 | 第48-49页 |
| 3.6 grp 部分序列的扩增 | 第49页 |
| 3.7 部分序列的回收和克隆测序 | 第49-50页 |
| 3.8 部分序列进行全长扩增 | 第50-53页 |
| 3.9 系统进化树的构建 | 第53-54页 |
| 3.10 荧光定量 PCR | 第54-56页 |
| 4. 结果与分析 | 第56-63页 |
| 4.1 总 RNA 的质量 | 第56-57页 |
| 4.2 一链 cDNA 合成效率 | 第57页 |
| 4.3 grp 部分序列的扩增结果和全长扩增结果 | 第57-58页 |
| 4.4 序列分析 | 第58-60页 |
| 4.5 荧光定量 PCR 分析 | 第60-63页 |
| 5. 讨论 | 第63-65页 |
| 6. 小结 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-79页 |
| 致谢 | 第79-80页 |
| 在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第80-81页 |