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多重组学手段研究蛋白UHRF2的生物学功能及其机制

缩略词表第6-7页
摘要第7-10页
ABSTRACT第10-13页
前言第14-22页
第一章 UHRF2过表达细胞的蛋白质组学鉴定第22-39页
    1.1 研究背景第22-23页
    1.2 材料与方法第23-28页
        1.2.1 分子克隆第23-24页
        1.2.2 慢病毒包装及感染第24页
        1.2.3 UHRF2过表达稳定株的构建第24-28页
    1.3 结果与讨论第28-38页
        1.3.1 MKN74稳定细胞系过表达水平的检测第28-29页
        1.3.2 质谱profiling数据的质控第29-30页
        1.3.3 Profiling数据基本情况及差异表达蛋白的筛选和谱图验证第30-33页
        1.3.4 差异表达蛋白的PRM验证及WB验证第33-35页
        1.3.5 差异蛋白的GO分析结果第35-36页
        1.3.6 差异蛋白与肿瘤疾病相关第36-37页
        1.3.7 差异蛋白相互作用网络第37-38页
    1.4 小结第38-39页
第二章 UHRF2过表达诱导的转录因子活性变化的检测第39-49页
    2.1 研究背景第39-40页
    2.2 材料与方法第40-42页
        2.2.1 细胞培养第40页
        2.2.2 cat TFRE DNA的扩增第40页
        2.2.3 核蛋白提取第40页
        2.2.4 TFRE pull down第40-41页
        2.2.5 胶内酶解第41页
        2.2.6 TFRE数据分析第41-42页
    2.3 结果与讨论第42-48页
        2.3.1 TFRE数据转录因子鉴定情况第42-43页
        2.3.2 转录因子富集效率第43-44页
        2.3.3 UHRF2过表达激活EMT相关转录因子第44-46页
        2.3.4 激活转录因子的相互作用网络第46-47页
        2.3.5 转录因子-靶基因综合分析第47-48页
    2.4 小结第48-49页
第三章 UHRF2敲除抑制胃癌细胞转移及侵袭第49-59页
    3.1 研究背景第49-50页
    3.2 材料与方法第50-52页
        3.2.1 Crispr-cas敲除及单克隆筛选第50页
        3.2.2 细胞迁移及侵袭实验第50页
        3.2.3 免疫荧光第50-51页
        3.2.4 细胞增殖检测第51页
        3.2.5 细胞周期检测第51页
        3.2.6 细胞药敏检测第51-52页
    3.3 结果与讨论第52-58页
        3.3.1 UHRF2在临床胃癌样本中表达量升高第52-53页
        3.3.2 UHRF2缺失抑制细胞转移和侵袭第53-55页
        3.3.3 UHRF2敲除诱导细胞形态变化第55-56页
        3.3.4 UHRF2过表达不影响细胞增殖第56页
        3.3.5 UHRF2过表达引起细胞周期阻滞第56-57页
        3.3.6 UHRF2过表达不影响细胞药物敏感性第57-58页
        3.3.7 UHRF2扰动诱导ERK激酶活性变化第58页
    3.4 小结第58-59页
第四章 UHRF2与CDH1 PROMOTER区结合并抑制其RNA表达第59-66页
    4.1 研究背景第59页
    4.2 材料与方法第59-63页
        4.2.1 Ch IP第59-60页
        4.2.2 Ch IP-seq数据分析第60页
        4.2.3 Ch IP-q PCR第60页
        4.2.4 RNA提取第60-61页
        4.2.5 RNA逆转录第61页
        4.2.6 实时定量PCR第61-63页
    4.3 结果与讨论第63-65页
        4.3.1 UHRF2结合的DNA序列分析第63页
        4.3.2 UHRF2偏好结合motif结果第63-64页
        4.3.3 UHRF2结合CDH1启动子区域并抑制其表达第64-65页
    4.4 小结第65-66页
第五章 UHRF2相互作用蛋白网络的鉴定第66-72页
    5.1 研究背景第66页
    5.2 材料与方法第66-68页
        5.2.1 蛋白表达及纯化第66-67页
        5.2.2 抗体纯化第67页
        5.2.3 IP第67页
        5.2.4 生物信息学分析第67-68页
    5.3 结果与讨论第68-71页
        5.3.1 UHRF2相互作用蛋白列表第68-70页
        5.3.2 UHRF2相互作用蛋白的GO分类第70-71页
        5.3.3 UHRF2相互作用蛋白网络第71页
    5.4 小结第71-72页
讨论第72-74页
结论第74-76页
    1. 本论文获得的主要结论第74-75页
    2. 本论文的创新点第75-76页
参考文献第76-82页
附录第82-86页
其他工作第86-88页
个人简历第88-89页
致谢第89-90页

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