中文摘要 | 第8-10页 |
ABSTRACT | 第10-11页 |
英文略语表 | 第12-14页 |
第一部分 第29次南极考察队员肠道菌群研究 | 第14-49页 |
前言 | 第15-16页 |
1. 研究对象及实验流程 | 第16-18页 |
1.1. 研究对象 | 第16页 |
1.2. 实验流程 | 第16-18页 |
2. 实验材料及方法 | 第18-30页 |
2.1. 实验数据收集 | 第18-21页 |
2.1.1. 人口学指标采集 | 第18页 |
2.1.2. 生理指标检测 | 第18-20页 |
2.1.2.1. 检测的生理指标项目 | 第18-19页 |
2.1.2.2. 主要实验材料 | 第19页 |
2.1.2.3. 实验方法 | 第19-20页 |
2.1.3. 粪便样本采集及16S rDNA测序方法 | 第20-21页 |
2.1.3.1. 粪便样本的采集 | 第20页 |
2.1.3.2. DNA提取 | 第20页 |
2.1.3.3. 细菌16S rDNA基因V4区域的PCR扩增和Illumina测序 | 第20-21页 |
2.2. 实验数据分析 | 第21-30页 |
2.2.1. 16S rDNA测序数据的分析 | 第21-28页 |
2.2.1.1. 16S rDNA测序数据分析软件 | 第21页 |
2.2.1.2. 16S rDNA测序数据分析过程 | 第21-28页 |
2.2.2. 实验数据统计分析 | 第28-30页 |
2.2.2.1. 统计分析作图软件 | 第28页 |
2.2.2.2. 统计分析方法 | 第28-30页 |
3. 实验结果 | 第30-46页 |
3.1. 研究对象人口统计学指标统计结果 | 第30-31页 |
3.2. 研究对象生理指标检测及分析结果 | 第31-34页 |
3.3. 物种注释及物种丰度聚类结果 | 第34-39页 |
3.4. Alpha多样性分析结果 | 第39-42页 |
3.5. Beta多样性分析结果 | 第42-43页 |
3.6. 菌群变化与炎症因子变化相关性分析 | 第43-46页 |
4. 结论 | 第46-47页 |
5. 讨论 | 第47-49页 |
第二部分 红景天小RNA测序数据分析 | 第49-77页 |
前言 | 第50-51页 |
1. 样品采集及实验流程 | 第51-54页 |
1.1. 样品采集 | 第51页 |
1.2. 研究流程 | 第51-54页 |
2. 实验材料及方法 | 第54-65页 |
2.1. 实验数据收集 | 第54-55页 |
2.2. 实验数据分析 | 第55-65页 |
2.2.1. 小RNA测序数据预处理 | 第55-56页 |
2.2.1.1. 小RNA测序数据预处理软件 | 第55页 |
2.2.1.2. 小RNA测序数据预处理过程 | 第55-56页 |
2.2.2. 小RNA测序数据预处理后的序列筛选 | 第56-65页 |
2.2.2.1. 小RNA测序数据预处理后的序列筛选软件 | 第56页 |
2.2.2.2. 各样本小RNA unique序列的提取过程 | 第56-57页 |
2.2.2.3. 各样本间小RNA序列比对及筛选过程 | 第57-62页 |
2.2.2.4. 各样本小RNA序列与数据库比对及筛选过程 | 第62-63页 |
2.2.2.5. 各组小RNA序列筛选结果统计及表达量计算 | 第63-65页 |
3. 实验结果 | 第65-74页 |
3.1. 各样本数据预处理结果 | 第65页 |
3.2. 各样本间小RNA序列比对及筛选结果 | 第65-67页 |
3.3. 各组小RNA序列与数据库比对及筛选结果 | 第67-68页 |
3.4. 各组小RNA序列筛选结果统计及表达量计算结果 | 第68-74页 |
4. 结论 | 第74-75页 |
5. 讨论 | 第75-77页 |
参考文献 | 第77-81页 |
致谢 | 第81-83页 |
个人简历 | 第83-85页 |