| 摘要 | 第5-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 1.文献综述 | 第10-31页 |
| 1.1 甜叶菊 | 第10-14页 |
| 1.1.1 甜叶菊简述 | 第10页 |
| 1.1.2 甜叶菊糖甙 | 第10-11页 |
| 1.1.3 甜菊糖的特点 | 第11-12页 |
| 1.1.4 甜叶菊的发展历史 | 第12-13页 |
| 1.1.5 甜叶菊遗传研究进展 | 第13-14页 |
| 1.2 遗传图谱 | 第14-19页 |
| 1.2.1 遗传图谱概述 | 第14页 |
| 1.2.2 遗传图谱的理论基础 | 第14-15页 |
| 1.2.3 遗传图谱的作图群体 | 第15页 |
| 1.2.4 分子标记遗传连锁图谱的构建 | 第15-16页 |
| 1.2.5 分子标记遗传连锁图谱的研究进展和应用 | 第16-19页 |
| 1.2.5.1 数量性状位点(QTL)定位 | 第17-18页 |
| 1.2.5.2 分子标记辅助选择育种(MAS) | 第18页 |
| 1.2.5.3 图位克隆 | 第18-19页 |
| 1.2.5.4 比较基因组研究 | 第19页 |
| 1.3 遗传标记 | 第19-24页 |
| 1.3.1 遗传标记概述 | 第19-20页 |
| 1.3.2 主要分子标记类型 | 第20-24页 |
| 1.3.2.1 简单重复序列 | 第20-22页 |
| 1.3.2.1.1 SSR在遗传多样性中的应用 | 第20-21页 |
| 1.3.2.1.2 SSR在基因定位中的应用 | 第21页 |
| 1.3.2.1.3 SSR在分子标记辅助选择中的应用 | 第21-22页 |
| 1.3.2.2 单核苷酸多态性 | 第22-23页 |
| 1.3.2.2.1 SNP标记在构建高密度遗传图谱上的应用 | 第22-23页 |
| 1.3.2.2.2 SNP标记在QTL上的应用 | 第23页 |
| 1.3.2.2.3 开发与植物性状相关的SNP标记 | 第23页 |
| 1.3.2.3 InDel标记 | 第23-24页 |
| 1.4 测序技术 | 第24-31页 |
| 1.4.1 第一代测序技术 | 第24-26页 |
| 1.4.1.1 测序出现的背景 | 第24-25页 |
| 1.4.1.2 第一代测序技术中的技术改进 | 第25-26页 |
| 1.4.2 第二代测序技术 | 第26-28页 |
| 1.4.2.1 Roche公司的454技术 | 第26-27页 |
| 1.4.2.2 Illumina公司的Solexa技术 | 第27页 |
| 1.4.2.3 ABI公司的SOLiD技术 | 第27页 |
| 1.4.2.4 IonTorrent | 第27-28页 |
| 1.4.3 第三代测序技术 | 第28页 |
| 1.4.4 RAD-seq技术 | 第28-31页 |
| 1.4.4.1 RAD-seq技术在构建遗传图谱上的应用 | 第29-30页 |
| 1.4.4.2 RAD-seq技术在分子标记开发上的应用 | 第30页 |
| 1.4.4.3 RAD-seq技术在植物育种中的应用 | 第30页 |
| 1.4.4.4 RAD-seq技术在动植物性状QTL定位上的应用 | 第30-31页 |
| 1.5 研究目的及意义 | 第31页 |
| 2.材料与方法 | 第31-33页 |
| 2.1 材料 | 第31-32页 |
| 2.1.1 作图群体 | 第31页 |
| 2.1.2 仪器与试剂 | 第31-32页 |
| 2.2 实验方法 | 第32-33页 |
| 2.2.1 DNA提取 | 第32页 |
| 2.2.2 文库构建及测序 | 第32-33页 |
| 3.结果 | 第33-52页 |
| 3.1 测序数据统计及质量评估 | 第33-35页 |
| 3.2 RADTag统计 | 第35页 |
| 3.3 亲本聚类组装 | 第35-36页 |
| 3.3.1 聚类 | 第35-36页 |
| 3.3.2 组装 | 第36页 |
| 3.4 比对 | 第36-38页 |
| 3.4.1 Reads与参考基因组比对 | 第36-37页 |
| 3.4.2 比对结果小结 | 第37-38页 |
| 3.5 群体SNP检测 | 第38页 |
| 3.5.1 SNP检测结果展示 | 第38页 |
| 3.6 SNP标记开发 | 第38-41页 |
| 3.6.1 亲本间标记开发 | 第38-40页 |
| 3.6.2 子代基因分型 | 第40页 |
| 3.6.3 遗传标记筛选 | 第40-41页 |
| 3.7 遗传图谱构建 | 第41-52页 |
| 3.7.1 连锁群构建 | 第41页 |
| 3.7.2 遗传图谱 | 第41-52页 |
| 3.7.2.1 父本图谱(nn×np) | 第41-45页 |
| 3.7.2.2 母本图谱(lm×ll) | 第45-48页 |
| 3.7.2.3 整合图谱 | 第48-51页 |
| 3.7.2.4 相邻标记间连锁关系的热图分析 | 第51-52页 |
| 4.讨论 | 第52-55页 |
| 4.1 提高采集甜叶菊叶片DNA质量的细节 | 第52-53页 |
| 4.2 高通量测序技术在种质资源和育种中的应用 | 第53页 |
| 4.3 运用RAD-seq技术构建遗传图谱的可行性分析 | 第53-54页 |
| 4.4 遗传距离与杂种优势 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-63页 |
| 个人简介 | 第63-64页 |
| 致谢 | 第64页 |
