| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7页 |
| 英文缩略表 | 第13-14页 |
| 第一章 引言 | 第14-23页 |
| 1.1 高通量测序研究 | 第14-17页 |
| 1.1.1 高通量测序技术简介 | 第14-15页 |
| 1.1.2 转录组测序研究 | 第15-17页 |
| 1.2 SSR标记研究进展 | 第17-20页 |
| 1.2.1 SSR标记 | 第17-18页 |
| 1.2.2 SSR标记开发进展 | 第18-20页 |
| 1.3 茄子SSR标记应用进展 | 第20-21页 |
| 1.3.1 鉴定品种纯度 | 第20页 |
| 1.3.2 构建连锁图谱 | 第20-21页 |
| 1.3.3 在抗病育种中的应用 | 第21页 |
| 1.3.4 种质资源鉴定及遗传多样性分析 | 第21页 |
| 1.4 研究目的及意义 | 第21-22页 |
| 1.5 主要的研究内容 | 第22页 |
| 1.6 技术路线 | 第22-23页 |
| 第二章 茄子转录组测序及生物信息学分析 | 第23-31页 |
| 2.1 测序材料 | 第23页 |
| 2.2 试验方法 | 第23-26页 |
| 2.2.1 RNA提取及检测 | 第23页 |
| 2.2.2 mRNA文库构建及上机测序 | 第23-24页 |
| 2.2.3 数据生物信息学分析 | 第24-26页 |
| 2.3 结果分析 | 第26-29页 |
| 2.3.1 RNA提取及检测 | 第26-27页 |
| 2.3.2 测序原始数据统计分析 | 第27-28页 |
| 2.3.3 数据拼接及统计 | 第28页 |
| 2.3.4 数据生物信息学分析 | 第28-29页 |
| 2.4 讨论 | 第29-31页 |
| 2.4.1 转录组测序及拼接 | 第29-30页 |
| 2.4.2 基因功能注释 | 第30-31页 |
| 第三章 茄子SSR标记开发 | 第31-38页 |
| 3.0 标记开发数据来源 | 第31页 |
| 3.1 引物初筛植物材料 | 第31页 |
| 3.2 试验仪器 | 第31页 |
| 3.3 试验试剂 | 第31页 |
| 3.4 试验方法 | 第31-33页 |
| 3.4.1 SSR位点搜索 | 第31页 |
| 3.4.2 SSR引物设计 | 第31页 |
| 3.4.3 与茄子已有SSR引物比对 | 第31-32页 |
| 3.4.4 DNA提取 | 第32页 |
| 3.4.5 PCR扩增和电泳检测 | 第32-33页 |
| 3.5 结果与分析 | 第33-36页 |
| 3.5.1 茄子SSR位点的数量及重复类型分布特点 | 第33-34页 |
| 3.5.2 茄子SSR位点重复单元及频率 | 第34-35页 |
| 3.5.3 SSR引物设计 | 第35页 |
| 3.5.4 SSR引物重复比对 | 第35页 |
| 3.5.5 SSR引物初筛 | 第35-36页 |
| 3.6 讨论 | 第36-38页 |
| 3.6.1 SSR引物设计 | 第36-37页 |
| 3.6.2 SSR引物重复比对 | 第37页 |
| 3.6.3 SSR引物初筛 | 第37-38页 |
| 第四章 茄子SSR标记遗传多样性分析 | 第38-51页 |
| 4.1 试验材料 | 第38-39页 |
| 4.2 试验仪器 | 第39页 |
| 4.3 试验试剂 | 第39页 |
| 4.4 试验方法 | 第39-40页 |
| 4.4.1 表型性状调查 | 第39-40页 |
| 4.4.2 基因组DNA提取 | 第40页 |
| 4.4.3 引物来源 | 第40页 |
| 4.4.4 PCR扩增及聚丙烯凝胶检测 | 第40页 |
| 4.4.5 数据分析 | 第40页 |
| 4.5 结果与分析 | 第40-49页 |
| 4.5.1 茄子表型性状多样性基本统计分析 | 第40-41页 |
| 4.5.2 基于表型性状的聚类分析 | 第41-42页 |
| 4.5.3 引物多态性分析 | 第42-46页 |
| 4.5.4 聚类分析 | 第46-47页 |
| 4.5.5 群体结构分析 | 第47-49页 |
| 4.6 讨论 | 第49-51页 |
| 4.6.1 基于表型的聚类分析 | 第49页 |
| 4.6.2 基于SSR标记的聚类分析 | 第49页 |
| 4.6.3 表型性状与SSR标记遗传多样性比较 | 第49-51页 |
| 第五章 全文结论 | 第51-52页 |
| 参考文献 | 第52-57页 |
| 附录I | 第57页 |
| 附录Ⅱ | 第57-66页 |
| 附录Ⅲ | 第66-67页 |
| 附录Ⅳ | 第67-68页 |
| 附录Ⅴ | 第68-87页 |
| 致谢 | 第87-88页 |
| 作者简历 | 第88页 |