| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 缩写词表 | 第8-12页 |
| 引言 | 第12-30页 |
| 1. 卵菌基因组学研究现状 | 第12-20页 |
| 1.1 比较基因组学与分子进化 | 第13-17页 |
| 1.1.1 基因重复与基因家族 | 第13-14页 |
| 1.1.2 卵菌比较基因组学研究进展 | 第14-15页 |
| 1.1.3 卵菌的分子进化研究 | 第15-16页 |
| 1.1.4 卵菌相关数据库资源 | 第16-17页 |
| 1.2 卵菌功能基因组学研究 | 第17-20页 |
| 1.2.1 卵菌转录组学研究 | 第17-19页 |
| 1.2.2 蛋白质组学研究 | 第19-20页 |
| 1.2.3 卵菌基因功能研究的方法 | 第20页 |
| 2. 卵菌效应蛋白的研究现状 | 第20-25页 |
| 2.1 质外体效应分子 | 第22-24页 |
| 2.1.1 酶抑制剂 | 第22页 |
| 2.1.2 富含半胱氨酸的小蛋白 | 第22-23页 |
| 2.1.3 Nep1-like (NLP)家族 | 第23-24页 |
| 2.2 胞质效应分子 | 第24-25页 |
| 2.2.1 RXLR Protein Family | 第24页 |
| 2.2.2 CRN Protein Family（皱缩坏死蛋白家族） | 第24-25页 |
| 3. NLP 和 PcF 效应蛋白的研究 | 第25-29页 |
| 3.1 NLP 蛋白的研究现状 | 第25-28页 |
| 3.1.1 NLP 蛋白的发现 | 第25页 |
| 3.1.2 NLP 蛋白结构的研究 | 第25-26页 |
| 3.1.3 NLP 蛋白功能的研究 | 第26-28页 |
| 3.2 PcF 蛋白的研究现状 | 第28-29页 |
| 3.2.1 PcF 效应蛋白的发现 | 第28页 |
| 3.2.2 PcF 蛋白结构的研究 | 第28-29页 |
| 3.2.3 PcF 蛋白功能的研究 | 第29页 |
| 4. 本论文的研究内容及意义 | 第29-30页 |
| 第一章 致病疫霉基因家族 NPP1-like 和 PcF/SCR-like 系统发育分析 | 第30-43页 |
| 1. 材料与方法 | 第31-32页 |
| 1.1 数据检索与收集 | 第31页 |
| 1.2 基因簇的分析 | 第31页 |
| 1.3 基因家族基因结构分析 | 第31页 |
| 1.4 信号肽预测 | 第31-32页 |
| 1.5 序列比对及系统发育分析 | 第32页 |
| 1.6 功能研究选取基因的原则 | 第32页 |
| 2. 结果与分析 | 第32-42页 |
| 2.1 PcF/SCR-like 和 NPP1-like 家族中基因簇的确定 | 第32-33页 |
| 2.2 致病疫霉 PcF/SCR-like 和 NPP1-like 家族基因结构及信号肽分析 | 第33-36页 |
| 2.3 PcF/SCR-like 和 NPP1-like 家族系统发育分析 | 第36-39页 |
| 2.4 功能研究选取基因 | 第39-42页 |
| 3. 本章小结 | 第42-43页 |
| 第二章 致病疫霉基因家族 NPP1-like 部分基因功能的研究 | 第43-67页 |
| 1. 材料与方法 | 第43-53页 |
| 1.1 材料 | 第43-44页 |
| 1.1.1 供试菌株及质粒 | 第43页 |
| 1.1.2 酶和生化试剂 | 第43页 |
| 1.1.3 仪器 | 第43-44页 |
| 1.1.4 培养基 | 第44页 |
| 1.1.5 缓冲液的配置 | 第44页 |
| 1.2 方法 | 第44-53页 |
| 1.2.1 NPP1-like 家族基因的克隆 | 第44-47页 |
| 1.2.2 NPP1-like 家族基因在烟草中的瞬时表达 | 第47-49页 |
| 1.2.3 基因 PiNLP17 活性位点的突变 | 第49-51页 |
| 1.2.4 NPP1-like 家族基因在病原寄主互作过程中表达模式分析 | 第51-53页 |
| 2. 结果与分析 | 第53-66页 |
| 2.1 NPP1-like 家族基因的克隆 | 第53-57页 |
| 2.1.1 NPP1-like 部分基因克隆及测序结果 | 第53-54页 |
| 2.1.2 克隆比对差异序列的分析 | 第54-57页 |
| 2.2 NPP1-like 家族基因在烟草体内的瞬时表达 | 第57-59页 |
| 2.2.1 NPP1-like 家族基因真核表达载体构的建及农杆菌转化 | 第58页 |
