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基于智能优化算法的肿瘤微阵列基因表达数据分类研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
论文所用缩略语注释表第7-14页
第一章 绪论第14-32页
    1.1 肿瘤分类第14-17页
        1.1.1 肿瘤分类的意义第14-15页
        1.1.2 肿瘤分类的传统方法第15-16页
        1.1.3 基于微阵列基因表达数据的肿瘤分类第16页
        1.1.4 肿瘤微阵列基因表达数据分类研究难点第16-17页
    1.2 肿瘤微阵列基因表达数据第17-24页
        1.2.1 肿瘤微阵列基因表达数据第17-21页
        1.2.2 肿瘤微阵列基因表达数据国内外研究进展第21-24页
    1.3 智能优化算法在肿瘤微阵列基因表达数据分类研究中的应用第24-27页
        1.3.1 用于肿瘤微阵列基因表达数据分类研究的智能优化算法第25-26页
        1.3.2 智能优化算法在肿瘤微阵列基因表达数据分类中的国内外研究情况第26-27页
    1.4 论文结构安排与主要工作第27-31页
        1.4.1 结构安排第27-29页
        1.4.2 论文主要工作第29-31页
    1.5 论文的创新点第31-32页
第二章 用于肿瘤微阵列基因表达数据分类研究的实验数据第32-42页
    2.1 引言第32页
    2.2 实验数据选取标准第32-33页
    2.3 智能优化算法分类研究测试数据第33-34页
    2.4 智能优化算法用于肿瘤分类研究的微阵列基因表达数据第34-39页
        2.4.1 白血病微阵列基因表达数据第34-36页
        2.4.2 弥漫大B细胞淋巴瘤微阵列基因表达数据第36-37页
        2.4.3 肺癌、乳腺、前列腺癌和结直肠癌肿瘤微阵列基因表达数据第37-39页
    2.5 适应度值函数第39-40页
        2.5.1 欧式距离第40页
        2.5.2 皮尔森相关系数第40页
    2.6 本章小结第40-42页
第三章 针对肿瘤微阵列基因表达数据所采用的分类算法第42-62页
    3.1 引言第42页
    3.2 用于肿瘤微阵列基因表达数据的常规分类算法第42-43页
        3.2.1 K近邻分类算法第42-43页
        3.2.2 支持向量机分类算法第43页
    3.3 用于肿瘤微阵列基因表达数据的智能优化分类算法第43-49页
        3.3.1 用于肿瘤微阵列基因表达数据分类研究的遗传算法第44-46页
        3.3.2 用于肿瘤微阵列基因表达数据分类研究的基本粒子群算法第46-49页
    3.4 论文使用的算法一:双层粒子群优化分类算法第49-54页
        3.4.1 双层粒子群优化分类算法的基本流程第50页
        3.4.2 双层粒子群优化算法的具体步骤第50-54页
    3.5 论文使用的算法二:多元优化过程记忆分类算法第54-59页
        3.5.1 搜索元及其构成第55-57页
        3.5.2 搜索元的数据更新第57-58页
        3.5.3 MOA分类算法流程第58-59页
    3.6 肿瘤微阵列基因表达数据分类流程第59-60页
    3.7 本章小结第60-62页
第四章 双层粒子群优化分类算法和多元优化过程记忆分类算法性能测评第62-74页
    4.1 引言第62-63页
        4.1.1 基于TLPSO分类算法的实验测评第62-63页
        4.1.2 基于MOA分类算法的实验测评第63页
    4.2 实验目的第63页
    4.3 实验环境构建第63-65页
        4.3.1 测试数据第63-64页
        4.3.2 实验方法第64页
        4.3.3 分类算法性能评价指标第64-65页
    4.4 实验一:基于TLPSO分类算法的性能评测第65-68页
        4.4.1 基于TLPSO分类算法的Heart数据集分类结果第65页
        4.4.2 基于TLPSO分类算法的Vote数据集分类结果第65-66页
        4.4.3 基于TLPSO分类算法的Iris数据集分类结果第66-67页
