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拟南芥转录因子FHY3全基因组绑定位点分析及参与叶绿体分裂的调控机制

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-11页
缩写词第11-13页
第一章 文献综述第13-35页
 1 起源于转座子酶的转录因子FHY3和FAR1第13-14页
   ·Mutator转座子(Mu)和Mu-like元件(MULEs)第13页
   ·FHY3和FAR1起源于MULEs家族的转录因子第13-14页
 2 FHY3参与光敏色素A信号通路第14-20页
   ·植物的光敏色素的发现第14-15页
   ·光敏色素的结构及功能第15-16页
   ·光敏色素A的信号转导第16-19页
   ·光敏色素A信号通路及相关基因第19-20页
 3 FHY3参与生物节律的调控第20-23页
   ·生物节律第20页
   ·光信号输入及生物钟的重要元件第20-22页
   ·FHY3调控生物钟通过直接的调节ELF4的转录第22-23页
 4 叶绿体发育第23-33页
   ·光和叶绿体的发育第23-24页
   ·前质体到叶绿体的转化第24-30页
   ·叶绿体对细胞核的信号反馈第30-33页
 5 本论文的研究背景,目的和意义第33-35页
第二章 材料与方法第35-49页
 1 材料第35-36页
   ·植物材料第35页
   ·抗体第35页
   ·载体第35页
   ·菌株第35-36页
 2 实验方法第36-49页
   ·植物培养第36页
   ·农杆菌浸泡法转化拟南芥第36-38页
   ·植物总蛋白的提取第38-39页
   ·蛋白免疫印迹分析(Western Blot)第39-40页
   ·酵母单杂交第40-41页
   ·GST融合蛋白的表达与纯化第41-42页
   ·电泳迁移率变动分析(EMSA)第42-43页
   ·染色体免疫共沉淀技术(ChIP)第43-46页
   ·高通量测序建库及相关数据分析第46-47页
   ·植物总RNA提取与定量RT-PRC第47页
   ·Affymetrix芯片及相关数据分析第47-48页
   ·顺式元件搜索和基因本体论分析第48页
   ·叶绿体分裂性状观察第48-49页
第三章 实验结果第49-74页
 1 全基因组鉴定FHY3绑定位点第49-52页
 2 启动子以及基因body区域的FHY3顺式作用元件分析第52-54页
 3 基因间区的FHY3顺式作用元件分析第54-56页
 4 芯片结果显示出FHY3直接控制的靶基因第56-64页
 5 FHY3靶基因的基因本体分析(GO;Gene Ontology)第64-66页
 6 FHY3和HY5以及PIL5共同控制下游靶基因第66-69页
 7 FHY3参与叶绿体分裂的控制通过直接的激活ARC5的转录第69-74页
第四章 讨论与展望第74-78页
 1 基因组广泛的分析FHY3的直接靶基因第74-75页
 2 FHY3的控制模式第75-76页
 3 FHY3绑定两个新颖的顺式元件在178bp的着丝粒重复第76页
 4 FHY3在叶绿体的分裂中扮演重要的角色第76-78页
参考文献第78-88页
博士期间论文发表情况第88-89页
致谢第89-90页

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