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第29次南极考察队员肠道菌群研究与红景天小RNA测序数据的分析

中文摘要第8-10页
ABSTRACT第10-11页
英文略语表第12-14页
第一部分 第29次南极考察队员肠道菌群研究第14-49页
    前言第15-16页
    1. 研究对象及实验流程第16-18页
        1.1. 研究对象第16页
        1.2. 实验流程第16-18页
    2. 实验材料及方法第18-30页
        2.1. 实验数据收集第18-21页
            2.1.1. 人口学指标采集第18页
            2.1.2. 生理指标检测第18-20页
                2.1.2.1. 检测的生理指标项目第18-19页
                2.1.2.2. 主要实验材料第19页
                2.1.2.3. 实验方法第19-20页
            2.1.3. 粪便样本采集及16S rDNA测序方法第20-21页
                2.1.3.1. 粪便样本的采集第20页
                2.1.3.2. DNA提取第20页
                2.1.3.3. 细菌16S rDNA基因V4区域的PCR扩增和Illumina测序第20-21页
        2.2. 实验数据分析第21-30页
            2.2.1. 16S rDNA测序数据的分析第21-28页
                2.2.1.1. 16S rDNA测序数据分析软件第21页
                2.2.1.2. 16S rDNA测序数据分析过程第21-28页
            2.2.2. 实验数据统计分析第28-30页
                2.2.2.1. 统计分析作图软件第28页
                2.2.2.2. 统计分析方法第28-30页
    3. 实验结果第30-46页
        3.1. 研究对象人口统计学指标统计结果第30-31页
        3.2. 研究对象生理指标检测及分析结果第31-34页
        3.3. 物种注释及物种丰度聚类结果第34-39页
        3.4. Alpha多样性分析结果第39-42页
        3.5. Beta多样性分析结果第42-43页
        3.6. 菌群变化与炎症因子变化相关性分析第43-46页
    4. 结论第46-47页
    5. 讨论第47-49页
第二部分 红景天小RNA测序数据分析第49-77页
    前言第50-51页
    1. 样品采集及实验流程第51-54页
        1.1. 样品采集第51页
        1.2. 研究流程第51-54页
    2. 实验材料及方法第54-65页
        2.1. 实验数据收集第54-55页
        2.2. 实验数据分析第55-65页
            2.2.1. 小RNA测序数据预处理第55-56页
                2.2.1.1. 小RNA测序数据预处理软件第55页
                2.2.1.2. 小RNA测序数据预处理过程第55-56页
            2.2.2. 小RNA测序数据预处理后的序列筛选第56-65页
                2.2.2.1. 小RNA测序数据预处理后的序列筛选软件第56页
                2.2.2.2. 各样本小RNA unique序列的提取过程第56-57页
                2.2.2.3. 各样本间小RNA序列比对及筛选过程第57-62页
                2.2.2.4. 各样本小RNA序列与数据库比对及筛选过程第62-63页
                2.2.2.5. 各组小RNA序列筛选结果统计及表达量计算第63-65页
    3. 实验结果第65-74页
        3.1. 各样本数据预处理结果第65页
        3.2. 各样本间小RNA序列比对及筛选结果第65-67页
        3.3. 各组小RNA序列与数据库比对及筛选结果第67-68页
        3.4. 各组小RNA序列筛选结果统计及表达量计算结果第68-74页
    4. 结论第74-75页
    5. 讨论第75-77页
参考文献第77-81页
致谢第81-83页
个人简历第83-85页

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