| 2.2.2 NPP1-like 家族基因重组质粒在烟草体内的瞬时表达 | 第58-59页 |
| 2.3 NPP1-like 基因 PiNLP17 的体外突变 | 第59-63页 |
| 2.3.1 基因 PiNLP17 活性位点的突变 | 第59-61页 |
| 2.3.2 基因 PiNLP17 活性位点突变后在烟草体内的瞬时表达 | 第61-63页 |
| 2.4 NPP1-like 家族基因在致病疫霉与寄主互作中表达模式的分析 | 第63-66页 |
| 2.4.1 致病疫霉接种离体马铃薯叶片不同时间的症状 | 第63页 |
| 2.4.2 NPP1-like 基因荧光定量 PCR 溶解曲线和标准曲线的分析 | 第63-64页 |
| 2.4.3 致病疫霉侵染马铃薯后不同时期基因表达量的分析 | 第64-66页 |
| 3. 本章小结 | 第66-67页 |
| 第三章 致病疫霉基因家族 PcF/SCR-like 部分基因功能的研究 | 第67-79页 |
| 1. 材料与方法 | 第67-71页 |
| 1.1 材料 | 第67页 |
| 1.2 方法 | 第67-71页 |
| 1.2.1 PcF/SCR-like 家族部分基因的克隆 | 第67-68页 |
| 1.2.2 PcF/SCR-like 家族基因在烟草中的瞬时表达 | 第68页 |
| 1.2.3 PcF/SCR-like 家族基因 PcF/SCR.1 二硫键的突变 | 第68-70页 |
| 1.2.4 PcF/SCR-like 家族基因在病原寄主互作过程中表达模式分析 | 第70-71页 |
| 2. 结果与分析 | 第71-78页 |
| 2.1 PcF/SCR-like 家族基因的克隆 | 第71页 |
| 2.2 PcF/SCR-like 家族基因在烟草体内的瞬时表达 | 第71-73页 |
| 2.2.1 PcF/SCR-like 家族基因 pBI121 载体构建及农杆菌转化 | 第71-72页 |
| 2.2.2 PcF/SCR-lik 家族基因重组质粒在烟草体内的瞬时表达 | 第72-73页 |
| 2.3 PcF/SCR-like 家族保守二硫键的位点突变 | 第73-77页 |
| 2.3.1 基因 PcF/SCR.1 活性位点的突变 | 第73-75页 |
| 2.3.2 基因 PcF/SCR.1 活性位点突变后在烟草体内的瞬时表达 | 第75-77页 |
| 2.4 致病疫霉侵染马铃薯后不同时期 PcF/SCR-like 基因表达模式的分析 | 第77-78页 |
| 2.4.1 PcF/SCR-like 基因荧光定量 PCR 溶解曲线和标准曲线的分析 | 第77页 |
| 2.4.2 致病疫霉侵染马铃薯后不同时期基因表达量的分析 | 第77-78页 |
| 3. 本章小结 | 第78-79页 |
| 本文讨论 | 第79-86页 |
| 1. PcF/SCR-like 与 NPP1-like 家族进化分析 | 第79-80页 |
| 2. 克隆基因序列的改变 | 第80-81页 |
| 3. 烟草体内瞬时表达症状的差异 | 第81-82页 |
| 4. 活性位点在基因致坏死功能中的作用 | 第82-83页 |
| 5. 坏死基因在病原物与寄主互作中表达模式的差异 | 第83-86页 |
| 本文结论 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-97页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第97-98页 |
| 作者简历 | 第98-99页 |
| 致谢 | 第99-100页 |
| 附录 | 第100-112页 |
| 附录 1 PcF/SCR-like 家族基因序列比对 | 第100-101页 |
| 附录 2 NPP1-like 家族基因序列比对 | 第101-103页 |
| 附录 3 PiNLP17 序列比对图 | 第103-104页 |
| 附录 4 PiNLP24 序列比对图 | 第104-105页 |
| 附录 5 PiNLP29 序列比对图 | 第105-106页 |
| 附录 6 PiNLP35 序列比对图 | 第106-107页 |
| 附录 7 PiNLP36 序列比对图 | 第107-108页 |
| 附录 8 PiNLP39 序列比对图 | 第108-109页 |
| 附录 9 PcF/SCR.1 序列比对图 | 第109-110页 |
| 附录 10 PcF/SCR.6 序列比对图 | 第110页 |
| 附录 11 PcF/SCR.8 序列比对图 | 第110-111页 |
| 附录 12 PcF/SCR.10 序列比对图 | 第111-112页 |