        4.4.4 基于TLPSO分类算法的Wine数据集分类结果第67页
        4.4.5 基于TLPSO分类算法的分类结果分析第67-68页
    4.5 实验二:基于MOA分类算法的性能评测第68-73页
        4.5.1 基于MOA分类算法的Heart数据集分类结果第68-69页
        4.5.2 基于MOA分类算法的Vote数据集分类结果第69-70页
        4.5.3 基于MOA分类算法的Iris数据集分类结果第70-71页
        4.5.4 基于MOA分类算法的Wine数据集分类结果第71-72页
        4.5.5 基于MOA分类算法的分类结果分析第72-73页
    4.6 本章小结第73-74页
第五章 智能优化算法用于肿瘤微阵列基因表达数据分类研究的实验测评第74-114页
    5.1 引言第74-76页
        5.1.1 基于白血病微阵列基因表达样本的实验测评第75页
        5.1.2 基于弥漫大B细胞淋巴瘤微阵列基因表达样本的实验测评第75-76页
        5.1.3 基于多类肿瘤微阵列基因表达样本的实验测评第76页
    5.2 实验环境构建第76-80页
        5.2.1 测试数据第77-78页
        5.2.2 实验平台第78页
        5.2.3 分类算法性能评价指标第78-79页
        5.2.4 实验参数设置第79-80页
    5.3 实验一:白血病微阵列基因表达样本分类研究第80-90页
        5.3.1 基于TLPSO分类算法的白血病基因表达样本分类第82-84页
        5.3.2 基于MOA分类算法的白血病基因表达样本分类第84-88页
        5.3.3 实验分析第88-90页
    5.4 实验二:弥漫大B细胞淋巴瘤基因表达样本分类研究第90-103页
        5.4.1 基于TLPSO分类算法的弥漫大B细胞淋巴瘤基因表达样本分类第91-95页
        5.4.2 基于MOA分类算法的弥漫大B细胞淋巴瘤基因表达样本分类第95-99页
        5.4.3 实验分析第99-103页
    5.5 实验三:多类肿瘤基因表达样本分类研究第103-112页
        5.5.1 基于TLPSO分类算法的多类肿瘤基因表达样本分类第104-107页
        5.5.2 基于MOA分类算法的多类肿瘤基因表达样本分类第107-110页
        5.5.3 实验分析第110-112页
    5.6 本章小结第112-114页
第六章 智能优化算法用于肿瘤微阵列基因表达数据分类研究的实验结果比较第114-136页
    6.1 引言第115-116页
        6.1.1 基于白血病微阵列基因表达样本的实验测评第115页
        6.1.2 基于弥漫大B细胞淋巴瘤微阵列基因表达样本的实验测评第115-116页
    6.2 实验环境构建第116-121页
        6.2.1 测试算法第116-117页
        6.2.2 测试数据第117-118页
        6.2.3 实验方法第118-119页
        6.2.4 分类算法性能评价指标第119页
        6.2.5 实验参数设置第119-121页
    6.3 比较实验一:白血病微阵列基因表达样本分类结果比较第121-126页
        6.3.1 第一组白血病微阵列基因表达样本分类结果比较第122-123页
        6.3.2 第二组白血病微阵列基因表达样本分类结果比较第123-124页
        6.3.3 实验分析第124-126页
    6.4 比较实验二:弥漫大B细胞淋巴瘤基因表达样本分类结果比较第126-134页
        6.4.1 基于GA、PSO、TLPSO和MOA分类算法的弥漫大B细胞淋巴瘤微阵列基因表达样本分类结果比较第127-133页
        6.4.2 实验分析第133-134页
    6.5 本章小结第134-136页
第七章 总结和展望第136-140页
    7.1 论文总结第136-139页
    7.2 结论和工作展望第139-140页
参考文献第140-150页
附录:博士期间研究成果第150-152页
致谢第152页

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