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针茅属植物水孔蛋白基因多态性分析及分子进化的研究

摘要第3-4页
Abstract第4页
1 引言第11-22页
    1 针茅属植物简介第11页
        1.1 针茅属植物的分类及地理分布第11页
        1.2 针茅属植物的研究状况第11页
    2 水孔蛋白的研究进展第11-16页
        2.1 水孔蛋白的发现第11-12页
        2.2 水孔蛋白的结构和透水机制第12-14页
        2.3 植物水孔蛋白的分类第14页
        2.4 水孔蛋白在植物中的存在部位第14页
        2.5 植物水孔蛋白的功能调节及对干旱的响应第14-16页
    3 生物进化理论研究的进展第16-18页
        3.1 分子生态学的产生与发展第16页
        3.2 分子生态学研究范畴第16-17页
        3.3 分子进化学说的发展第17-18页
    4 植物的单核昔酸多态性及其在作物遗传育种中的应用第18-21页
        4.1 单核昔酸多态性及其优点第18-19页
        4.2 植物目的性状相关SNP 的发现第19页
        4.3 SNP 在作物遗传育种上的应用第19-21页
        4.4 SNP 应用于进化和种群多样性的研究第21页
    5 PCR-SSCP 技术的原理第21-22页
    6 本研究的目的和意义第22页
2 材料与方法第22-30页
    1 实验材料第22-24页
        1.1 材料来源第22页
        1.2 仪器设备第22-23页
        1.3 主要试剂及溶液配制第23-24页
    2 实验方法第24-30页
        2.1 叶片的采集与处理第24页
        2.2 基因组DNA的提取(CTAB法)第24-25页
        2.3 DNA 检测第25页
        2.4 PCR 反应第25-26页
        2.5 克隆与测序第26-29页
        2.6 PCR-SSCP 分析第29-30页
    3 数据分析方法第30页
        3.1 序列分析第30页
        3.2 进化树分析第30页
3 结果与分析第30-56页
    1 针茅属植物水孔蛋白基因序列的扩增与鉴定第30-34页
        1.1 基因组DNA 的提取与检测结果第30页
        1.2 PCR 扩增及纯化结果第30-31页
        1.3 针茅属AQP 基因的克隆及鉴定结果第31-34页
    2 针茅属植物AQP 基因序列的分析第34-40页
        2.1 针茅属植物及其它物种AQP 基因序列的一级结构分析第34-36页
        2.2 AQP 基因序列的核苷酸多态位点变异第36页
        2.3 不同物种间AQP 基因序列的转换与颠换分析第36-37页
        2.4 AQP 基因核苷酸组成分析第37-38页
        2.5 AQP 基因密码子核苷酸组成分析第38-39页
        2.6 核苷酸变异模型分析第39-40页
    3 AQP 基因外显子氨基酸序列分析第40-47页
        3.1 氨基酸组成与含量分析第40-42页
        3.2 密码子使用频率与偏倚性分析第42-47页
        3.3 氨基酸序列的进化分析第47页
    4 AQP 基因分子系统发育分析第47-49页
    5 针茅属植物AQP 基因多态性分析第49-56页
        5.1 AQP 基因第一外显子PCR-SSCP 分析第49-52页
        5.2 AQP 基因第一内含子PCR-SSCP 分析第52-53页
        5.3 各位点基因型频率和等位基因频率分析第53-56页
4 讨论第56-59页
    1 PCR-SSCP 分析的影响因素第56页
        1.1 PCR 产物的大小第56页
        1.2 聚丙烯凝胶浓度第56页
        1.3 变性温度与时间第56页
    2 SSCP 基因型的确定第56-57页
    3 针茅属植物AQP 基因序列结构、组成特点第57页
    4 密码子的偏好性第57页
    5 AQP 基因进化树分析第57-59页
    6 针茅属植物不同物种水孔蛋白基因的多态性第59页
5 结论第59-61页
致谢第61-62页
参考文献第62-67页
附录第67-78页
作者简介第78页

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